Protein–RNA interactions for Protein: Q06091

SNT309, Pre-mRNA-splicing factor SNT309, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNT309Q06091 NSR1YGR159C 1245 nt18.48■□□□□ 0.55
SNT309Q06091 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.43■□□□□ 0.54
SNT309Q06091 NOP1YDL014W 984 nt17.86■□□□□ 0.45
SNT309Q06091 MDJ1YFL016C 1536 nt16.57■□□□□ 0.24
SNT309Q06091 YKL036CYKL036C 393 nt16.27■□□□□ 0.2
SNT309Q06091 SRX1YKL086W 384 nt15.57■□□□□ 0.08
SNT309Q06091 Q0297Q0297 156 nt15.53■□□□□ 0.08
SNT309Q06091 YJL027CYJL027C 417 nt15.31■□□□□ 0.04
SNT309Q06091 YCR051WYCR051W 669 nt14.79□□□□□ -0.04
SNT309Q06091 SCS3YGL126W 1143 nt14.68□□□□□ -0.06
SNT309Q06091 DBP2YNL112W 1641 nt14.55□□□□□ -0.08
SNT309Q06091 YBR190WYBR190W 312 nt14.2□□□□□ -0.14
SNT309Q06091 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.17□□□□□ -0.14
SNT309Q06091 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.17□□□□□ -0.14
SNT309Q06091 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.17□□□□□ -0.14
SNT309Q06091 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.17□□□□□ -0.14
SNT309Q06091 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.17□□□□□ -0.14
SNT309Q06091 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.17□□□□□ -0.14
SNT309Q06091 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.17□□□□□ -0.14
SNT309Q06091 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.17□□□□□ -0.14
SNT309Q06091 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.17□□□□□ -0.14
SNT309Q06091 CCC1YLR220W 969 nt14.08□□□□□ -0.16
SNT309Q06091 YOL085CYOL085C 342 nt14.08□□□□□ -0.16
SNT309Q06091 RPP1BYDL130W 321 nt13.95□□□□□ -0.18
SNT309Q06091 RTC3YHR087W 336 nt13.91□□□□□ -0.18
SNT309Q06091 PKP1YIL042C 1185 nt13.9□□□□□ -0.18
SNT309Q06091 RVS167YDR388W 1449 nt13.72□□□□□ -0.21
SNT309Q06091 SCJ1YMR214W 1134 nt13.54□□□□□ -0.24
SNT309Q06091 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.36□□□□□ -0.27
SNT309Q06091 PET122YER153C 765 nt13.33□□□□□ -0.28
SNT309Q06091 SCR1SCR1 522 nt13.19□□□□□ -0.3
SNT309Q06091 SHR5YOL110W 714 nt13.17□□□□□ -0.3
SNT309Q06091 ATS1YAL020C 1002 nt13.08□□□□□ -0.32
SNT309Q06091 PUT4YOR348C 1884 nt13□□□□□ -0.33
SNT309Q06091 RRN5YLR141W 1092 nt12.93□□□□□ -0.34
SNT309Q06091 URN1YPR152C 1398 nt12.93□□□□□ -0.34
SNT309Q06091 YDJ1YNL064C 1230 nt12.92□□□□□ -0.34
SNT309Q06091 DEP1YAL013W 1218 nt12.86□□□□□ -0.35
SNT309Q06091 OPI9YLR338W 858 nt12.76□□□□□ -0.37
SNT309Q06091 SAH1YER043C 1350 nt12.73□□□□□ -0.37
SNT309Q06091 RPN10YHR200W 807 nt12.72□□□□□ -0.37
SNT309Q06091 ARE1YCR048W 1833 nt12.72□□□□□ -0.37
SNT309Q06091 GAR1YHR089C 618 nt12.68□□□□□ -0.38
SNT309Q06091 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.67□□□□□ -0.38
SNT309Q06091 YNL208WYNL208W 600 nt12.65□□□□□ -0.38
SNT309Q06091 RSB1YOR049C 1065 nt12.63□□□□□ -0.39
SNT309Q06091 POA1YBR022W 534 nt12.62□□□□□ -0.39
SNT309Q06091 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.58□□□□□ -0.4
SNT309Q06091 SSA3YBL075C 1950 nt12.56□□□□□ -0.4
SNT309Q06091 PUN1YLR414C 792 nt12.4□□□□□ -0.42
SNT309Q06091 BSC6YOL137W 1494 nt12.37□□□□□ -0.43
SNT309Q06091 YJR018WYJR018W 363 nt12.32□□□□□ -0.44
SNT309Q06091 BUD23YCR047C 828 nt12.3□□□□□ -0.44
SNT309Q06091 PTC2YER089C 1395 nt12.29□□□□□ -0.44
SNT309Q06091 TIR1YER011W 765 nt12.27□□□□□ -0.45
SNT309Q06091 NAB2YGL122C 1578 nt12.16□□□□□ -0.46
SNT309Q06091 PST2YDR032C 597 nt12.14□□□□□ -0.47
SNT309Q06091 SSA1YAL005C 1929 nt12.13□□□□□ -0.47
SNT309Q06091 RPP2BYDR382W 333 nt12.05□□□□□ -0.48
SNT309Q06091 YJR120WYJR120W 351 nt12.02□□□□□ -0.49
SNT309Q06091 FPR4YLR449W 1179 nt11.96□□□□□ -0.49
SNT309Q06091 DAL1YIR027C 1383 nt11.95□□□□□ -0.5
SNT309Q06091 INM2YDR287W 879 nt11.92□□□□□ -0.5
SNT309Q06091 FIS1YIL065C 468 nt11.92□□□□□ -0.5
SNT309Q06091 SRB2YHR041C 633 nt11.84□□□□□ -0.51
SNT309Q06091 SPT5YML010W 3192 nt11.84□□□□□ -0.51
SNT309Q06091 PHO4YFR034C 939 nt11.83□□□□□ -0.52
SNT309Q06091 YBL100CYBL100C 315 nt11.77□□□□□ -0.53
SNT309Q06091 BDH2YAL061W 1254 nt11.75□□□□□ -0.53
SNT309Q06091 SHU1YHL006C 453 nt11.69□□□□□ -0.54
SNT309Q06091 WWM1YFL010C 636 nt11.68□□□□□ -0.54
SNT309Q06091 YPS1YLR120C 1710 nt11.66□□□□□ -0.54
SNT309Q06091 MEP2YNL142W 1500 nt11.62□□□□□ -0.55
SNT309Q06091 FUN26YAL022C 1554 nt11.61□□□□□ -0.55
SNT309Q06091 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.6□□□□□ -0.55
SNT309Q06091 YGR021WYGR021W 873 nt11.58□□□□□ -0.56
SNT309Q06091 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.58□□□□□ -0.56
SNT309Q06091 YKL097CYKL097C 411 nt11.58□□□□□ -0.56
SNT309Q06091 TRM9YML014W 840 nt11.58□□□□□ -0.56
SNT309Q06091 LSM3YLR438C-A 270 nt11.56□□□□□ -0.56
SNT309Q06091 SSA4YER103W 1929 nt11.56□□□□□ -0.56
SNT309Q06091 YDR095CYDR095C 411 nt11.55□□□□□ -0.56
SNT309Q06091 ALF1YNL148C 765 nt11.52□□□□□ -0.57
SNT309Q06091 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.51□□□□□ -0.57
SNT309Q06091 HOM6YJR139C 1080 nt11.49□□□□□ -0.57
SNT309Q06091 CCT6YDR188W 1641 nt11.43□□□□□ -0.58
SNT309Q06091 DCW1YKL046C 1350 nt11.42□□□□□ -0.58
SNT309Q06091 MNP1YGL068W 585 nt11.41□□□□□ -0.58
SNT309Q06091 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.39□□□□□ -0.59
SNT309Q06091 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.39□□□□□ -0.59
SNT309Q06091 RPP2AYOL039W 321 nt11.36□□□□□ -0.59
SNT309Q06091 RKM5YLR137W 1104 nt11.33□□□□□ -0.6
SNT309Q06091 EMI2YDR516C 1503 nt11.3□□□□□ -0.6
SNT309Q06091 SIS1YNL007C 1059 nt11.3□□□□□ -0.6
SNT309Q06091 PTP1YDL230W 1008 nt11.29□□□□□ -0.6
SNT309Q06091 YMR090WYMR090W 684 nt11.29□□□□□ -0.6
SNT309Q06091 CAC2YML102W 1407 nt11.24□□□□□ -0.61
SNT309Q06091 YDL221WYDL221W 552 nt11.2□□□□□ -0.62
SNT309Q06091 YOL037CYOL037C 354 nt11.16□□□□□ -0.62
SNT309Q06091 ART5YGR068C 1761 nt11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.3 ms