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Protein–RNA interactions for Protein: P20051
URA4, Dihydroorotase, yeast
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364 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
URA4
P20051
NSR1
YGR159C
1245 nt
19.17
■□□□□ 0.66
URA4
P20051
YML009W-B
YML009W-B
477 nt
19.13
■□□□□ 0.65
URA4
P20051
NOP1
YDL014W
984 nt
18.76
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URA4
P20051
MDJ1
YFL016C
1536 nt
17.67
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URA4
P20051
YKL036C
YKL036C
393 nt
17.55
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URA4
P20051
Q0297
Q0297
156 nt
16.49
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URA4
P20051
YJL027C
YJL027C
417 nt
16.44
■□□□□ 0.22
URA4
P20051
SRX1
YKL086W
384 nt
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URA4
P20051
SCS3
YGL126W
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URA4
P20051
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YCR051W
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URA4
P20051
DBP2
YNL112W
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URA4
P20051
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YBR190W
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URA4
P20051
YOL085C
YOL085C
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URA4
P20051
SSA3
YBL075C
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URA4
P20051
RTC3
YHR087W
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□□□□□ -0.02
URA4
P20051
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YIL042C
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URA4
P20051
RPP1B
YDL130W
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URA4
P20051
SCJ1
YMR214W
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URA4
P20051
TRN1
tP(UGG)A
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URA4
P20051
SUF9
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14.61
□□□□□ -0.07
URA4
P20051
SUF8
tP(UGG)H
72 nt
14.61
□□□□□ -0.07
URA4
P20051
tP(UGG)L
tP(UGG)L
72 nt
14.61
□□□□□ -0.07
URA4
P20051
SUF7
tP(UGG)M
72 nt
14.61
□□□□□ -0.07
URA4
P20051
tP(UGG)N1
tP(UGG)N1
72 nt
14.61
□□□□□ -0.07
URA4
P20051
tP(UGG)N2
tP(UGG)N2
72 nt
14.61
□□□□□ -0.07
URA4
P20051
tP(UGG)O1
tP(UGG)O1
72 nt
14.61
□□□□□ -0.07
URA4
P20051
SUF11
tP(UGG)O2
72 nt
14.61
□□□□□ -0.07
URA4
P20051
ATS1
YAL020C
1002 nt
14.49
□□□□□ -0.09
URA4
P20051
CCC1
YLR220W
969 nt
14.48
□□□□□ -0.09
URA4
P20051
PUT4
YOR348C
1884 nt
14.34
□□□□□ -0.11
URA4
P20051
RVS167
YDR388W
1449 nt
14.29
□□□□□ -0.12
URA4
P20051
PET122
YER153C
765 nt
14.07
□□□□□ -0.16
URA4
P20051
SCR1
SCR1
522 nt
14.06
□□□□□ -0.16
URA4
P20051
tP(UGG)O3
tP(UGG)O3
72 nt
13.93
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URA4
P20051
POA1
YBR022W
534 nt
13.89
□□□□□ -0.19
URA4
P20051
ARE1
YCR048W
1833 nt
13.88
□□□□□ -0.19
URA4
P20051
YHR049C-A
YHR049C-A
297 nt
13.72
□□□□□ -0.21
URA4
P20051
SAH1
YER043C
1350 nt
13.71
□□□□□ -0.21
URA4
P20051
RRN5
YLR141W
1092 nt
13.71
□□□□□ -0.21
URA4
P20051
BSC6
YOL137W
1494 nt
13.68
□□□□□ -0.22
URA4
P20051
URN1
YPR152C
1398 nt
13.68
□□□□□ -0.22
URA4
P20051
SHR5
YOL110W
714 nt
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URA4
P20051
OPI9
YLR338W
858 nt
13.6
□□□□□ -0.23
URA4
P20051
RSB1
YOR049C
1065 nt
13.53
□□□□□ -0.24
URA4
P20051
SPT5
YML010W
3192 nt
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□□□□□ -0.25
URA4
P20051
DEP1
YAL013W
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□□□□□ -0.25
URA4
P20051
YDJ1
YNL064C
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URA4
P20051
YER088W-B
YER088W-B
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13.44
□□□□□ -0.26
URA4
P20051
SSA4
YER103W
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13.39
□□□□□ -0.27
URA4
P20051
BUD23
YCR047C
828 nt
13.37
□□□□□ -0.27
URA4
P20051
PST2
YDR032C
597 nt
13.36
□□□□□ -0.27
URA4
P20051
RPN10
YHR200W
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URA4
P20051
PUN1
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URA4
P20051
YNL208W
YNL208W
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URA4
P20051
PTC2
YER089C
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URA4
P20051
GAR1
YHR089C
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URA4
P20051
NAB2
YGL122C
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URA4
P20051
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YJR018W
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URA4
P20051
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YKL097C
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URA4
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URA4
P20051
MEP2
YNL142W
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URA4
P20051
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YIL065C
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URA4
P20051
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URA4
P20051
DAL1
YIR027C
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URA4
P20051
SHU1
YHL006C
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URA4
P20051
TAT1
YBR069C
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P20051
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URA4
P20051
TIR1
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URA4
P20051
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URA4
P20051
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URA4
P20051
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YDR287W
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URA4
P20051
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YJR120W
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URA4
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YHR165W-A
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YDR382W
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P20051
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YBR220C
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P20051
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URA4
P20051
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YMR090W
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P20051
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P20051
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YDR095C
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P20051
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YBL100C
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URA4
P20051
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YOR139C
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P20051
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YDL221W
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P20051
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P20051
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P20051
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□□□□□ -0.45
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P20051
PTP1
YDL230W
1008 nt
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URA4
P20051
RPP2A
YOL039W
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□□□□□ -0.45
URA4
P20051
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URA4
P20051
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□□□□□ -0.45
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YGR021W
873 nt
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URA4
P20051
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YNL148C
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URA4
P20051
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□□□□□ -0.46
URA4
P20051
BDH2
YAL061W
1254 nt
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□□□□□ -0.46
URA4
P20051
SCC4
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1875 nt
12.17
□□□□□ -0.46
URA4
P20051
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YFL010C
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12.15
□□□□□ -0.46
URA4
P20051
SEC11
YIR022W
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12.15
□□□□□ -0.46
URA4
P20051
GUT2
YIL155C
1950 nt
12.15
□□□□□ -0.46
URA4
P20051
HOM6
YJR139C
1080 nt
12.14
□□□□□ -0.47
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