RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	OCA2	P53949	197 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	HOT1	Q03213	719 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	SOR2	Q07786	357 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	GPM3	Q12326	303 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	PEX5	P35056	612 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	MMS4	P38257	691 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	YHR054C	P38780	354 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	RPH1	P39956	796 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	TOM22	P49334	152 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	AVT4	P50944	713 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	YIP1	P53039	248 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	GYL1	Q04322	720 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	VPS54	Q12071	889 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	HSP42	Q12329	375 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	SET6	Q12529	373 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	CYB2	P00175	591 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	SCEI	P03882	235 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	RSM22	P36056	628 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	RTT107	P38850	1070 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	RRT5	P43607	289 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	PNG1	Q02890	363 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	CTF3	Q12748	733 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	COX3	P00420	269 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	ATR1	P13090	542 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	YCR100C	P25606	316 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	YAT2	P40017	923 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
RPC17	YJL011C	YDL186W	P48568	277 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	COS10	P52924	374 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	YGR111W	P53265	400 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	CRZ1	P53968	678 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	UAF30	Q08747	228 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	TIP41	Q12199	356 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	SPO7	P18410	259 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	AGA1	P32323	725 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	NDI1	P32340	513 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	LTV1	P34078	463 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	MDM31	P38880	579 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	VHS2	P40463	436 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	YJL213W	P40896	331 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	YJL132W	P47014	750 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	POP6	P53218	158 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	ODC1	Q03028	310 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	PIR3	Q03180	325 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	MTR10	Q99189	972 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	RRN10	P38204	145 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	EFM4	P40516	257 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	PHO86	P46956	311 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	YJL055W	P47044	245 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	WSC2	P53832	503 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	MED2	Q12124	431 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	MNE1	P24720	663 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	CTR86	P25355	563 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	HEL1	P36113	551 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	PCA1	P38360	1216 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	MEP2	P41948	499 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	VPS9	P54787	451 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	MRP51	Q02950	344 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	ERO1	Q03103	563 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	ITR1	P30605	584 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	FAD1	P38913	306 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	JEM1	P40358	645 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	HMS2	P47175	358 aa		4.01	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.6 ms