Protein–RNA interactions for Protein: P20434

RPB5, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, yeastyeast

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPB5P20434 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.12■□□□□ 0.65
RPB5P20434 NSR1YGR159C 1245 nt19.05■□□□□ 0.64
RPB5P20434 NOP1YDL014W 984 nt18.58■□□□□ 0.56
RPB5P20434 YKL036CYKL036C 393 nt17.07■□□□□ 0.32
RPB5P20434 MDJ1YFL016C 1536 nt16.96■□□□□ 0.3
RPB5P20434 Q0297Q0297 156 nt16.22■□□□□ 0.19
RPB5P20434 SRX1YKL086W 384 nt16.21■□□□□ 0.19
RPB5P20434 YJL027CYJL027C 417 nt15.92■□□□□ 0.14
RPB5P20434 SCS3YGL126W 1143 nt15.47■□□□□ 0.07
RPB5P20434 YCR051WYCR051W 669 nt15.38■□□□□ 0.05
RPB5P20434 DBP2YNL112W 1641 nt14.95□□□□□ -0.02
RPB5P20434 YOL085CYOL085C 342 nt14.76□□□□□ -0.05
RPB5P20434 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RPB5P20434 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RPB5P20434 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RPB5P20434 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RPB5P20434 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RPB5P20434 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RPB5P20434 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RPB5P20434 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RPB5P20434 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RPB5P20434 RPP1BYDL130W 321 nt14.55□□□□□ -0.08
RPB5P20434 PKP1YIL042C 1185 nt14.54□□□□□ -0.08
RPB5P20434 CCC1YLR220W 969 nt14.54□□□□□ -0.08
RPB5P20434 YBR190WYBR190W 312 nt14.49□□□□□ -0.09
RPB5P20434 RTC3YHR087W 336 nt14.18□□□□□ -0.14
RPB5P20434 RVS167YDR388W 1449 nt14.12□□□□□ -0.15
RPB5P20434 SCJ1YMR214W 1134 nt13.97□□□□□ -0.17
RPB5P20434 PET122YER153C 765 nt13.9□□□□□ -0.18
RPB5P20434 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.87□□□□□ -0.19
RPB5P20434 ATS1YAL020C 1002 nt13.82□□□□□ -0.2
RPB5P20434 SCR1SCR1 522 nt13.78□□□□□ -0.2
RPB5P20434 SHR5YOL110W 714 nt13.59□□□□□ -0.23
RPB5P20434 RRN5YLR141W 1092 nt13.49□□□□□ -0.25
RPB5P20434 YDJ1YNL064C 1230 nt13.43□□□□□ -0.26
RPB5P20434 URN1YPR152C 1398 nt13.24□□□□□ -0.29
RPB5P20434 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.22□□□□□ -0.29
RPB5P20434 RSB1YOR049C 1065 nt13.22□□□□□ -0.29
RPB5P20434 DEP1YAL013W 1218 nt13.2□□□□□ -0.3
RPB5P20434 PUT4YOR348C 1884 nt13.17□□□□□ -0.3
RPB5P20434 GAR1YHR089C 618 nt13.14□□□□□ -0.31
RPB5P20434 RPN10YHR200W 807 nt13.07□□□□□ -0.32
RPB5P20434 OPI9YLR338W 858 nt13.05□□□□□ -0.32
RPB5P20434 YNL208WYNL208W 600 nt13.02□□□□□ -0.33
RPB5P20434 SAH1YER043C 1350 nt12.97□□□□□ -0.33
RPB5P20434 ARE1YCR048W 1833 nt12.92□□□□□ -0.34
RPB5P20434 PST2YDR032C 597 nt12.8□□□□□ -0.36
RPB5P20434 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.78□□□□□ -0.36
RPB5P20434 POA1YBR022W 534 nt12.77□□□□□ -0.37
RPB5P20434 SSA3YBL075C 1950 nt12.72□□□□□ -0.37
RPB5P20434 TIR1YER011W 765 nt12.7□□□□□ -0.38
RPB5P20434 PUN1YLR414C 792 nt12.7□□□□□ -0.38
RPB5P20434 YJR018WYJR018W 363 nt12.63□□□□□ -0.39
RPB5P20434 PTC2YER089C 1395 nt12.54□□□□□ -0.4
RPB5P20434 SSA1YAL005C 1929 nt12.53□□□□□ -0.4
RPB5P20434 BSC6YOL137W 1494 nt12.51□□□□□ -0.41
RPB5P20434 BUD23YCR047C 828 nt12.49□□□□□ -0.41
RPB5P20434 RPP2BYDR382W 333 nt12.39□□□□□ -0.43
RPB5P20434 NAB2YGL122C 1578 nt12.39□□□□□ -0.43
RPB5P20434 YJR120WYJR120W 351 nt12.37□□□□□ -0.43
RPB5P20434 SHU1YHL006C 453 nt12.29□□□□□ -0.44
RPB5P20434 YKL097CYKL097C 411 nt12.29□□□□□ -0.44
RPB5P20434 SRB2YHR041C 633 nt12.27□□□□□ -0.45
RPB5P20434 DAL1YIR027C 1383 nt12.21□□□□□ -0.45
RPB5P20434 INM2YDR287W 879 nt12.2□□□□□ -0.46
RPB5P20434 FPR4YLR449W 1179 nt12.19□□□□□ -0.46
RPB5P20434 FIS1YIL065C 468 nt12.18□□□□□ -0.46
RPB5P20434 WWM1YFL010C 636 nt12.12□□□□□ -0.47
RPB5P20434 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.12□□□□□ -0.47
RPB5P20434 PHO4YFR034C 939 nt12.1□□□□□ -0.47
RPB5P20434 BDH2YAL061W 1254 nt12.1□□□□□ -0.47
RPB5P20434 YGR021WYGR021W 873 nt12.07□□□□□ -0.48
RPB5P20434 YBL100CYBL100C 315 nt12.07□□□□□ -0.48
RPB5P20434 HOM6YJR139C 1080 nt11.99□□□□□ -0.49
RPB5P20434 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.95□□□□□ -0.5
RPB5P20434 LSM3YLR438C-A 270 nt11.94□□□□□ -0.5
RPB5P20434 MNP1YGL068W 585 nt11.91□□□□□ -0.5
RPB5P20434 FUN26YAL022C 1554 nt11.91□□□□□ -0.5
RPB5P20434 TRM9YML014W 840 nt11.9□□□□□ -0.5
RPB5P20434 SPT5YML010W 3192 nt11.88□□□□□ -0.51
RPB5P20434 YPS1YLR120C 1710 nt11.86□□□□□ -0.51
RPB5P20434 RKM5YLR137W 1104 nt11.82□□□□□ -0.52
RPB5P20434 YDR095CYDR095C 411 nt11.79□□□□□ -0.52
RPB5P20434 ALF1YNL148C 765 nt11.79□□□□□ -0.52
RPB5P20434 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.77□□□□□ -0.53
RPB5P20434 YOR139CYOR139C 393 nt11.77□□□□□ -0.53
RPB5P20434 CCT6YDR188W 1641 nt11.76□□□□□ -0.53
RPB5P20434 MEP2YNL142W 1500 nt11.75□□□□□ -0.53
RPB5P20434 NPL3YDR432W 1245 nt11.74□□□□□ -0.53
RPB5P20434 YOL037CYOL037C 354 nt11.73□□□□□ -0.53
RPB5P20434 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.71□□□□□ -0.53
RPB5P20434 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.71□□□□□ -0.53
RPB5P20434 RPP2AYOL039W 321 nt11.58□□□□□ -0.56
RPB5P20434 SIS1YNL007C 1059 nt11.57□□□□□ -0.56
RPB5P20434 DCW1YKL046C 1350 nt11.54□□□□□ -0.56
RPB5P20434 SSA4YER103W 1929 nt11.51□□□□□ -0.57
RPB5P20434 PTP1YDL230W 1008 nt11.49□□□□□ -0.57
RPB5P20434 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.43□□□□□ -0.58
RPB5P20434 YLR281CYLR281C 468 nt11.43□□□□□ -0.58
RPB5P20434 EMI2YDR516C 1503 nt11.42□□□□□ -0.58
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