Protein–RNA interactions for Protein: P40463

VHS2, Protein VHS2, yeastyeast

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS2P40463 NSR1YGR159C 1245 nt15.15■□□□□ 0.02
VHS2P40463 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.13■□□□□ 0.01
VHS2P40463 NOP1YDL014W 984 nt14.68□□□□□ -0.06
VHS2P40463 MDJ1YFL016C 1536 nt13.55□□□□□ -0.24
VHS2P40463 YKL036CYKL036C 393 nt13.4□□□□□ -0.26
VHS2P40463 SRX1YKL086W 384 nt12.79□□□□□ -0.36
VHS2P40463 Q0297Q0297 156 nt12.77□□□□□ -0.37
VHS2P40463 YJL027CYJL027C 417 nt12.53□□□□□ -0.4
VHS2P40463 YCR051WYCR051W 669 nt12.16□□□□□ -0.46
VHS2P40463 SCS3YGL126W 1143 nt12.11□□□□□ -0.47
VHS2P40463 DBP2YNL112W 1641 nt11.93□□□□□ -0.5
VHS2P40463 Q0182Q0182 405 nt11.8□□□□□ -0.52
VHS2P40463 YBR190WYBR190W 312 nt11.64□□□□□ -0.55
VHS2P40463 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.63□□□□□ -0.55
VHS2P40463 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.63□□□□□ -0.55
VHS2P40463 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.63□□□□□ -0.55
VHS2P40463 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.63□□□□□ -0.55
VHS2P40463 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.63□□□□□ -0.55
VHS2P40463 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.63□□□□□ -0.55
VHS2P40463 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.63□□□□□ -0.55
VHS2P40463 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.63□□□□□ -0.55
VHS2P40463 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.63□□□□□ -0.55
VHS2P40463 YOL085CYOL085C 342 nt11.59□□□□□ -0.55
VHS2P40463 CCC1YLR220W 969 nt11.56□□□□□ -0.56
VHS2P40463 RPP1BYDL130W 321 nt11.47□□□□□ -0.57
VHS2P40463 SSA3YBL075C 1950 nt11.47□□□□□ -0.57
VHS2P40463 PKP1YIL042C 1185 nt11.44□□□□□ -0.58
VHS2P40463 RTC3YHR087W 336 nt11.37□□□□□ -0.59
VHS2P40463 RVS167YDR388W 1449 nt11.25□□□□□ -0.61
VHS2P40463 MOT3YMR070W 1473 nt11.17□□□□□ -0.62
VHS2P40463 SCJ1YMR214W 1134 nt11.08□□□□□ -0.64
VHS2P40463 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.97□□□□□ -0.65
VHS2P40463 PET122YER153C 765 nt10.96□□□□□ -0.65
VHS2P40463 SCR1SCR1 522 nt10.85□□□□□ -0.67
VHS2P40463 ATS1YAL020C 1002 nt10.8□□□□□ -0.68
VHS2P40463 SHR5YOL110W 714 nt10.79□□□□□ -0.68
VHS2P40463 PUT4YOR348C 1884 nt10.76□□□□□ -0.69
VHS2P40463 RRN5YLR141W 1092 nt10.64□□□□□ -0.71
VHS2P40463 YDJ1YNL064C 1230 nt10.62□□□□□ -0.71
VHS2P40463 URN1YPR152C 1398 nt10.58□□□□□ -0.72
VHS2P40463 DEP1YAL013W 1218 nt10.54□□□□□ -0.72
VHS2P40463 OPI9YLR338W 858 nt10.46□□□□□ -0.73
VHS2P40463 ARE1YCR048W 1833 nt10.43□□□□□ -0.74
VHS2P40463 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.43□□□□□ -0.74
VHS2P40463 GAR1YHR089C 618 nt10.41□□□□□ -0.74
VHS2P40463 RPN10YHR200W 807 nt10.41□□□□□ -0.74
VHS2P40463 SAH1YER043C 1350 nt10.4□□□□□ -0.74
VHS2P40463 RSB1YOR049C 1065 nt10.4□□□□□ -0.74
VHS2P40463 SSA1YAL005C 1929 nt10.37□□□□□ -0.75
VHS2P40463 YNL208WYNL208W 600 nt10.36□□□□□ -0.75
VHS2P40463 SPT5YML010W 3192 nt10.35□□□□□ -0.75
VHS2P40463 POA1YBR022W 534 nt10.29□□□□□ -0.76
VHS2P40463 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.28□□□□□ -0.76
VHS2P40463 BSC6YOL137W 1494 nt10.2□□□□□ -0.78
VHS2P40463 PUN1YLR414C 792 nt10.16□□□□□ -0.78
VHS2P40463 SSA4YER103W 1929 nt10.14□□□□□ -0.79
VHS2P40463 YJR018WYJR018W 363 nt10.08□□□□□ -0.8
VHS2P40463 TIR1YER011W 765 nt10.07□□□□□ -0.8
VHS2P40463 PTC2YER089C 1395 nt10.04□□□□□ -0.8
VHS2P40463 BUD23YCR047C 828 nt10.04□□□□□ -0.8
VHS2P40463 PST2YDR032C 597 nt10.01□□□□□ -0.81
VHS2P40463 NAB2YGL122C 1578 nt9.95□□□□□ -0.82
VHS2P40463 BDF1YLR399C 2061 nt9.88□□□□□ -0.83
VHS2P40463 RPP2BYDR382W 333 nt9.87□□□□□ -0.83
VHS2P40463 YJR120WYJR120W 351 nt9.87□□□□□ -0.83
VHS2P40463 FIS1YIL065C 468 nt9.79□□□□□ -0.84
VHS2P40463 DAL1YIR027C 1383 nt9.78□□□□□ -0.84
VHS2P40463 FPR4YLR449W 1179 nt9.78□□□□□ -0.84
VHS2P40463 INM2YDR287W 879 nt9.75□□□□□ -0.85
VHS2P40463 TAT1YBR069C 1860 nt9.74□□□□□ -0.85
VHS2P40463 SRB2YHR041C 633 nt9.72□□□□□ -0.85
VHS2P40463 FPS1YLL043W 2010 nt9.72□□□□□ -0.85
VHS2P40463 YJL225CYJL225C 5277 nt9.7□□□□□ -0.86
VHS2P40463 MEP2YNL142W 1500 nt9.67□□□□□ -0.86
VHS2P40463 PHO4YFR034C 939 nt9.67□□□□□ -0.86
VHS2P40463 SHU1YHL006C 453 nt9.64□□□□□ -0.87
VHS2P40463 BDH2YAL061W 1254 nt9.63□□□□□ -0.87
VHS2P40463 YBL100CYBL100C 315 nt9.62□□□□□ -0.87
VHS2P40463 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.61□□□□□ -0.87
VHS2P40463 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.61□□□□□ -0.87
VHS2P40463 WWM1YFL010C 636 nt9.59□□□□□ -0.87
VHS2P40463 YPS1YLR120C 1710 nt9.57□□□□□ -0.88
VHS2P40463 YKL097CYKL097C 411 nt9.57□□□□□ -0.88
VHS2P40463 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt9.55□□□□□ -0.88
VHS2P40463 YGR021WYGR021W 873 nt9.52□□□□□ -0.89
VHS2P40463 FUN26YAL022C 1554 nt9.5□□□□□ -0.89
VHS2P40463 YDR095CYDR095C 411 nt9.5□□□□□ -0.89
VHS2P40463 TRM9YML014W 840 nt9.49□□□□□ -0.89
VHS2P40463 LSM3YLR438C-A 270 nt9.47□□□□□ -0.89
VHS2P40463 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.45□□□□□ -0.9
VHS2P40463 HOM6YJR139C 1080 nt9.45□□□□□ -0.9
VHS2P40463 DCW1YKL046C 1350 nt9.45□□□□□ -0.9
VHS2P40463 PAC11YDR488C 1602 nt9.45□□□□□ -0.9
VHS2P40463 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.44□□□□□ -0.9
VHS2P40463 ALF1YNL148C 765 nt9.42□□□□□ -0.9
VHS2P40463 YBR220CYBR220C 1683 nt9.41□□□□□ -0.9
VHS2P40463 MNP1YGL068W 585 nt9.38□□□□□ -0.91
VHS2P40463 RPM1RPM1 483 nt9.38□□□□□ -0.91
VHS2P40463 CCT6YDR188W 1641 nt9.38□□□□□ -0.91
VHS2P40463 EMI2YDR516C 1503 nt9.33□□□□□ -0.92
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