Protein–RNA interactions for Protein: Q12272

TPT1, tRNA 2'-phosphotransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPT1Q12272 NSR1YGR159C 1245 nt14.73□□□□□ -0.05
TPT1Q12272 YML009W-BYML009W-B 477 nt14.2□□□□□ -0.14
TPT1Q12272 MDJ1YFL016C 1536 nt13.81□□□□□ -0.2
TPT1Q12272 NOP1YDL014W 984 nt13.69□□□□□ -0.22
TPT1Q12272 SSA3YBL075C 1950 nt12.71□□□□□ -0.37
TPT1Q12272 YJL027CYJL027C 417 nt12.66□□□□□ -0.38
TPT1Q12272 YKL036CYKL036C 393 nt12.27□□□□□ -0.45
TPT1Q12272 YBR190WYBR190W 312 nt11.99□□□□□ -0.49
TPT1Q12272 SRX1YKL086W 384 nt11.98□□□□□ -0.49
TPT1Q12272 DBP2YNL112W 1641 nt11.92□□□□□ -0.5
TPT1Q12272 Q0297Q0297 156 nt11.89□□□□□ -0.51
TPT1Q12272 RTC3YHR087W 336 nt11.66□□□□□ -0.54
TPT1Q12272 PUT4YOR348C 1884 nt11.51□□□□□ -0.57
TPT1Q12272 YCR051WYCR051W 669 nt11.26□□□□□ -0.61
TPT1Q12272 SPT5YML010W 3192 nt11.11□□□□□ -0.63
TPT1Q12272 SSA4YER103W 1929 nt11.09□□□□□ -0.63
TPT1Q12272 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.07□□□□□ -0.64
TPT1Q12272 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.07□□□□□ -0.64
TPT1Q12272 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.07□□□□□ -0.64
TPT1Q12272 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.07□□□□□ -0.64
TPT1Q12272 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.07□□□□□ -0.64
TPT1Q12272 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.07□□□□□ -0.64
TPT1Q12272 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.07□□□□□ -0.64
TPT1Q12272 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.07□□□□□ -0.64
TPT1Q12272 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.07□□□□□ -0.64
TPT1Q12272 POA1YBR022W 534 nt11.06□□□□□ -0.64
TPT1Q12272 ARE1YCR048W 1833 nt11.05□□□□□ -0.64
TPT1Q12272 RVS167YDR388W 1449 nt11.01□□□□□ -0.65
TPT1Q12272 BSC6YOL137W 1494 nt10.99□□□□□ -0.65
TPT1Q12272 SCS3YGL126W 1143 nt10.97□□□□□ -0.65
TPT1Q12272 CCC1YLR220W 969 nt10.92□□□□□ -0.66
TPT1Q12272 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.9□□□□□ -0.66
TPT1Q12272 SCJ1YMR214W 1134 nt10.81□□□□□ -0.68
TPT1Q12272 SAH1YER043C 1350 nt10.78□□□□□ -0.68
TPT1Q12272 BDF1YLR399C 2061 nt10.77□□□□□ -0.69
TPT1Q12272 Q0182Q0182 405 nt10.76□□□□□ -0.69
TPT1Q12272 SSA1YAL005C 1929 nt10.73□□□□□ -0.69
TPT1Q12272 RPP1BYDL130W 321 nt10.65□□□□□ -0.7
TPT1Q12272 OPI9YLR338W 858 nt10.65□□□□□ -0.7
TPT1Q12272 YOL085CYOL085C 342 nt10.64□□□□□ -0.71
TPT1Q12272 URN1YPR152C 1398 nt10.64□□□□□ -0.71
TPT1Q12272 PAC11YDR488C 1602 nt10.62□□□□□ -0.71
TPT1Q12272 TAT1YBR069C 1860 nt10.6□□□□□ -0.71
TPT1Q12272 BUD23YCR047C 828 nt10.57□□□□□ -0.72
TPT1Q12272 FPS1YLL043W 2010 nt10.51□□□□□ -0.73
TPT1Q12272 NVJ2YPR091C 2313 nt10.47□□□□□ -0.73
TPT1Q12272 PKP1YIL042C 1185 nt10.46□□□□□ -0.73
TPT1Q12272 SHR5YOL110W 714 nt10.45□□□□□ -0.74
TPT1Q12272 MEP2YNL142W 1500 nt10.4□□□□□ -0.74
TPT1Q12272 DEP1YAL013W 1218 nt10.4□□□□□ -0.74
TPT1Q12272 PTC2YER089C 1395 nt10.34□□□□□ -0.75
TPT1Q12272 PUN1YLR414C 792 nt10.33□□□□□ -0.76
TPT1Q12272 NAB2YGL122C 1578 nt10.31□□□□□ -0.76
TPT1Q12272 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.31□□□□□ -0.76
TPT1Q12272 RPN10YHR200W 807 nt10.3□□□□□ -0.76
TPT1Q12272 DCW1YKL046C 1350 nt10.21□□□□□ -0.78
TPT1Q12272 PET122YER153C 765 nt10.2□□□□□ -0.78
TPT1Q12272 YNL208WYNL208W 600 nt10.17□□□□□ -0.78
TPT1Q12272 MOT3YMR070W 1473 nt10.17□□□□□ -0.78
TPT1Q12272 YBR220CYBR220C 1683 nt10.15□□□□□ -0.78
TPT1Q12272 FIS1YIL065C 468 nt10.11□□□□□ -0.79
TPT1Q12272 YJR018WYJR018W 363 nt10.09□□□□□ -0.79
TPT1Q12272 EMI2YDR516C 1503 nt10.05□□□□□ -0.8
TPT1Q12272 YMR090WYMR090W 684 nt10.04□□□□□ -0.8
TPT1Q12272 DAL1YIR027C 1383 nt10.03□□□□□ -0.8
TPT1Q12272 YPS1YLR120C 1710 nt10.03□□□□□ -0.8
TPT1Q12272 YDJ1YNL064C 1230 nt10.02□□□□□ -0.81
TPT1Q12272 PCH2YBR186W 1695 nt9.99□□□□□ -0.81
TPT1Q12272 SCR1SCR1 522 nt9.98□□□□□ -0.81
TPT1Q12272 FPR4YLR449W 1179 nt9.97□□□□□ -0.81
TPT1Q12272 GUT2YIL155C 1950 nt9.97□□□□□ -0.81
TPT1Q12272 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.96□□□□□ -0.82
TPT1Q12272 SDH1YKL148C 1923 nt9.94□□□□□ -0.82
TPT1Q12272 PHO4YFR034C 939 nt9.94□□□□□ -0.82
TPT1Q12272 YDL221WYDL221W 552 nt9.91□□□□□ -0.82
TPT1Q12272 SEC11YIR022W 504 nt9.9□□□□□ -0.82
TPT1Q12272 YDR095CYDR095C 411 nt9.85□□□□□ -0.83
TPT1Q12272 INM2YDR287W 879 nt9.84□□□□□ -0.83
TPT1Q12272 RRN5YLR141W 1092 nt9.84□□□□□ -0.83
TPT1Q12272 PIB2YGL023C 1908 nt9.8□□□□□ -0.84
TPT1Q12272 YJR120WYJR120W 351 nt9.8□□□□□ -0.84
TPT1Q12272 CAC2YML102W 1407 nt9.78□□□□□ -0.84
TPT1Q12272 GAR1YHR089C 618 nt9.77□□□□□ -0.85
TPT1Q12272 SCC4YER147C 1875 nt9.76□□□□□ -0.85
TPT1Q12272 PTP1YDL230W 1008 nt9.72□□□□□ -0.85
TPT1Q12272 ATS1YAL020C 1002 nt9.7□□□□□ -0.86
TPT1Q12272 RPP2BYDR382W 333 nt9.67□□□□□ -0.86
TPT1Q12272 YER088W-BYER088W-B 147 nt9.67□□□□□ -0.86
TPT1Q12272 UME6YDR207C 2511 nt9.65□□□□□ -0.86
TPT1Q12272 RTF1YGL244W 1677 nt9.65□□□□□ -0.86
TPT1Q12272 RPP2AYOL039W 321 nt9.65□□□□□ -0.86
TPT1Q12272 IRC15YPL017C 1500 nt9.65□□□□□ -0.86
TPT1Q12272 RPM1RPM1 483 nt9.64□□□□□ -0.87
TPT1Q12272 YSC84YHR016C 1407 nt9.64□□□□□ -0.87
TPT1Q12272 YBL100CYBL100C 315 nt9.62□□□□□ -0.87
TPT1Q12272 GIS3YLR094C 1509 nt9.59□□□□□ -0.87
TPT1Q12272 YHL050CYHL050C 2094 nt9.57□□□□□ -0.88
TPT1Q12272 BOR1YNL275W 1731 nt9.54□□□□□ -0.88
TPT1Q12272 PTK1YKL198C 1989 nt9.53□□□□□ -0.88
TPT1Q12272 BOP3YNL042W 1191 nt9.52□□□□□ -0.89
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