Protein–RNA interactions for Protein: Q03180

PIR3, Cell wall mannoprotein PIR3, yeastyeast

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3Q03180 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.21■□□□□ 0.99
PIR3Q03180 NSR1YGR159C 1245 nt20.86■□□□□ 0.93
PIR3Q03180 NOP1YDL014W 984 nt20.61■□□□□ 0.89
PIR3Q03180 YKL036CYKL036C 393 nt19.22■□□□□ 0.67
PIR3Q03180 MDJ1YFL016C 1536 nt18.45■□□□□ 0.54
PIR3Q03180 Q0297Q0297 156 nt18.13■□□□□ 0.49
PIR3Q03180 SRX1YKL086W 384 nt18.05■□□□□ 0.48
PIR3Q03180 YJL027CYJL027C 417 nt17.98■□□□□ 0.47
PIR3Q03180 SCS3YGL126W 1143 nt17.61■□□□□ 0.41
PIR3Q03180 YCR051WYCR051W 669 nt17.15■□□□□ 0.34
PIR3Q03180 YOL085CYOL085C 342 nt16.66■□□□□ 0.26
PIR3Q03180 PKP1YIL042C 1185 nt16.42■□□□□ 0.22
PIR3Q03180 DBP2YNL112W 1641 nt16.38■□□□□ 0.21
PIR3Q03180 RPP1BYDL130W 321 nt16.27■□□□□ 0.2
PIR3Q03180 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.24■□□□□ 0.19
PIR3Q03180 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.24■□□□□ 0.19
PIR3Q03180 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.24■□□□□ 0.19
PIR3Q03180 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.24■□□□□ 0.19
PIR3Q03180 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.24■□□□□ 0.19
PIR3Q03180 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.24■□□□□ 0.19
PIR3Q03180 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.24■□□□□ 0.19
PIR3Q03180 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.24■□□□□ 0.19
PIR3Q03180 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.24■□□□□ 0.19
PIR3Q03180 CCC1YLR220W 969 nt16.08■□□□□ 0.16
PIR3Q03180 ATS1YAL020C 1002 nt15.78■□□□□ 0.12
PIR3Q03180 SCJ1YMR214W 1134 nt15.75■□□□□ 0.11
PIR3Q03180 YBR190WYBR190W 312 nt15.62■□□□□ 0.09
PIR3Q03180 PET122YER153C 765 nt15.56■□□□□ 0.08
PIR3Q03180 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.42■□□□□ 0.06
PIR3Q03180 RVS167YDR388W 1449 nt15.38■□□□□ 0.05
PIR3Q03180 SCR1SCR1 522 nt15.38■□□□□ 0.05
PIR3Q03180 RTC3YHR087W 336 nt15.3■□□□□ 0.04
PIR3Q03180 RRN5YLR141W 1092 nt15.12■□□□□ 0.01
PIR3Q03180 SHR5YOL110W 714 nt14.91□□□□□ -0.02
PIR3Q03180 YDJ1YNL064C 1230 nt14.88□□□□□ -0.03
PIR3Q03180 RSB1YOR049C 1065 nt14.86□□□□□ -0.03
PIR3Q03180 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.82□□□□□ -0.04
PIR3Q03180 PST2YDR032C 597 nt14.58□□□□□ -0.08
PIR3Q03180 GAR1YHR089C 618 nt14.56□□□□□ -0.08
PIR3Q03180 DEP1YAL013W 1218 nt14.48□□□□□ -0.09
PIR3Q03180 URN1YPR152C 1398 nt14.4□□□□□ -0.1
PIR3Q03180 YNL208WYNL208W 600 nt14.22□□□□□ -0.13
PIR3Q03180 RPN10YHR200W 807 nt14.18□□□□□ -0.14
PIR3Q03180 OPI9YLR338W 858 nt14.15□□□□□ -0.14
PIR3Q03180 YKL097CYKL097C 411 nt14.1□□□□□ -0.15
PIR3Q03180 PUT4YOR348C 1884 nt14.08□□□□□ -0.16
PIR3Q03180 TIR1YER011W 765 nt14.05□□□□□ -0.16
PIR3Q03180 SAH1YER043C 1350 nt14.04□□□□□ -0.16
PIR3Q03180 SHU1YHL006C 453 nt13.98□□□□□ -0.17
PIR3Q03180 ARE1YCR048W 1833 nt13.89□□□□□ -0.19
PIR3Q03180 SSA1YAL005C 1929 nt13.88□□□□□ -0.19
PIR3Q03180 SRB2YHR041C 633 nt13.74□□□□□ -0.21
PIR3Q03180 YJR018WYJR018W 363 nt13.74□□□□□ -0.21
PIR3Q03180 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.73□□□□□ -0.21
PIR3Q03180 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.72□□□□□ -0.21
PIR3Q03180 PUN1YLR414C 792 nt13.72□□□□□ -0.21
PIR3Q03180 POA1YBR022W 534 nt13.66□□□□□ -0.22
PIR3Q03180 YJR120WYJR120W 351 nt13.63□□□□□ -0.23
PIR3Q03180 PTC2YER089C 1395 nt13.55□□□□□ -0.24
PIR3Q03180 YOR139CYOR139C 393 nt13.54□□□□□ -0.24
PIR3Q03180 WWM1YFL010C 636 nt13.49□□□□□ -0.25
PIR3Q03180 RPP2BYDR382W 333 nt13.48□□□□□ -0.25
PIR3Q03180 MNP1YGL068W 585 nt13.42□□□□□ -0.26
PIR3Q03180 BUD23YCR047C 828 nt13.41□□□□□ -0.26
PIR3Q03180 YGR021WYGR021W 873 nt13.41□□□□□ -0.26
PIR3Q03180 HOM6YJR139C 1080 nt13.41□□□□□ -0.26
PIR3Q03180 NPL3YDR432W 1245 nt13.34□□□□□ -0.27
PIR3Q03180 BSC6YOL137W 1494 nt13.34□□□□□ -0.27
PIR3Q03180 NAB2YGL122C 1578 nt13.32□□□□□ -0.28
PIR3Q03180 SSA3YBL075C 1950 nt13.29□□□□□ -0.28
PIR3Q03180 BDH2YAL061W 1254 nt13.26□□□□□ -0.29
PIR3Q03180 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.23□□□□□ -0.29
PIR3Q03180 RKM5YLR137W 1104 nt13.22□□□□□ -0.29
PIR3Q03180 FIS1YIL065C 468 nt13.21□□□□□ -0.29
PIR3Q03180 YOL037CYOL037C 354 nt13.2□□□□□ -0.3
PIR3Q03180 DAL1YIR027C 1383 nt13.2□□□□□ -0.3
PIR3Q03180 INM2YDR287W 879 nt13.19□□□□□ -0.3
PIR3Q03180 FPR4YLR449W 1179 nt13.19□□□□□ -0.3
PIR3Q03180 YBL100CYBL100C 315 nt13.13□□□□□ -0.31
PIR3Q03180 LSM3YLR438C-A 270 nt13.1□□□□□ -0.31
PIR3Q03180 PHO4YFR034C 939 nt13.09□□□□□ -0.31
PIR3Q03180 FUN26YAL022C 1554 nt12.98□□□□□ -0.33
PIR3Q03180 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.97□□□□□ -0.33
PIR3Q03180 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.97□□□□□ -0.33
PIR3Q03180 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.97□□□□□ -0.33
PIR3Q03180 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.97□□□□□ -0.33
PIR3Q03180 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.97□□□□□ -0.33
PIR3Q03180 TRM9YML014W 840 nt12.96□□□□□ -0.33
PIR3Q03180 YLR281CYLR281C 468 nt12.89□□□□□ -0.35
PIR3Q03180 CCT6YDR188W 1641 nt12.84□□□□□ -0.35
PIR3Q03180 PUS2YGL063W 1113 nt12.83□□□□□ -0.36
PIR3Q03180 WHI5YOR083W 888 nt12.83□□□□□ -0.36
PIR3Q03180 YPS1YLR120C 1710 nt12.76□□□□□ -0.37
PIR3Q03180 ALF1YNL148C 765 nt12.74□□□□□ -0.37
PIR3Q03180 YDR095CYDR095C 411 nt12.72□□□□□ -0.37
PIR3Q03180 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.69□□□□□ -0.38
PIR3Q03180 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.69□□□□□ -0.38
PIR3Q03180 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.67□□□□□ -0.38
PIR3Q03180 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.61□□□□□ -0.39
PIR3Q03180 YPR011CYPR011C 981 nt12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.6 ms