Protein–RNA interactions for Protein: Q03016

GIP3, GLC7-interacting protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIP3Q03016 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.74■□□□□ 0.75
GIP3Q03016 NSR1YGR159C 1245 nt19.59■□□□□ 0.73
GIP3Q03016 NOP1YDL014W 984 nt19.09■□□□□ 0.65
GIP3Q03016 MDJ1YFL016C 1536 nt17.57■□□□□ 0.4
GIP3Q03016 YKL036CYKL036C 393 nt17.56■□□□□ 0.4
GIP3Q03016 SRX1YKL086W 384 nt16.68■□□□□ 0.26
GIP3Q03016 Q0297Q0297 156 nt16.67■□□□□ 0.26
GIP3Q03016 YJL027CYJL027C 417 nt16.4■□□□□ 0.22
GIP3Q03016 SCS3YGL126W 1143 nt15.96■□□□□ 0.15
GIP3Q03016 YCR051WYCR051W 669 nt15.86■□□□□ 0.13
GIP3Q03016 DBP2YNL112W 1641 nt15.46■□□□□ 0.07
GIP3Q03016 YOL085CYOL085C 342 nt15.2■□□□□ 0.02
GIP3Q03016 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.16■□□□□ 0.02
GIP3Q03016 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.16■□□□□ 0.02
GIP3Q03016 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.16■□□□□ 0.02
GIP3Q03016 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.16■□□□□ 0.02
GIP3Q03016 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.16■□□□□ 0.02
GIP3Q03016 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.16■□□□□ 0.02
GIP3Q03016 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.16■□□□□ 0.02
GIP3Q03016 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.16■□□□□ 0.02
GIP3Q03016 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.16■□□□□ 0.02
GIP3Q03016 PKP1YIL042C 1185 nt15.03■□□□□ -0
GIP3Q03016 CCC1YLR220W 969 nt15.02■□□□□ -0
GIP3Q03016 RPP1BYDL130W 321 nt14.98□□□□□ -0.01
GIP3Q03016 YBR190WYBR190W 312 nt14.94□□□□□ -0.02
GIP3Q03016 RTC3YHR087W 336 nt14.65□□□□□ -0.06
GIP3Q03016 RVS167YDR388W 1449 nt14.54□□□□□ -0.08
GIP3Q03016 SCJ1YMR214W 1134 nt14.49□□□□□ -0.09
GIP3Q03016 PET122YER153C 765 nt14.36□□□□□ -0.11
GIP3Q03016 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.3□□□□□ -0.12
GIP3Q03016 ATS1YAL020C 1002 nt14.21□□□□□ -0.13
GIP3Q03016 SCR1SCR1 522 nt14.16□□□□□ -0.14
GIP3Q03016 SHR5YOL110W 714 nt14□□□□□ -0.17
GIP3Q03016 RRN5YLR141W 1092 nt13.9□□□□□ -0.18
GIP3Q03016 YDJ1YNL064C 1230 nt13.82□□□□□ -0.2
GIP3Q03016 DEP1YAL013W 1218 nt13.68□□□□□ -0.22
GIP3Q03016 URN1YPR152C 1398 nt13.68□□□□□ -0.22
GIP3Q03016 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.63□□□□□ -0.23
GIP3Q03016 RSB1YOR049C 1065 nt13.63□□□□□ -0.23
GIP3Q03016 PUT4YOR348C 1884 nt13.63□□□□□ -0.23
GIP3Q03016 GAR1YHR089C 618 nt13.56□□□□□ -0.24
GIP3Q03016 SSA3YBL075C 1950 nt13.51□□□□□ -0.25
GIP3Q03016 OPI9YLR338W 858 nt13.47□□□□□ -0.25
GIP3Q03016 RPN10YHR200W 807 nt13.45□□□□□ -0.26
GIP3Q03016 SAH1YER043C 1350 nt13.43□□□□□ -0.26
GIP3Q03016 YNL208WYNL208W 600 nt13.41□□□□□ -0.26
GIP3Q03016 ARE1YCR048W 1833 nt13.36□□□□□ -0.27
GIP3Q03016 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.26□□□□□ -0.29
GIP3Q03016 POA1YBR022W 534 nt13.21□□□□□ -0.29
GIP3Q03016 PST2YDR032C 597 nt13.15□□□□□ -0.3
GIP3Q03016 TIR1YER011W 765 nt13.1□□□□□ -0.31
GIP3Q03016 PUN1YLR414C 792 nt13.09□□□□□ -0.31
GIP3Q03016 YJR018WYJR018W 363 nt13.03□□□□□ -0.32
GIP3Q03016 BSC6YOL137W 1494 nt12.97□□□□□ -0.33
GIP3Q03016 SSA1YAL005C 1929 nt12.96□□□□□ -0.34
GIP3Q03016 PTC2YER089C 1395 nt12.94□□□□□ -0.34
GIP3Q03016 BUD23YCR047C 828 nt12.94□□□□□ -0.34
GIP3Q03016 YJR120WYJR120W 351 nt12.84□□□□□ -0.35
GIP3Q03016 NAB2YGL122C 1578 nt12.77□□□□□ -0.37
GIP3Q03016 RPP2BYDR382W 333 nt12.75□□□□□ -0.37
GIP3Q03016 SRB2YHR041C 633 nt12.75□□□□□ -0.37
GIP3Q03016 SHU1YHL006C 453 nt12.68□□□□□ -0.38
GIP3Q03016 FIS1YIL065C 468 nt12.64□□□□□ -0.39
GIP3Q03016 YKL097CYKL097C 411 nt12.64□□□□□ -0.39
GIP3Q03016 FPR4YLR449W 1179 nt12.62□□□□□ -0.39
GIP3Q03016 DAL1YIR027C 1383 nt12.6□□□□□ -0.39
GIP3Q03016 INM2YDR287W 879 nt12.54□□□□□ -0.4
GIP3Q03016 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.53□□□□□ -0.4
GIP3Q03016 WWM1YFL010C 636 nt12.52□□□□□ -0.41
GIP3Q03016 PHO4YFR034C 939 nt12.51□□□□□ -0.41
GIP3Q03016 BDH2YAL061W 1254 nt12.47□□□□□ -0.41
GIP3Q03016 YBL100CYBL100C 315 nt12.47□□□□□ -0.41
GIP3Q03016 YGR021WYGR021W 873 nt12.41□□□□□ -0.42
GIP3Q03016 HOM6YJR139C 1080 nt12.36□□□□□ -0.43
GIP3Q03016 MNP1YGL068W 585 nt12.35□□□□□ -0.43
GIP3Q03016 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.31□□□□□ -0.44
GIP3Q03016 FUN26YAL022C 1554 nt12.3□□□□□ -0.44
GIP3Q03016 SPT5YML010W 3192 nt12.29□□□□□ -0.44
GIP3Q03016 YPS1YLR120C 1710 nt12.26□□□□□ -0.45
GIP3Q03016 LSM3YLR438C-A 270 nt12.26□□□□□ -0.45
GIP3Q03016 TRM9YML014W 840 nt12.23□□□□□ -0.45
GIP3Q03016 YDR095CYDR095C 411 nt12.19□□□□□ -0.46
GIP3Q03016 RKM5YLR137W 1104 nt12.19□□□□□ -0.46
GIP3Q03016 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.17□□□□□ -0.46
GIP3Q03016 ALF1YNL148C 765 nt12.16□□□□□ -0.46
GIP3Q03016 MEP2YNL142W 1500 nt12.15□□□□□ -0.46
GIP3Q03016 YOR139CYOR139C 393 nt12.14□□□□□ -0.47
GIP3Q03016 CCT6YDR188W 1641 nt12.12□□□□□ -0.47
GIP3Q03016 NPL3YDR432W 1245 nt12.08□□□□□ -0.48
GIP3Q03016 YOL037CYOL037C 354 nt12.07□□□□□ -0.48
GIP3Q03016 SSA4YER103W 1929 nt12.05□□□□□ -0.48
GIP3Q03016 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.03□□□□□ -0.48
GIP3Q03016 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.03□□□□□ -0.48
GIP3Q03016 DCW1YKL046C 1350 nt11.99□□□□□ -0.49
GIP3Q03016 RPP2AYOL039W 321 nt11.95□□□□□ -0.5
GIP3Q03016 SIS1YNL007C 1059 nt11.92□□□□□ -0.5
GIP3Q03016 PTP1YDL230W 1008 nt11.9□□□□□ -0.5
GIP3Q03016 EMI2YDR516C 1503 nt11.82□□□□□ -0.52
GIP3Q03016 CAC2YML102W 1407 nt11.82□□□□□ -0.52
GIP3Q03016 ART5YGR068C 1761 nt11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.3 ms