Protein–RNA interactions for Protein: Q12250

RPN5, 26S proteasome regulatory subunit RPN5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN5Q12250 NSR1YGR159C 1245 nt19.6■□□□□ 0.73
RPN5Q12250 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.48■□□□□ 0.71
RPN5Q12250 NOP1YDL014W 984 nt18.94■□□□□ 0.62
RPN5Q12250 MDJ1YFL016C 1536 nt17.48■□□□□ 0.39
RPN5Q12250 YKL036CYKL036C 393 nt17.28■□□□□ 0.36
RPN5Q12250 SRX1YKL086W 384 nt16.53■□□□□ 0.24
RPN5Q12250 Q0297Q0297 156 nt16.52■□□□□ 0.24
RPN5Q12250 YJL027CYJL027C 417 nt16.17■□□□□ 0.18
RPN5Q12250 YCR051WYCR051W 669 nt15.63■□□□□ 0.09
RPN5Q12250 SCS3YGL126W 1143 nt15.59■□□□□ 0.09
RPN5Q12250 DBP2YNL112W 1641 nt15.43■□□□□ 0.06
RPN5Q12250 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.04■□□□□ -0
RPN5Q12250 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.04■□□□□ -0
RPN5Q12250 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.04■□□□□ -0
RPN5Q12250 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.04■□□□□ -0
RPN5Q12250 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.04■□□□□ -0
RPN5Q12250 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.04■□□□□ -0
RPN5Q12250 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.04■□□□□ -0
RPN5Q12250 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.04■□□□□ -0
RPN5Q12250 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.04■□□□□ -0
RPN5Q12250 YBR190WYBR190W 312 nt15.03■□□□□ -0
RPN5Q12250 YOL085CYOL085C 342 nt14.96□□□□□ -0.01
RPN5Q12250 CCC1YLR220W 969 nt14.82□□□□□ -0.04
RPN5Q12250 RPP1BYDL130W 321 nt14.81□□□□□ -0.04
RPN5Q12250 PKP1YIL042C 1185 nt14.69□□□□□ -0.06
RPN5Q12250 RTC3YHR087W 336 nt14.62□□□□□ -0.07
RPN5Q12250 RVS167YDR388W 1449 nt14.49□□□□□ -0.09
RPN5Q12250 SCJ1YMR214W 1134 nt14.32□□□□□ -0.12
RPN5Q12250 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.17□□□□□ -0.14
RPN5Q12250 PET122YER153C 765 nt14.13□□□□□ -0.15
RPN5Q12250 SCR1SCR1 522 nt13.97□□□□□ -0.17
RPN5Q12250 SHR5YOL110W 714 nt13.95□□□□□ -0.18
RPN5Q12250 ATS1YAL020C 1002 nt13.92□□□□□ -0.18
RPN5Q12250 YDJ1YNL064C 1230 nt13.76□□□□□ -0.21
RPN5Q12250 PUT4YOR348C 1884 nt13.76□□□□□ -0.21
RPN5Q12250 RRN5YLR141W 1092 nt13.71□□□□□ -0.21
RPN5Q12250 URN1YPR152C 1398 nt13.64□□□□□ -0.23
RPN5Q12250 SSA3YBL075C 1950 nt13.55□□□□□ -0.24
RPN5Q12250 DEP1YAL013W 1218 nt13.53□□□□□ -0.24
RPN5Q12250 OPI9YLR338W 858 nt13.52□□□□□ -0.25
RPN5Q12250 RPN10YHR200W 807 nt13.45□□□□□ -0.26
RPN5Q12250 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.44□□□□□ -0.26
RPN5Q12250 ARE1YCR048W 1833 nt13.43□□□□□ -0.26
RPN5Q12250 SAH1YER043C 1350 nt13.43□□□□□ -0.26
RPN5Q12250 GAR1YHR089C 618 nt13.39□□□□□ -0.27
RPN5Q12250 YNL208WYNL208W 600 nt13.38□□□□□ -0.27
RPN5Q12250 RSB1YOR049C 1065 nt13.36□□□□□ -0.27
RPN5Q12250 POA1YBR022W 534 nt13.29□□□□□ -0.28
RPN5Q12250 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.25□□□□□ -0.29
RPN5Q12250 PUN1YLR414C 792 nt13.13□□□□□ -0.31
RPN5Q12250 BSC6YOL137W 1494 nt13.04□□□□□ -0.32
RPN5Q12250 YJR018WYJR018W 363 nt13.02□□□□□ -0.33
RPN5Q12250 TIR1YER011W 765 nt12.99□□□□□ -0.33
RPN5Q12250 PTC2YER089C 1395 nt12.95□□□□□ -0.34
RPN5Q12250 PST2YDR032C 597 nt12.93□□□□□ -0.34
RPN5Q12250 BUD23YCR047C 828 nt12.92□□□□□ -0.34
RPN5Q12250 NAB2YGL122C 1578 nt12.85□□□□□ -0.35
RPN5Q12250 SSA1YAL005C 1929 nt12.84□□□□□ -0.35
RPN5Q12250 YJR120WYJR120W 351 nt12.76□□□□□ -0.37
RPN5Q12250 RPP2BYDR382W 333 nt12.73□□□□□ -0.37
RPN5Q12250 DAL1YIR027C 1383 nt12.64□□□□□ -0.39
RPN5Q12250 INM2YDR287W 879 nt12.62□□□□□ -0.39
RPN5Q12250 FIS1YIL065C 468 nt12.61□□□□□ -0.39
RPN5Q12250 SPT5YML010W 3192 nt12.59□□□□□ -0.39
RPN5Q12250 SRB2YHR041C 633 nt12.55□□□□□ -0.4
RPN5Q12250 FPR4YLR449W 1179 nt12.54□□□□□ -0.4
RPN5Q12250 PHO4YFR034C 939 nt12.5□□□□□ -0.41
RPN5Q12250 BDH2YAL061W 1254 nt12.44□□□□□ -0.42
RPN5Q12250 SHU1YHL006C 453 nt12.42□□□□□ -0.42
RPN5Q12250 YBL100CYBL100C 315 nt12.42□□□□□ -0.42
RPN5Q12250 Q0182Q0182 405 nt12.39□□□□□ -0.43
RPN5Q12250 WWM1YFL010C 636 nt12.35□□□□□ -0.43
RPN5Q12250 YPS1YLR120C 1710 nt12.33□□□□□ -0.44
RPN5Q12250 YKL097CYKL097C 411 nt12.31□□□□□ -0.44
RPN5Q12250 YGR021WYGR021W 873 nt12.29□□□□□ -0.44
RPN5Q12250 MEP2YNL142W 1500 nt12.28□□□□□ -0.44
RPN5Q12250 LSM3YLR438C-A 270 nt12.28□□□□□ -0.44
RPN5Q12250 FUN26YAL022C 1554 nt12.27□□□□□ -0.44
RPN5Q12250 YDR095CYDR095C 411 nt12.24□□□□□ -0.45
RPN5Q12250 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.23□□□□□ -0.45
RPN5Q12250 TRM9YML014W 840 nt12.23□□□□□ -0.45
RPN5Q12250 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.21□□□□□ -0.45
RPN5Q12250 HOM6YJR139C 1080 nt12.21□□□□□ -0.45
RPN5Q12250 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.19□□□□□ -0.46
RPN5Q12250 SSA4YER103W 1929 nt12.19□□□□□ -0.46
RPN5Q12250 ALF1YNL148C 765 nt12.14□□□□□ -0.47
RPN5Q12250 CCT6YDR188W 1641 nt12.13□□□□□ -0.47
RPN5Q12250 MNP1YGL068W 585 nt12.07□□□□□ -0.48
RPN5Q12250 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.05□□□□□ -0.48
RPN5Q12250 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.05□□□□□ -0.48
RPN5Q12250 RKM5YLR137W 1104 nt12.04□□□□□ -0.48
RPN5Q12250 DCW1YKL046C 1350 nt12.04□□□□□ -0.48
RPN5Q12250 RPP2AYOL039W 321 nt12.01□□□□□ -0.49
RPN5Q12250 SIS1YNL007C 1059 nt11.99□□□□□ -0.49
RPN5Q12250 PTP1YDL230W 1008 nt11.96□□□□□ -0.49
RPN5Q12250 EMI2YDR516C 1503 nt11.92□□□□□ -0.5
RPN5Q12250 YMR090WYMR090W 684 nt11.89□□□□□ -0.51
RPN5Q12250 YOL037CYOL037C 354 nt11.88□□□□□ -0.51
RPN5Q12250 CAC2YML102W 1407 nt11.86□□□□□ -0.51
RPN5Q12250 YDL221WYDL221W 552 nt11.84□□□□□ -0.51
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