Protein–RNA interactions for Protein: P32776

TFB1, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB1, yeastyeast

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB1P32776 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.18■□□□□ 0.82
TFB1P32776 NOP1YDL014W 984 nt19.86■□□□□ 0.77
TFB1P32776 NSR1YGR159C 1245 nt19.66■□□□□ 0.74
TFB1P32776 YKL036CYKL036C 393 nt18.74■□□□□ 0.59
TFB1P32776 YJL027CYJL027C 417 nt17.58■□□□□ 0.4
TFB1P32776 Q0297Q0297 156 nt17.5■□□□□ 0.39
TFB1P32776 MDJ1YFL016C 1536 nt17.43■□□□□ 0.38
TFB1P32776 SRX1YKL086W 384 nt17.32■□□□□ 0.36
TFB1P32776 SCS3YGL126W 1143 nt17.27■□□□□ 0.36
TFB1P32776 YCR051WYCR051W 669 nt16.48■□□□□ 0.23
TFB1P32776 YOL085CYOL085C 342 nt16.18■□□□□ 0.18
TFB1P32776 SCJ1YMR214W 1134 nt15.94■□□□□ 0.14
TFB1P32776 PKP1YIL042C 1185 nt15.87■□□□□ 0.13
TFB1P32776 RPP1BYDL130W 321 nt15.71■□□□□ 0.11
TFB1P32776 ATS1YAL020C 1002 nt15.58■□□□□ 0.08
TFB1P32776 DBP2YNL112W 1641 nt15.39■□□□□ 0.05
TFB1P32776 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.36■□□□□ 0.05
TFB1P32776 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.36■□□□□ 0.05
TFB1P32776 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.36■□□□□ 0.05
TFB1P32776 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.36■□□□□ 0.05
TFB1P32776 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.36■□□□□ 0.05
TFB1P32776 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.36■□□□□ 0.05
TFB1P32776 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.36■□□□□ 0.05
TFB1P32776 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.36■□□□□ 0.05
TFB1P32776 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.36■□□□□ 0.05
TFB1P32776 CCC1YLR220W 969 nt15.22■□□□□ 0.03
TFB1P32776 SCR1SCR1 522 nt14.96□□□□□ -0.01
TFB1P32776 PET122YER153C 765 nt14.92□□□□□ -0.02
TFB1P32776 YBR190WYBR190W 312 nt14.9□□□□□ -0.02
TFB1P32776 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.69□□□□□ -0.06
TFB1P32776 SSA3YBL075C 1950 nt14.67□□□□□ -0.06
TFB1P32776 RTC3YHR087W 336 nt14.55□□□□□ -0.08
TFB1P32776 RRN5YLR141W 1092 nt14.54□□□□□ -0.08
TFB1P32776 RVS167YDR388W 1449 nt14.48□□□□□ -0.09
TFB1P32776 RSB1YOR049C 1065 nt14.42□□□□□ -0.1
TFB1P32776 PST2YDR032C 597 nt14.34□□□□□ -0.11
TFB1P32776 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.26□□□□□ -0.13
TFB1P32776 YDJ1YNL064C 1230 nt14.23□□□□□ -0.13
TFB1P32776 YKL097CYKL097C 411 nt14.06□□□□□ -0.16
TFB1P32776 SHR5YOL110W 714 nt14.05□□□□□ -0.16
TFB1P32776 PUT4YOR348C 1884 nt13.98□□□□□ -0.17
TFB1P32776 GAR1YHR089C 618 nt13.81□□□□□ -0.2
TFB1P32776 SHU1YHL006C 453 nt13.63□□□□□ -0.23
TFB1P32776 URN1YPR152C 1398 nt13.58□□□□□ -0.23
TFB1P32776 DEP1YAL013W 1218 nt13.55□□□□□ -0.24
TFB1P32776 ARE1YCR048W 1833 nt13.53□□□□□ -0.24
TFB1P32776 POA1YBR022W 534 nt13.45□□□□□ -0.26
TFB1P32776 OPI9YLR338W 858 nt13.42□□□□□ -0.26
TFB1P32776 SAH1YER043C 1350 nt13.36□□□□□ -0.27
TFB1P32776 RPN10YHR200W 807 nt13.35□□□□□ -0.27
TFB1P32776 YOR139CYOR139C 393 nt13.35□□□□□ -0.27
TFB1P32776 TIR1YER011W 765 nt13.34□□□□□ -0.27
TFB1P32776 YNL208WYNL208W 600 nt13.34□□□□□ -0.27
TFB1P32776 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.32□□□□□ -0.28
TFB1P32776 BSC6YOL137W 1494 nt13.29□□□□□ -0.28
TFB1P32776 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.27□□□□□ -0.29
TFB1P32776 SPT5YML010W 3192 nt13.26□□□□□ -0.29
TFB1P32776 NPL3YDR432W 1245 nt13.2□□□□□ -0.3
TFB1P32776 SSA4YER103W 1929 nt13.05□□□□□ -0.32
TFB1P32776 SSA1YAL005C 1929 nt13.04□□□□□ -0.32
TFB1P32776 PUN1YLR414C 792 nt13.02□□□□□ -0.33
TFB1P32776 YJR018WYJR018W 363 nt12.95□□□□□ -0.34
TFB1P32776 YGR021WYGR021W 873 nt12.94□□□□□ -0.34
TFB1P32776 BUD23YCR047C 828 nt12.93□□□□□ -0.34
TFB1P32776 YOL037CYOL037C 354 nt12.9□□□□□ -0.34
TFB1P32776 PTC2YER089C 1395 nt12.89□□□□□ -0.35
TFB1P32776 HOM6YJR139C 1080 nt12.87□□□□□ -0.35
TFB1P32776 MNP1YGL068W 585 nt12.86□□□□□ -0.35
TFB1P32776 SRB2YHR041C 633 nt12.86□□□□□ -0.35
TFB1P32776 WWM1YFL010C 636 nt12.81□□□□□ -0.36
TFB1P32776 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.81□□□□□ -0.36
TFB1P32776 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.81□□□□□ -0.36
TFB1P32776 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.81□□□□□ -0.36
TFB1P32776 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.81□□□□□ -0.36
TFB1P32776 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.81□□□□□ -0.36
TFB1P32776 YJR120WYJR120W 351 nt12.74□□□□□ -0.37
TFB1P32776 NAB2YGL122C 1578 nt12.73□□□□□ -0.37
TFB1P32776 RPP2BYDR382W 333 nt12.69□□□□□ -0.38
TFB1P32776 RKM5YLR137W 1104 nt12.69□□□□□ -0.38
TFB1P32776 BDF1YLR399C 2061 nt12.65□□□□□ -0.38
TFB1P32776 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.64□□□□□ -0.39
TFB1P32776 PUS2YGL063W 1113 nt12.57□□□□□ -0.4
TFB1P32776 MEP2YNL142W 1500 nt12.57□□□□□ -0.4
TFB1P32776 DAL1YIR027C 1383 nt12.54□□□□□ -0.4
TFB1P32776 FIS1YIL065C 468 nt12.53□□□□□ -0.4
TFB1P32776 YLR281CYLR281C 468 nt12.53□□□□□ -0.4
TFB1P32776 MOT3YMR070W 1473 nt12.52□□□□□ -0.41
TFB1P32776 INM2YDR287W 879 nt12.51□□□□□ -0.41
TFB1P32776 FPR4YLR449W 1179 nt12.51□□□□□ -0.41
TFB1P32776 Q0182Q0182 405 nt12.5□□□□□ -0.41
TFB1P32776 BDH2YAL061W 1254 nt12.49□□□□□ -0.41
TFB1P32776 TAT1YBR069C 1860 nt12.46□□□□□ -0.42
TFB1P32776 LSM3YLR438C-A 270 nt12.43□□□□□ -0.42
TFB1P32776 PHO4YFR034C 939 nt12.42□□□□□ -0.42
TFB1P32776 WHI5YOR083W 888 nt12.41□□□□□ -0.42
TFB1P32776 YBL100CYBL100C 315 nt12.37□□□□□ -0.43
TFB1P32776 DCW1YKL046C 1350 nt12.35□□□□□ -0.43
TFB1P32776 YPS1YLR120C 1710 nt12.32□□□□□ -0.44
TFB1P32776 FMP45YDL222C 930 nt12.25□□□□□ -0.45
TFB1P32776 MRPL8YJL063C 717 nt12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.9 ms