Protein–RNA interactions for Protein: Q06820

MDM36, Mitochondrial distribution and morphology protein 36, yeastyeast

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDM36Q06820 NSR1YGR159C 1245 nt18.24■□□□□ 0.51
MDM36Q06820 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.83■□□□□ 0.44
MDM36Q06820 NOP1YDL014W 984 nt17.08■□□□□ 0.32
MDM36Q06820 MDJ1YFL016C 1536 nt16.8■□□□□ 0.28
MDM36Q06820 YJL027CYJL027C 417 nt15.44■□□□□ 0.06
MDM36Q06820 YKL036CYKL036C 393 nt15.17■□□□□ 0.02
MDM36Q06820 SRX1YKL086W 384 nt14.91□□□□□ -0.02
MDM36Q06820 Q0297Q0297 156 nt14.74□□□□□ -0.05
MDM36Q06820 DBP2YNL112W 1641 nt14.6□□□□□ -0.07
MDM36Q06820 SSA3YBL075C 1950 nt14.55□□□□□ -0.08
MDM36Q06820 YBR190WYBR190W 312 nt14.5□□□□□ -0.09
MDM36Q06820 RTC3YHR087W 336 nt14.12□□□□□ -0.15
MDM36Q06820 YCR051WYCR051W 669 nt14.08□□□□□ -0.16
MDM36Q06820 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.88□□□□□ -0.19
MDM36Q06820 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.88□□□□□ -0.19
MDM36Q06820 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.88□□□□□ -0.19
MDM36Q06820 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.88□□□□□ -0.19
MDM36Q06820 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.88□□□□□ -0.19
MDM36Q06820 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.88□□□□□ -0.19
MDM36Q06820 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.88□□□□□ -0.19
MDM36Q06820 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.88□□□□□ -0.19
MDM36Q06820 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.88□□□□□ -0.19
MDM36Q06820 CCC1YLR220W 969 nt13.67□□□□□ -0.22
MDM36Q06820 PUT4YOR348C 1884 nt13.64□□□□□ -0.23
MDM36Q06820 RVS167YDR388W 1449 nt13.62□□□□□ -0.23
MDM36Q06820 SCS3YGL126W 1143 nt13.48□□□□□ -0.25
MDM36Q06820 SCJ1YMR214W 1134 nt13.43□□□□□ -0.26
MDM36Q06820 RPP1BYDL130W 321 nt13.22□□□□□ -0.29
MDM36Q06820 ARE1YCR048W 1833 nt13.2□□□□□ -0.3
MDM36Q06820 YOL085CYOL085C 342 nt13.13□□□□□ -0.31
MDM36Q06820 POA1YBR022W 534 nt13.12□□□□□ -0.31
MDM36Q06820 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.06□□□□□ -0.32
MDM36Q06820 BSC6YOL137W 1494 nt13□□□□□ -0.33
MDM36Q06820 SAH1YER043C 1350 nt13□□□□□ -0.33
MDM36Q06820 URN1YPR152C 1398 nt13□□□□□ -0.33
MDM36Q06820 PKP1YIL042C 1185 nt12.99□□□□□ -0.33
MDM36Q06820 SHR5YOL110W 714 nt12.99□□□□□ -0.33
MDM36Q06820 OPI9YLR338W 858 nt12.95□□□□□ -0.34
MDM36Q06820 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.89□□□□□ -0.35
MDM36Q06820 SPT5YML010W 3192 nt12.86□□□□□ -0.35
MDM36Q06820 DEP1YAL013W 1218 nt12.79□□□□□ -0.36
MDM36Q06820 SSA4YER103W 1929 nt12.72□□□□□ -0.37
MDM36Q06820 PET122YER153C 765 nt12.71□□□□□ -0.37
MDM36Q06820 RPN10YHR200W 807 nt12.7□□□□□ -0.38
MDM36Q06820 BUD23YCR047C 828 nt12.67□□□□□ -0.38
MDM36Q06820 PUN1YLR414C 792 nt12.58□□□□□ -0.4
MDM36Q06820 YNL208WYNL208W 600 nt12.55□□□□□ -0.4
MDM36Q06820 PTC2YER089C 1395 nt12.5□□□□□ -0.41
MDM36Q06820 YDJ1YNL064C 1230 nt12.49□□□□□ -0.41
MDM36Q06820 SSA1YAL005C 1929 nt12.46□□□□□ -0.42
MDM36Q06820 NAB2YGL122C 1578 nt12.44□□□□□ -0.42
MDM36Q06820 PAC11YDR488C 1602 nt12.41□□□□□ -0.42
MDM36Q06820 SCR1SCR1 522 nt12.41□□□□□ -0.42
MDM36Q06820 YJR018WYJR018W 363 nt12.35□□□□□ -0.43
MDM36Q06820 NVJ2YPR091C 2313 nt12.31□□□□□ -0.44
MDM36Q06820 BDF1YLR399C 2061 nt12.3□□□□□ -0.44
MDM36Q06820 GAR1YHR089C 618 nt12.28□□□□□ -0.44
MDM36Q06820 MEP2YNL142W 1500 nt12.27□□□□□ -0.45
MDM36Q06820 FIS1YIL065C 468 nt12.26□□□□□ -0.45
MDM36Q06820 FPS1YLL043W 2010 nt12.25□□□□□ -0.45
MDM36Q06820 RRN5YLR141W 1092 nt12.23□□□□□ -0.45
MDM36Q06820 DAL1YIR027C 1383 nt12.17□□□□□ -0.46
MDM36Q06820 TAT1YBR069C 1860 nt12.14□□□□□ -0.47
MDM36Q06820 FPR4YLR449W 1179 nt12.09□□□□□ -0.47
MDM36Q06820 PHO4YFR034C 939 nt12.07□□□□□ -0.48
MDM36Q06820 YJR120WYJR120W 351 nt12.05□□□□□ -0.48
MDM36Q06820 YPS1YLR120C 1710 nt12.05□□□□□ -0.48
MDM36Q06820 DCW1YKL046C 1350 nt12.05□□□□□ -0.48
MDM36Q06820 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.01□□□□□ -0.49
MDM36Q06820 ATS1YAL020C 1002 nt12.01□□□□□ -0.49
MDM36Q06820 INM2YDR287W 879 nt11.99□□□□□ -0.49
MDM36Q06820 RPP2BYDR382W 333 nt11.96□□□□□ -0.49
MDM36Q06820 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.94□□□□□ -0.5
MDM36Q06820 TIR1YER011W 765 nt11.92□□□□□ -0.5
MDM36Q06820 EMI2YDR516C 1503 nt11.88□□□□□ -0.51
MDM36Q06820 YDR095CYDR095C 411 nt11.88□□□□□ -0.51
MDM36Q06820 YBR220CYBR220C 1683 nt11.87□□□□□ -0.51
MDM36Q06820 YMR090WYMR090W 684 nt11.86□□□□□ -0.51
MDM36Q06820 RSB1YOR049C 1065 nt11.82□□□□□ -0.52
MDM36Q06820 YBL100CYBL100C 315 nt11.81□□□□□ -0.52
MDM36Q06820 YDL221WYDL221W 552 nt11.76□□□□□ -0.53
MDM36Q06820 SDH1YKL148C 1923 nt11.73□□□□□ -0.53
MDM36Q06820 CAC2YML102W 1407 nt11.65□□□□□ -0.54
MDM36Q06820 PTP1YDL230W 1008 nt11.64□□□□□ -0.55
MDM36Q06820 RPP2AYOL039W 321 nt11.63□□□□□ -0.55
MDM36Q06820 FUN26YAL022C 1554 nt11.62□□□□□ -0.55
MDM36Q06820 Q0182Q0182 405 nt11.62□□□□□ -0.55
MDM36Q06820 BDH2YAL061W 1254 nt11.61□□□□□ -0.55
MDM36Q06820 ALF1YNL148C 765 nt11.6□□□□□ -0.55
MDM36Q06820 PCH2YBR186W 1695 nt11.59□□□□□ -0.55
MDM36Q06820 SCC4YER147C 1875 nt11.56□□□□□ -0.56
MDM36Q06820 SRB2YHR041C 633 nt11.56□□□□□ -0.56
MDM36Q06820 SEC11YIR022W 504 nt11.56□□□□□ -0.56
MDM36Q06820 GUT2YIL155C 1950 nt11.54□□□□□ -0.56
MDM36Q06820 IRC15YPL017C 1500 nt11.5□□□□□ -0.57
MDM36Q06820 TRM9YML014W 840 nt11.46□□□□□ -0.57
MDM36Q06820 GIS3YLR094C 1509 nt11.43□□□□□ -0.58
MDM36Q06820 CCT6YDR188W 1641 nt11.42□□□□□ -0.58
MDM36Q06820 SIS1YNL007C 1059 nt11.42□□□□□ -0.58
MDM36Q06820 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms