Protein–RNA interactions for Protein: Q12340

YRM1, Zinc finger transcription factor YRM1, yeastyeast

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRM1Q12340 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.43■□□□□ 0.54
YRM1Q12340 NSR1YGR159C 1245 nt18.27■□□□□ 0.52
YRM1Q12340 NOP1YDL014W 984 nt18.02■□□□□ 0.48
YRM1Q12340 YKL036CYKL036C 393 nt16.85■□□□□ 0.29
YRM1Q12340 Q0297Q0297 156 nt15.97■□□□□ 0.15
YRM1Q12340 MDJ1YFL016C 1536 nt15.97■□□□□ 0.15
YRM1Q12340 SRX1YKL086W 384 nt15.84■□□□□ 0.13
YRM1Q12340 YJL027CYJL027C 417 nt15.71■□□□□ 0.11
YRM1Q12340 SCS3YGL126W 1143 nt15.48■□□□□ 0.07
YRM1Q12340 YCR051WYCR051W 669 nt14.9□□□□□ -0.02
YRM1Q12340 YOL085CYOL085C 342 nt14.64□□□□□ -0.07
YRM1Q12340 DBP2YNL112W 1641 nt14.37□□□□□ -0.11
YRM1Q12340 PKP1YIL042C 1185 nt14.3□□□□□ -0.12
YRM1Q12340 RPP1BYDL130W 321 nt14.28□□□□□ -0.12
YRM1Q12340 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YRM1Q12340 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YRM1Q12340 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YRM1Q12340 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YRM1Q12340 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YRM1Q12340 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YRM1Q12340 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YRM1Q12340 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YRM1Q12340 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YRM1Q12340 SCJ1YMR214W 1134 nt14.02□□□□□ -0.17
YRM1Q12340 SSA3YBL075C 1950 nt13.97□□□□□ -0.17
YRM1Q12340 ATS1YAL020C 1002 nt13.91□□□□□ -0.18
YRM1Q12340 CCC1YLR220W 969 nt13.91□□□□□ -0.18
YRM1Q12340 YBR190WYBR190W 312 nt13.7□□□□□ -0.22
YRM1Q12340 PET122YER153C 765 nt13.61□□□□□ -0.23
YRM1Q12340 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.49□□□□□ -0.25
YRM1Q12340 SCR1SCR1 522 nt13.43□□□□□ -0.26
YRM1Q12340 RTC3YHR087W 336 nt13.36□□□□□ -0.27
YRM1Q12340 RVS167YDR388W 1449 nt13.33□□□□□ -0.28
YRM1Q12340 RRN5YLR141W 1092 nt13.23□□□□□ -0.29
YRM1Q12340 YDJ1YNL064C 1230 nt13.09□□□□□ -0.31
YRM1Q12340 SHR5YOL110W 714 nt13.02□□□□□ -0.33
YRM1Q12340 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.01□□□□□ -0.33
YRM1Q12340 RSB1YOR049C 1065 nt12.93□□□□□ -0.34
YRM1Q12340 PST2YDR032C 597 nt12.92□□□□□ -0.34
YRM1Q12340 SSA1YAL005C 1929 nt12.65□□□□□ -0.38
YRM1Q12340 GAR1YHR089C 618 nt12.65□□□□□ -0.38
YRM1Q12340 PUT4YOR348C 1884 nt12.61□□□□□ -0.39
YRM1Q12340 URN1YPR152C 1398 nt12.49□□□□□ -0.41
YRM1Q12340 DEP1YAL013W 1218 nt12.48□□□□□ -0.41
YRM1Q12340 FPS1YLL043W 2010 nt12.44□□□□□ -0.42
YRM1Q12340 YKL097CYKL097C 411 nt12.38□□□□□ -0.43
YRM1Q12340 YNL208WYNL208W 600 nt12.38□□□□□ -0.43
YRM1Q12340 OPI9YLR338W 858 nt12.34□□□□□ -0.43
YRM1Q12340 ARE1YCR048W 1833 nt12.31□□□□□ -0.44
YRM1Q12340 SHU1YHL006C 453 nt12.3□□□□□ -0.44
YRM1Q12340 RPN10YHR200W 807 nt12.29□□□□□ -0.44
YRM1Q12340 TIR1YER011W 765 nt12.27□□□□□ -0.45
YRM1Q12340 SAH1YER043C 1350 nt12.27□□□□□ -0.45
YRM1Q12340 PAC11YDR488C 1602 nt12.24□□□□□ -0.45
YRM1Q12340 NVJ2YPR091C 2313 nt12.22□□□□□ -0.45
YRM1Q12340 POA1YBR022W 534 nt12.18□□□□□ -0.46
YRM1Q12340 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.13□□□□□ -0.47
YRM1Q12340 SSA4YER103W 1929 nt12.12□□□□□ -0.47
YRM1Q12340 SPT5YML010W 3192 nt12.08□□□□□ -0.48
YRM1Q12340 SRB2YHR041C 633 nt12.04□□□□□ -0.48
YRM1Q12340 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.97□□□□□ -0.49
YRM1Q12340 YOR139CYOR139C 393 nt11.97□□□□□ -0.49
YRM1Q12340 BSC6YOL137W 1494 nt11.96□□□□□ -0.49
YRM1Q12340 YJR120WYJR120W 351 nt11.96□□□□□ -0.49
YRM1Q12340 PUN1YLR414C 792 nt11.94□□□□□ -0.5
YRM1Q12340 YJR018WYJR018W 363 nt11.93□□□□□ -0.5
YRM1Q12340 PTC2YER089C 1395 nt11.83□□□□□ -0.52
YRM1Q12340 BUD23YCR047C 828 nt11.82□□□□□ -0.52
YRM1Q12340 Q0182Q0182 405 nt11.81□□□□□ -0.52
YRM1Q12340 HOM6YJR139C 1080 nt11.79□□□□□ -0.52
YRM1Q12340 BDF1YLR399C 2061 nt11.76□□□□□ -0.53
YRM1Q12340 WWM1YFL010C 636 nt11.76□□□□□ -0.53
YRM1Q12340 YGR021WYGR021W 873 nt11.74□□□□□ -0.53
YRM1Q12340 NAB2YGL122C 1578 nt11.71□□□□□ -0.53
YRM1Q12340 MNP1YGL068W 585 nt11.69□□□□□ -0.54
YRM1Q12340 RPP2BYDR382W 333 nt11.67□□□□□ -0.54
YRM1Q12340 NPL3YDR432W 1245 nt11.66□□□□□ -0.54
YRM1Q12340 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.59□□□□□ -0.55
YRM1Q12340 YOL037CYOL037C 354 nt11.59□□□□□ -0.55
YRM1Q12340 TAT1YBR069C 1860 nt11.58□□□□□ -0.56
YRM1Q12340 BDH2YAL061W 1254 nt11.58□□□□□ -0.56
YRM1Q12340 RKM5YLR137W 1104 nt11.58□□□□□ -0.56
YRM1Q12340 FIS1YIL065C 468 nt11.51□□□□□ -0.57
YRM1Q12340 DAL1YIR027C 1383 nt11.51□□□□□ -0.57
YRM1Q12340 INM2YDR287W 879 nt11.49□□□□□ -0.57
YRM1Q12340 LSM3YLR438C-A 270 nt11.49□□□□□ -0.57
YRM1Q12340 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.48□□□□□ -0.57
YRM1Q12340 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.48□□□□□ -0.57
YRM1Q12340 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.48□□□□□ -0.57
YRM1Q12340 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.48□□□□□ -0.57
YRM1Q12340 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.48□□□□□ -0.57
YRM1Q12340 FPR4YLR449W 1179 nt11.45□□□□□ -0.58
YRM1Q12340 RPM1RPM1 483 nt11.41□□□□□ -0.58
YRM1Q12340 PHO4YFR034C 939 nt11.4□□□□□ -0.58
YRM1Q12340 YBL100CYBL100C 315 nt11.39□□□□□ -0.59
YRM1Q12340 YLR281CYLR281C 468 nt11.36□□□□□ -0.59
YRM1Q12340 MEP2YNL142W 1500 nt11.32□□□□□ -0.6
YRM1Q12340 FUN26YAL022C 1554 nt11.29□□□□□ -0.6
YRM1Q12340 YPS1YLR120C 1710 nt11.27□□□□□ -0.61
YRM1Q12340 TRM9YML014W 840 nt11.25□□□□□ -0.61
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