Protein–RNA interactions for Protein: P47095

MDE1, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, yeastyeast

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDE1P47095 NSR1YGR159C 1245 nt18.49■□□□□ 0.55
MDE1P47095 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.4■□□□□ 0.54
MDE1P47095 NOP1YDL014W 984 nt17.89■□□□□ 0.45
MDE1P47095 MDJ1YFL016C 1536 nt16.53■□□□□ 0.24
MDE1P47095 YKL036CYKL036C 393 nt16.23■□□□□ 0.19
MDE1P47095 SRX1YKL086W 384 nt15.54■□□□□ 0.08
MDE1P47095 Q0297Q0297 156 nt15.49■□□□□ 0.07
MDE1P47095 YJL027CYJL027C 417 nt15.36■□□□□ 0.05
MDE1P47095 YCR051WYCR051W 669 nt14.75□□□□□ -0.05
MDE1P47095 SSA3YBL075C 1950 nt14.62□□□□□ -0.07
MDE1P47095 SCS3YGL126W 1143 nt14.58□□□□□ -0.08
MDE1P47095 DBP2YNL112W 1641 nt14.47□□□□□ -0.09
MDE1P47095 YBR190WYBR190W 312 nt14.23□□□□□ -0.13
MDE1P47095 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.15□□□□□ -0.14
MDE1P47095 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.15□□□□□ -0.14
MDE1P47095 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.15□□□□□ -0.14
MDE1P47095 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.15□□□□□ -0.14
MDE1P47095 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.15□□□□□ -0.14
MDE1P47095 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.15□□□□□ -0.14
MDE1P47095 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.15□□□□□ -0.14
MDE1P47095 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.15□□□□□ -0.14
MDE1P47095 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.15□□□□□ -0.14
MDE1P47095 CCC1YLR220W 969 nt14.03□□□□□ -0.16
MDE1P47095 YOL085CYOL085C 342 nt14□□□□□ -0.17
MDE1P47095 RTC3YHR087W 336 nt13.94□□□□□ -0.18
MDE1P47095 RPP1BYDL130W 321 nt13.9□□□□□ -0.18
MDE1P47095 PKP1YIL042C 1185 nt13.8□□□□□ -0.2
MDE1P47095 RVS167YDR388W 1449 nt13.8□□□□□ -0.2
MDE1P47095 SCJ1YMR214W 1134 nt13.47□□□□□ -0.25
MDE1P47095 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.32□□□□□ -0.28
MDE1P47095 PET122YER153C 765 nt13.27□□□□□ -0.29
MDE1P47095 SCR1SCR1 522 nt13.21□□□□□ -0.29
MDE1P47095 SHR5YOL110W 714 nt13.18□□□□□ -0.3
MDE1P47095 ATS1YAL020C 1002 nt12.99□□□□□ -0.33
MDE1P47095 PUT4YOR348C 1884 nt12.99□□□□□ -0.33
MDE1P47095 YDJ1YNL064C 1230 nt12.92□□□□□ -0.34
MDE1P47095 URN1YPR152C 1398 nt12.92□□□□□ -0.34
MDE1P47095 RRN5YLR141W 1092 nt12.87□□□□□ -0.35
MDE1P47095 RPN10YHR200W 807 nt12.81□□□□□ -0.36
MDE1P47095 DEP1YAL013W 1218 nt12.81□□□□□ -0.36
MDE1P47095 OPI9YLR338W 858 nt12.77□□□□□ -0.37
MDE1P47095 SAH1YER043C 1350 nt12.7□□□□□ -0.38
MDE1P47095 ARE1YCR048W 1833 nt12.68□□□□□ -0.38
MDE1P47095 YNL208WYNL208W 600 nt12.67□□□□□ -0.38
MDE1P47095 SPT5YML010W 3192 nt12.67□□□□□ -0.38
MDE1P47095 Q0182Q0182 405 nt12.65□□□□□ -0.38
MDE1P47095 GAR1YHR089C 618 nt12.65□□□□□ -0.38
MDE1P47095 POA1YBR022W 534 nt12.61□□□□□ -0.39
MDE1P47095 SSA4YER103W 1929 nt12.6□□□□□ -0.39
MDE1P47095 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.6□□□□□ -0.39
MDE1P47095 RSB1YOR049C 1065 nt12.6□□□□□ -0.39
MDE1P47095 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.59□□□□□ -0.39
MDE1P47095 PUN1YLR414C 792 nt12.47□□□□□ -0.41
MDE1P47095 BSC6YOL137W 1494 nt12.38□□□□□ -0.43
MDE1P47095 YJR018WYJR018W 363 nt12.33□□□□□ -0.44
MDE1P47095 BUD23YCR047C 828 nt12.32□□□□□ -0.44
MDE1P47095 BDF1YLR399C 2061 nt12.32□□□□□ -0.44
MDE1P47095 PTC2YER089C 1395 nt12.29□□□□□ -0.44
MDE1P47095 TIR1YER011W 765 nt12.24□□□□□ -0.45
MDE1P47095 PAC11YDR488C 1602 nt12.22□□□□□ -0.45
MDE1P47095 NAB2YGL122C 1578 nt12.18□□□□□ -0.46
MDE1P47095 SSA1YAL005C 1929 nt12.13□□□□□ -0.47
MDE1P47095 RPP2BYDR382W 333 nt12.12□□□□□ -0.47
MDE1P47095 NVJ2YPR091C 2313 nt12.1□□□□□ -0.47
MDE1P47095 TAT1YBR069C 1860 nt12.09□□□□□ -0.47
MDE1P47095 PST2YDR032C 597 nt12.04□□□□□ -0.48
MDE1P47095 DAL1YIR027C 1383 nt11.98□□□□□ -0.49
MDE1P47095 FPR4YLR449W 1179 nt11.97□□□□□ -0.49
MDE1P47095 INM2YDR287W 879 nt11.96□□□□□ -0.49
MDE1P47095 YJR120WYJR120W 351 nt11.93□□□□□ -0.5
MDE1P47095 FIS1YIL065C 468 nt11.91□□□□□ -0.5
MDE1P47095 MOT3YMR070W 1473 nt11.89□□□□□ -0.51
MDE1P47095 PHO4YFR034C 939 nt11.84□□□□□ -0.51
MDE1P47095 YBL100CYBL100C 315 nt11.78□□□□□ -0.52
MDE1P47095 BDH2YAL061W 1254 nt11.75□□□□□ -0.53
MDE1P47095 SRB2YHR041C 633 nt11.69□□□□□ -0.54
MDE1P47095 YPS1YLR120C 1710 nt11.66□□□□□ -0.54
MDE1P47095 MEP2YNL142W 1500 nt11.64□□□□□ -0.55
MDE1P47095 FPS1YLL043W 2010 nt11.64□□□□□ -0.55
MDE1P47095 WWM1YFL010C 636 nt11.62□□□□□ -0.55
MDE1P47095 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.62□□□□□ -0.55
MDE1P47095 YGR021WYGR021W 873 nt11.61□□□□□ -0.55
MDE1P47095 TRM9YML014W 840 nt11.61□□□□□ -0.55
MDE1P47095 FUN26YAL022C 1554 nt11.61□□□□□ -0.55
MDE1P47095 SHU1YHL006C 453 nt11.59□□□□□ -0.55
MDE1P47095 ALF1YNL148C 765 nt11.59□□□□□ -0.55
MDE1P47095 LSM3YLR438C-A 270 nt11.58□□□□□ -0.56
MDE1P47095 YDR095CYDR095C 411 nt11.57□□□□□ -0.56
MDE1P47095 YKL097CYKL097C 411 nt11.54□□□□□ -0.56
MDE1P47095 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.51□□□□□ -0.57
MDE1P47095 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.47□□□□□ -0.57
MDE1P47095 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.47□□□□□ -0.57
MDE1P47095 DCW1YKL046C 1350 nt11.46□□□□□ -0.57
MDE1P47095 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.46□□□□□ -0.57
MDE1P47095 HOM6YJR139C 1080 nt11.45□□□□□ -0.58
MDE1P47095 CCT6YDR188W 1641 nt11.45□□□□□ -0.58
MDE1P47095 YBR220CYBR220C 1683 nt11.43□□□□□ -0.58
MDE1P47095 YMR090WYMR090W 684 nt11.39□□□□□ -0.59
MDE1P47095 RPP2AYOL039W 321 nt11.39□□□□□ -0.59
MDE1P47095 MNP1YGL068W 585 nt11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.4 ms