Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.72■□□□□ 0.91
NDI1P32340 NSR1YGR159C 1245 nt20.71■□□□□ 0.91
NDI1P32340 NOP1YDL014W 984 nt20.17■□□□□ 0.82
NDI1P32340 YKL036CYKL036C 393 nt18.49■□□□□ 0.55
NDI1P32340 MDJ1YFL016C 1536 nt18.41■□□□□ 0.54
NDI1P32340 Q0297Q0297 156 nt17.61■□□□□ 0.41
NDI1P32340 SRX1YKL086W 384 nt17.6■□□□□ 0.41
NDI1P32340 YJL027CYJL027C 417 nt17.23■□□□□ 0.35
NDI1P32340 SCS3YGL126W 1143 nt16.75■□□□□ 0.27
NDI1P32340 YCR051WYCR051W 669 nt16.65■□□□□ 0.26
NDI1P32340 DBP2YNL112W 1641 nt16.26■□□□□ 0.19
NDI1P32340 YOL085CYOL085C 342 nt16■□□□□ 0.15
NDI1P32340 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.96■□□□□ 0.15
NDI1P32340 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.96■□□□□ 0.15
NDI1P32340 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.96■□□□□ 0.15
NDI1P32340 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.96■□□□□ 0.15
NDI1P32340 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.96■□□□□ 0.15
NDI1P32340 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.96■□□□□ 0.15
NDI1P32340 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.96■□□□□ 0.15
NDI1P32340 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.96■□□□□ 0.15
NDI1P32340 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.96■□□□□ 0.15
NDI1P32340 RPP1BYDL130W 321 nt15.79■□□□□ 0.12
NDI1P32340 YBR190WYBR190W 312 nt15.79■□□□□ 0.12
NDI1P32340 CCC1YLR220W 969 nt15.74■□□□□ 0.11
NDI1P32340 PKP1YIL042C 1185 nt15.72■□□□□ 0.11
NDI1P32340 RTC3YHR087W 336 nt15.39■□□□□ 0.05
NDI1P32340 RVS167YDR388W 1449 nt15.34■□□□□ 0.05
NDI1P32340 SCJ1YMR214W 1134 nt15.17■□□□□ 0.02
NDI1P32340 PET122YER153C 765 nt15.06■□□□□ 0
NDI1P32340 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.06■□□□□ 0
NDI1P32340 ATS1YAL020C 1002 nt14.96□□□□□ -0.01
NDI1P32340 SCR1SCR1 522 nt14.93□□□□□ -0.02
NDI1P32340 SHR5YOL110W 714 nt14.77□□□□□ -0.05
NDI1P32340 RRN5YLR141W 1092 nt14.62□□□□□ -0.07
NDI1P32340 YDJ1YNL064C 1230 nt14.6□□□□□ -0.07
NDI1P32340 URN1YPR152C 1398 nt14.38□□□□□ -0.11
NDI1P32340 PUT4YOR348C 1884 nt14.36□□□□□ -0.11
NDI1P32340 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.34□□□□□ -0.11
NDI1P32340 DEP1YAL013W 1218 nt14.31□□□□□ -0.12
NDI1P32340 RSB1YOR049C 1065 nt14.3□□□□□ -0.12
NDI1P32340 GAR1YHR089C 618 nt14.24□□□□□ -0.13
NDI1P32340 RPN10YHR200W 807 nt14.21□□□□□ -0.13
NDI1P32340 OPI9YLR338W 858 nt14.21□□□□□ -0.13
NDI1P32340 YNL208WYNL208W 600 nt14.15□□□□□ -0.14
NDI1P32340 SSA3YBL075C 1950 nt14.11□□□□□ -0.15
NDI1P32340 SAH1YER043C 1350 nt14.09□□□□□ -0.15
NDI1P32340 ARE1YCR048W 1833 nt14.06□□□□□ -0.16
NDI1P32340 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.9□□□□□ -0.18
NDI1P32340 POA1YBR022W 534 nt13.89□□□□□ -0.19
NDI1P32340 PST2YDR032C 597 nt13.87□□□□□ -0.19
NDI1P32340 PUN1YLR414C 792 nt13.82□□□□□ -0.2
NDI1P32340 TIR1YER011W 765 nt13.78□□□□□ -0.2
NDI1P32340 YJR018WYJR018W 363 nt13.73□□□□□ -0.21
NDI1P32340 BSC6YOL137W 1494 nt13.62□□□□□ -0.23
NDI1P32340 PTC2YER089C 1395 nt13.62□□□□□ -0.23
NDI1P32340 SSA1YAL005C 1929 nt13.6□□□□□ -0.23
NDI1P32340 BUD23YCR047C 828 nt13.56□□□□□ -0.24
NDI1P32340 NAB2YGL122C 1578 nt13.49□□□□□ -0.25
NDI1P32340 RPP2BYDR382W 333 nt13.46□□□□□ -0.25
NDI1P32340 YJR120WYJR120W 351 nt13.46□□□□□ -0.25
NDI1P32340 SHU1YHL006C 453 nt13.31□□□□□ -0.28
NDI1P32340 SRB2YHR041C 633 nt13.31□□□□□ -0.28
NDI1P32340 DAL1YIR027C 1383 nt13.29□□□□□ -0.28
NDI1P32340 INM2YDR287W 879 nt13.28□□□□□ -0.28
NDI1P32340 YKL097CYKL097C 411 nt13.28□□□□□ -0.28
NDI1P32340 FIS1YIL065C 468 nt13.27□□□□□ -0.29
NDI1P32340 FPR4YLR449W 1179 nt13.21□□□□□ -0.29
NDI1P32340 BDH2YAL061W 1254 nt13.16□□□□□ -0.3
NDI1P32340 PHO4YFR034C 939 nt13.15□□□□□ -0.3
NDI1P32340 WWM1YFL010C 636 nt13.13□□□□□ -0.31
NDI1P32340 YGR021WYGR021W 873 nt13.11□□□□□ -0.31
NDI1P32340 YBL100CYBL100C 315 nt13.11□□□□□ -0.31
NDI1P32340 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.09□□□□□ -0.31
NDI1P32340 SPT5YML010W 3192 nt13.02□□□□□ -0.33
NDI1P32340 HOM6YJR139C 1080 nt13.01□□□□□ -0.33
NDI1P32340 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.99□□□□□ -0.33
NDI1P32340 LSM3YLR438C-A 270 nt12.99□□□□□ -0.33
NDI1P32340 FUN26YAL022C 1554 nt12.94□□□□□ -0.34
NDI1P32340 YPS1YLR120C 1710 nt12.93□□□□□ -0.34
NDI1P32340 TRM9YML014W 840 nt12.92□□□□□ -0.34
NDI1P32340 MNP1YGL068W 585 nt12.89□□□□□ -0.35
NDI1P32340 YDR095CYDR095C 411 nt12.84□□□□□ -0.35
NDI1P32340 RKM5YLR137W 1104 nt12.82□□□□□ -0.36
NDI1P32340 MEP2YNL142W 1500 nt12.81□□□□□ -0.36
NDI1P32340 CCT6YDR188W 1641 nt12.8□□□□□ -0.36
NDI1P32340 ALF1YNL148C 765 nt12.79□□□□□ -0.36
NDI1P32340 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.78□□□□□ -0.36
NDI1P32340 YOR139CYOR139C 393 nt12.74□□□□□ -0.37
NDI1P32340 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.72□□□□□ -0.37
NDI1P32340 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.72□□□□□ -0.37
NDI1P32340 YOL037CYOL037C 354 nt12.72□□□□□ -0.37
NDI1P32340 NPL3YDR432W 1245 nt12.69□□□□□ -0.38
NDI1P32340 SSA4YER103W 1929 nt12.65□□□□□ -0.38
NDI1P32340 RPP2AYOL039W 321 nt12.61□□□□□ -0.39
NDI1P32340 SIS1YNL007C 1059 nt12.6□□□□□ -0.39
NDI1P32340 DCW1YKL046C 1350 nt12.56□□□□□ -0.4
NDI1P32340 PTP1YDL230W 1008 nt12.52□□□□□ -0.41
NDI1P32340 EMI2YDR516C 1503 nt12.45□□□□□ -0.42
NDI1P32340 CAC2YML102W 1407 nt12.41□□□□□ -0.42
NDI1P32340 YMR090WYMR090W 684 nt12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms