Protein–RNA interactions for Protein: Q12089

AEP3, ATPase expression protein 3, yeastyeast

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AEP3Q12089 NSR1YGR159C 1245 nt16.73■□□□□ 0.27
AEP3Q12089 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.5■□□□□ 0.23
AEP3Q12089 NOP1YDL014W 984 nt16.01■□□□□ 0.15
AEP3Q12089 MDJ1YFL016C 1536 nt15.59■□□□□ 0.09
AEP3Q12089 YKL036CYKL036C 393 nt14.68□□□□□ -0.06
AEP3Q12089 YJL027CYJL027C 417 nt14.32□□□□□ -0.12
AEP3Q12089 Q0297Q0297 156 nt14.05□□□□□ -0.16
AEP3Q12089 SRX1YKL086W 384 nt14.04□□□□□ -0.16
AEP3Q12089 SSA3YBL075C 1950 nt13.84□□□□□ -0.19
AEP3Q12089 YBR190WYBR190W 312 nt13.48□□□□□ -0.25
AEP3Q12089 DBP2YNL112W 1641 nt13.46□□□□□ -0.25
AEP3Q12089 SCS3YGL126W 1143 nt13.31□□□□□ -0.28
AEP3Q12089 YCR051WYCR051W 669 nt13.23□□□□□ -0.29
AEP3Q12089 RTC3YHR087W 336 nt13.17□□□□□ -0.3
AEP3Q12089 PUT4YOR348C 1884 nt12.81□□□□□ -0.36
AEP3Q12089 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.78□□□□□ -0.36
AEP3Q12089 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.78□□□□□ -0.36
AEP3Q12089 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.78□□□□□ -0.36
AEP3Q12089 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.78□□□□□ -0.36
AEP3Q12089 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.78□□□□□ -0.36
AEP3Q12089 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.78□□□□□ -0.36
AEP3Q12089 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.78□□□□□ -0.36
AEP3Q12089 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.78□□□□□ -0.36
AEP3Q12089 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.78□□□□□ -0.36
AEP3Q12089 YOL085CYOL085C 342 nt12.75□□□□□ -0.37
AEP3Q12089 RPP1BYDL130W 321 nt12.57□□□□□ -0.4
AEP3Q12089 CCC1YLR220W 969 nt12.56□□□□□ -0.4
AEP3Q12089 PKP1YIL042C 1185 nt12.52□□□□□ -0.41
AEP3Q12089 RVS167YDR388W 1449 nt12.52□□□□□ -0.41
AEP3Q12089 POA1YBR022W 534 nt12.37□□□□□ -0.43
AEP3Q12089 ARE1YCR048W 1833 nt12.35□□□□□ -0.43
AEP3Q12089 SCJ1YMR214W 1134 nt12.28□□□□□ -0.44
AEP3Q12089 BSC6YOL137W 1494 nt12.24□□□□□ -0.45
AEP3Q12089 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.22□□□□□ -0.45
AEP3Q12089 SPT5YML010W 3192 nt12.2□□□□□ -0.46
AEP3Q12089 SSA4YER103W 1929 nt12.18□□□□□ -0.46
AEP3Q12089 SAH1YER043C 1350 nt12.13□□□□□ -0.47
AEP3Q12089 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.04□□□□□ -0.48
AEP3Q12089 URN1YPR152C 1398 nt12.04□□□□□ -0.48
AEP3Q12089 PET122YER153C 765 nt12.03□□□□□ -0.48
AEP3Q12089 OPI9YLR338W 858 nt12□□□□□ -0.49
AEP3Q12089 Q0182Q0182 405 nt11.99□□□□□ -0.49
AEP3Q12089 BUD23YCR047C 828 nt11.89□□□□□ -0.51
AEP3Q12089 SHR5YOL110W 714 nt11.89□□□□□ -0.51
AEP3Q12089 ATS1YAL020C 1002 nt11.87□□□□□ -0.51
AEP3Q12089 DEP1YAL013W 1218 nt11.83□□□□□ -0.52
AEP3Q12089 SCR1SCR1 522 nt11.8□□□□□ -0.52
AEP3Q12089 BDF1YLR399C 2061 nt11.77□□□□□ -0.52
AEP3Q12089 NVJ2YPR091C 2313 nt11.71□□□□□ -0.53
AEP3Q12089 PAC11YDR488C 1602 nt11.68□□□□□ -0.54
AEP3Q12089 RPN10YHR200W 807 nt11.68□□□□□ -0.54
AEP3Q12089 FPS1YLL043W 2010 nt11.68□□□□□ -0.54
AEP3Q12089 YDJ1YNL064C 1230 nt11.67□□□□□ -0.54
AEP3Q12089 RRN5YLR141W 1092 nt11.66□□□□□ -0.54
AEP3Q12089 PUN1YLR414C 792 nt11.66□□□□□ -0.54
AEP3Q12089 PTC2YER089C 1395 nt11.65□□□□□ -0.55
AEP3Q12089 TAT1YBR069C 1860 nt11.6□□□□□ -0.55
AEP3Q12089 NAB2YGL122C 1578 nt11.59□□□□□ -0.55
AEP3Q12089 MEP2YNL142W 1500 nt11.56□□□□□ -0.56
AEP3Q12089 SSA1YAL005C 1929 nt11.55□□□□□ -0.56
AEP3Q12089 YNL208WYNL208W 600 nt11.54□□□□□ -0.56
AEP3Q12089 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.45□□□□□ -0.58
AEP3Q12089 YJR018WYJR018W 363 nt11.44□□□□□ -0.58
AEP3Q12089 DCW1YKL046C 1350 nt11.37□□□□□ -0.59
AEP3Q12089 GAR1YHR089C 618 nt11.36□□□□□ -0.59
AEP3Q12089 FIS1YIL065C 468 nt11.34□□□□□ -0.59
AEP3Q12089 RSB1YOR049C 1065 nt11.33□□□□□ -0.6
AEP3Q12089 DAL1YIR027C 1383 nt11.29□□□□□ -0.6
AEP3Q12089 FPR4YLR449W 1179 nt11.29□□□□□ -0.6
AEP3Q12089 MOT3YMR070W 1473 nt11.27□□□□□ -0.6
AEP3Q12089 YBR220CYBR220C 1683 nt11.24□□□□□ -0.61
AEP3Q12089 YPS1YLR120C 1710 nt11.24□□□□□ -0.61
AEP3Q12089 EMI2YDR516C 1503 nt11.2□□□□□ -0.62
AEP3Q12089 PHO4YFR034C 939 nt11.2□□□□□ -0.62
AEP3Q12089 YMR090WYMR090W 684 nt11.2□□□□□ -0.62
AEP3Q12089 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.19□□□□□ -0.62
AEP3Q12089 INM2YDR287W 879 nt11.12□□□□□ -0.63
AEP3Q12089 YJR120WYJR120W 351 nt11.07□□□□□ -0.64
AEP3Q12089 SDH1YKL148C 1923 nt11.06□□□□□ -0.64
AEP3Q12089 PST2YDR032C 597 nt11.06□□□□□ -0.64
AEP3Q12089 YDL221WYDL221W 552 nt11.04□□□□□ -0.64
AEP3Q12089 YDR095CYDR095C 411 nt11.04□□□□□ -0.64
AEP3Q12089 PCH2YBR186W 1695 nt11.02□□□□□ -0.64
AEP3Q12089 RPP2BYDR382W 333 nt11.01□□□□□ -0.65
AEP3Q12089 TIR1YER011W 765 nt11.01□□□□□ -0.65
AEP3Q12089 GUT2YIL155C 1950 nt10.99□□□□□ -0.65
AEP3Q12089 SEC11YIR022W 504 nt10.96□□□□□ -0.65
AEP3Q12089 CAC2YML102W 1407 nt10.93□□□□□ -0.66
AEP3Q12089 YBL100CYBL100C 315 nt10.89□□□□□ -0.67
AEP3Q12089 SCC4YER147C 1875 nt10.88□□□□□ -0.67
AEP3Q12089 PTP1YDL230W 1008 nt10.86□□□□□ -0.67
AEP3Q12089 RPP2AYOL039W 321 nt10.85□□□□□ -0.67
AEP3Q12089 SRB2YHR041C 633 nt10.78□□□□□ -0.68
AEP3Q12089 PIB2YGL023C 1908 nt10.77□□□□□ -0.69
AEP3Q12089 UME6YDR207C 2511 nt10.77□□□□□ -0.69
AEP3Q12089 IRC15YPL017C 1500 nt10.76□□□□□ -0.69
AEP3Q12089 ALF1YNL148C 765 nt10.76□□□□□ -0.69
AEP3Q12089 FUN26YAL022C 1554 nt10.73□□□□□ -0.69
AEP3Q12089 YSC84YHR016C 1407 nt10.73□□□□□ -0.69
AEP3Q12089 GIS3YLR094C 1509 nt10.72□□□□□ -0.69
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