Protein–RNA interactions for Protein: P53879

RHO5, GTP-binding protein RHO5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RHO5P53879 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.62■□□□□ 0.57
RHO5P53879 NSR1YGR159C 1245 nt18.48■□□□□ 0.55
RHO5P53879 NOP1YDL014W 984 nt18.12■□□□□ 0.49
RHO5P53879 YKL036CYKL036C 393 nt16.67■□□□□ 0.26
RHO5P53879 MDJ1YFL016C 1536 nt16.42■□□□□ 0.22
RHO5P53879 Q0297Q0297 156 nt15.8■□□□□ 0.12
RHO5P53879 SRX1YKL086W 384 nt15.78■□□□□ 0.12
RHO5P53879 YJL027CYJL027C 417 nt15.59■□□□□ 0.09
RHO5P53879 SCS3YGL126W 1143 nt15.14■□□□□ 0.01
RHO5P53879 YCR051WYCR051W 669 nt15.02■□□□□ -0
RHO5P53879 DBP2YNL112W 1641 nt14.47□□□□□ -0.09
RHO5P53879 YOL085CYOL085C 342 nt14.42□□□□□ -0.1
RHO5P53879 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.26□□□□□ -0.13
RHO5P53879 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.26□□□□□ -0.13
RHO5P53879 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.26□□□□□ -0.13
RHO5P53879 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.26□□□□□ -0.13
RHO5P53879 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.26□□□□□ -0.13
RHO5P53879 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.26□□□□□ -0.13
RHO5P53879 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.26□□□□□ -0.13
RHO5P53879 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.26□□□□□ -0.13
RHO5P53879 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.26□□□□□ -0.13
RHO5P53879 PKP1YIL042C 1185 nt14.22□□□□□ -0.13
RHO5P53879 RPP1BYDL130W 321 nt14.19□□□□□ -0.14
RHO5P53879 CCC1YLR220W 969 nt14.17□□□□□ -0.14
RHO5P53879 YBR190WYBR190W 312 nt14.01□□□□□ -0.17
RHO5P53879 RTC3YHR087W 336 nt13.76□□□□□ -0.21
RHO5P53879 RVS167YDR388W 1449 nt13.73□□□□□ -0.21
RHO5P53879 SCJ1YMR214W 1134 nt13.56□□□□□ -0.24
RHO5P53879 PET122YER153C 765 nt13.55□□□□□ -0.24
RHO5P53879 ATS1YAL020C 1002 nt13.54□□□□□ -0.24
RHO5P53879 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.5□□□□□ -0.25
RHO5P53879 SCR1SCR1 522 nt13.46□□□□□ -0.25
RHO5P53879 SHR5YOL110W 714 nt13.19□□□□□ -0.3
RHO5P53879 RRN5YLR141W 1092 nt13.16□□□□□ -0.3
RHO5P53879 YDJ1YNL064C 1230 nt13.06□□□□□ -0.32
RHO5P53879 RSB1YOR049C 1065 nt12.93□□□□□ -0.34
RHO5P53879 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.9□□□□□ -0.34
RHO5P53879 DEP1YAL013W 1218 nt12.84□□□□□ -0.35
RHO5P53879 URN1YPR152C 1398 nt12.83□□□□□ -0.36
RHO5P53879 GAR1YHR089C 618 nt12.8□□□□□ -0.36
RHO5P53879 PUT4YOR348C 1884 nt12.68□□□□□ -0.38
RHO5P53879 RPN10YHR200W 807 nt12.68□□□□□ -0.38
RHO5P53879 YNL208WYNL208W 600 nt12.63□□□□□ -0.39
RHO5P53879 OPI9YLR338W 858 nt12.62□□□□□ -0.39
RHO5P53879 SAH1YER043C 1350 nt12.56□□□□□ -0.4
RHO5P53879 PST2YDR032C 597 nt12.52□□□□□ -0.41
RHO5P53879 ARE1YCR048W 1833 nt12.45□□□□□ -0.42
RHO5P53879 TIR1YER011W 765 nt12.35□□□□□ -0.43
RHO5P53879 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.34□□□□□ -0.43
RHO5P53879 POA1YBR022W 534 nt12.33□□□□□ -0.44
RHO5P53879 PUN1YLR414C 792 nt12.29□□□□□ -0.44
RHO5P53879 YJR018WYJR018W 363 nt12.24□□□□□ -0.45
RHO5P53879 SSA1YAL005C 1929 nt12.17□□□□□ -0.46
RHO5P53879 PTC2YER089C 1395 nt12.14□□□□□ -0.47
RHO5P53879 Q0182Q0182 405 nt12.1□□□□□ -0.47
RHO5P53879 BUD23YCR047C 828 nt12.09□□□□□ -0.47
RHO5P53879 YKL097CYKL097C 411 nt12.07□□□□□ -0.48
RHO5P53879 BSC6YOL137W 1494 nt12.05□□□□□ -0.48
RHO5P53879 RPP2BYDR382W 333 nt12.04□□□□□ -0.48
RHO5P53879 SHU1YHL006C 453 nt12.02□□□□□ -0.49
RHO5P53879 NAB2YGL122C 1578 nt11.97□□□□□ -0.49
RHO5P53879 YJR120WYJR120W 351 nt11.97□□□□□ -0.49
RHO5P53879 SRB2YHR041C 633 nt11.93□□□□□ -0.5
RHO5P53879 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.86□□□□□ -0.51
RHO5P53879 FPR4YLR449W 1179 nt11.84□□□□□ -0.51
RHO5P53879 DAL1YIR027C 1383 nt11.82□□□□□ -0.52
RHO5P53879 INM2YDR287W 879 nt11.82□□□□□ -0.52
RHO5P53879 WWM1YFL010C 636 nt11.8□□□□□ -0.52
RHO5P53879 YGR021WYGR021W 873 nt11.77□□□□□ -0.53
RHO5P53879 FIS1YIL065C 468 nt11.77□□□□□ -0.53
RHO5P53879 SSA3YBL075C 1950 nt11.76□□□□□ -0.53
RHO5P53879 BDH2YAL061W 1254 nt11.74□□□□□ -0.53
RHO5P53879 PHO4YFR034C 939 nt11.7□□□□□ -0.54
RHO5P53879 YBL100CYBL100C 315 nt11.7□□□□□ -0.54
RHO5P53879 HOM6YJR139C 1080 nt11.68□□□□□ -0.54
RHO5P53879 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.63□□□□□ -0.55
RHO5P53879 MNP1YGL068W 585 nt11.63□□□□□ -0.55
RHO5P53879 LSM3YLR438C-A 270 nt11.58□□□□□ -0.56
RHO5P53879 TRM9YML014W 840 nt11.56□□□□□ -0.56
RHO5P53879 FUN26YAL022C 1554 nt11.55□□□□□ -0.56
RHO5P53879 YOR139CYOR139C 393 nt11.53□□□□□ -0.56
RHO5P53879 NPL3YDR432W 1245 nt11.52□□□□□ -0.57
RHO5P53879 RKM5YLR137W 1104 nt11.52□□□□□ -0.57
RHO5P53879 YOL037CYOL037C 354 nt11.46□□□□□ -0.57
RHO5P53879 ALF1YNL148C 765 nt11.45□□□□□ -0.58
RHO5P53879 YPS1YLR120C 1710 nt11.44□□□□□ -0.58
RHO5P53879 MOT3YMR070W 1473 nt11.44□□□□□ -0.58
RHO5P53879 CCT6YDR188W 1641 nt11.4□□□□□ -0.58
RHO5P53879 YDR095CYDR095C 411 nt11.38□□□□□ -0.59
RHO5P53879 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.38□□□□□ -0.59
RHO5P53879 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.36□□□□□ -0.59
RHO5P53879 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.36□□□□□ -0.59
RHO5P53879 SPT5YML010W 3192 nt11.34□□□□□ -0.59
RHO5P53879 MEP2YNL142W 1500 nt11.3□□□□□ -0.6
RHO5P53879 SIS1YNL007C 1059 nt11.19□□□□□ -0.62
RHO5P53879 RPP2AYOL039W 321 nt11.19□□□□□ -0.62
RHO5P53879 YLR281CYLR281C 468 nt11.16□□□□□ -0.62
RHO5P53879 WHI5YOR083W 888 nt11.15□□□□□ -0.62
RHO5P53879 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.13□□□□□ -0.63
RHO5P53879 DCW1YKL046C 1350 nt11.12□□□□□ -0.63
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