Protein–RNA interactions for Protein: Q12139

YPR022C, Zinc finger protein YPR022C, yeastyeast

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Length 1,133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR022CQ12139 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.61■□□□□ 0.73
YPR022CQ12139 NSR1YGR159C 1245 nt19.37■□□□□ 0.69
YPR022CQ12139 NOP1YDL014W 984 nt19.02■□□□□ 0.64
YPR022CQ12139 YKL036CYKL036C 393 nt17.64■□□□□ 0.41
YPR022CQ12139 MDJ1YFL016C 1536 nt17.22■□□□□ 0.35
YPR022CQ12139 Q0297Q0297 156 nt16.69■□□□□ 0.26
YPR022CQ12139 SRX1YKL086W 384 nt16.65■□□□□ 0.26
YPR022CQ12139 YJL027CYJL027C 417 nt16.49■□□□□ 0.23
YPR022CQ12139 SCS3YGL126W 1143 nt16.12■□□□□ 0.17
YPR022CQ12139 YCR051WYCR051W 669 nt15.83■□□□□ 0.12
YPR022CQ12139 YOL085CYOL085C 342 nt15.3■□□□□ 0.04
YPR022CQ12139 DBP2YNL112W 1641 nt15.26■□□□□ 0.03
YPR022CQ12139 PKP1YIL042C 1185 nt15.1■□□□□ 0.01
YPR022CQ12139 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.03■□□□□ -0
YPR022CQ12139 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.03■□□□□ -0
YPR022CQ12139 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.03■□□□□ -0
YPR022CQ12139 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.03■□□□□ -0
YPR022CQ12139 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.03■□□□□ -0
YPR022CQ12139 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.03■□□□□ -0
YPR022CQ12139 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.03■□□□□ -0
YPR022CQ12139 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.03■□□□□ -0
YPR022CQ12139 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.03■□□□□ -0
YPR022CQ12139 RPP1BYDL130W 321 nt14.98□□□□□ -0.01
YPR022CQ12139 CCC1YLR220W 969 nt14.91□□□□□ -0.02
YPR022CQ12139 YBR190WYBR190W 312 nt14.6□□□□□ -0.07
YPR022CQ12139 ATS1YAL020C 1002 nt14.42□□□□□ -0.1
YPR022CQ12139 PET122YER153C 765 nt14.34□□□□□ -0.11
YPR022CQ12139 SCJ1YMR214W 1134 nt14.32□□□□□ -0.12
YPR022CQ12139 RTC3YHR087W 336 nt14.31□□□□□ -0.12
YPR022CQ12139 RVS167YDR388W 1449 nt14.29□□□□□ -0.12
YPR022CQ12139 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.25□□□□□ -0.13
YPR022CQ12139 SCR1SCR1 522 nt14.15□□□□□ -0.14
YPR022CQ12139 SSA3YBL075C 1950 nt14.14□□□□□ -0.15
YPR022CQ12139 RRN5YLR141W 1092 nt13.93□□□□□ -0.18
YPR022CQ12139 SHR5YOL110W 714 nt13.83□□□□□ -0.2
YPR022CQ12139 YDJ1YNL064C 1230 nt13.74□□□□□ -0.21
YPR022CQ12139 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.66□□□□□ -0.22
YPR022CQ12139 RSB1YOR049C 1065 nt13.66□□□□□ -0.22
YPR022CQ12139 GAR1YHR089C 618 nt13.48□□□□□ -0.25
YPR022CQ12139 DEP1YAL013W 1218 nt13.48□□□□□ -0.25
YPR022CQ12139 URN1YPR152C 1398 nt13.43□□□□□ -0.26
YPR022CQ12139 PST2YDR032C 597 nt13.34□□□□□ -0.27
YPR022CQ12139 PUT4YOR348C 1884 nt13.25□□□□□ -0.29
YPR022CQ12139 YNL208WYNL208W 600 nt13.21□□□□□ -0.29
YPR022CQ12139 OPI9YLR338W 858 nt13.2□□□□□ -0.3
YPR022CQ12139 RPN10YHR200W 807 nt13.19□□□□□ -0.3
YPR022CQ12139 SAH1YER043C 1350 nt13.14□□□□□ -0.31
YPR022CQ12139 ARE1YCR048W 1833 nt13.05□□□□□ -0.32
YPR022CQ12139 TIR1YER011W 765 nt13.01□□□□□ -0.33
YPR022CQ12139 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.88□□□□□ -0.35
YPR022CQ12139 SSA1YAL005C 1929 nt12.87□□□□□ -0.35
YPR022CQ12139 POA1YBR022W 534 nt12.85□□□□□ -0.35
YPR022CQ12139 YKL097CYKL097C 411 nt12.84□□□□□ -0.35
YPR022CQ12139 SHU1YHL006C 453 nt12.82□□□□□ -0.36
YPR022CQ12139 YJR018WYJR018W 363 nt12.8□□□□□ -0.36
YPR022CQ12139 PUN1YLR414C 792 nt12.8□□□□□ -0.36
YPR022CQ12139 SRB2YHR041C 633 nt12.73□□□□□ -0.37
YPR022CQ12139 YJR120WYJR120W 351 nt12.68□□□□□ -0.38
YPR022CQ12139 PTC2YER089C 1395 nt12.68□□□□□ -0.38
YPR022CQ12139 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.63□□□□□ -0.39
YPR022CQ12139 BUD23YCR047C 828 nt12.59□□□□□ -0.39
YPR022CQ12139 BSC6YOL137W 1494 nt12.56□□□□□ -0.4
YPR022CQ12139 RPP2BYDR382W 333 nt12.53□□□□□ -0.4
YPR022CQ12139 WWM1YFL010C 636 nt12.48□□□□□ -0.41
YPR022CQ12139 NAB2YGL122C 1578 nt12.47□□□□□ -0.41
YPR022CQ12139 HOM6YJR139C 1080 nt12.36□□□□□ -0.43
YPR022CQ12139 YOR139CYOR139C 393 nt12.36□□□□□ -0.43
YPR022CQ12139 MNP1YGL068W 585 nt12.35□□□□□ -0.43
YPR022CQ12139 YGR021WYGR021W 873 nt12.35□□□□□ -0.43
YPR022CQ12139 FIS1YIL065C 468 nt12.35□□□□□ -0.43
YPR022CQ12139 DAL1YIR027C 1383 nt12.33□□□□□ -0.44
YPR022CQ12139 FPR4YLR449W 1179 nt12.33□□□□□ -0.44
YPR022CQ12139 BDH2YAL061W 1254 nt12.31□□□□□ -0.44
YPR022CQ12139 INM2YDR287W 879 nt12.3□□□□□ -0.44
YPR022CQ12139 SPT5YML010W 3192 nt12.26□□□□□ -0.45
YPR022CQ12139 PHO4YFR034C 939 nt12.23□□□□□ -0.45
YPR022CQ12139 YBL100CYBL100C 315 nt12.23□□□□□ -0.45
YPR022CQ12139 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.22□□□□□ -0.45
YPR022CQ12139 NPL3YDR432W 1245 nt12.19□□□□□ -0.46
YPR022CQ12139 RKM5YLR137W 1104 nt12.18□□□□□ -0.46
YPR022CQ12139 LSM3YLR438C-A 270 nt12.14□□□□□ -0.47
YPR022CQ12139 FUN26YAL022C 1554 nt12.09□□□□□ -0.47
YPR022CQ12139 YOL037CYOL037C 354 nt12.09□□□□□ -0.47
YPR022CQ12139 TRM9YML014W 840 nt12.06□□□□□ -0.48
YPR022CQ12139 SSA4YER103W 1929 nt12.04□□□□□ -0.48
YPR022CQ12139 YPS1YLR120C 1710 nt11.96□□□□□ -0.49
YPR022CQ12139 PAC11YDR488C 1602 nt11.96□□□□□ -0.5
YPR022CQ12139 CCT6YDR188W 1641 nt11.94□□□□□ -0.5
YPR022CQ12139 NVJ2YPR091C 2313 nt11.93□□□□□ -0.5
YPR022CQ12139 YDR095CYDR095C 411 nt11.89□□□□□ -0.51
YPR022CQ12139 ALF1YNL148C 765 nt11.88□□□□□ -0.51
YPR022CQ12139 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.86□□□□□ -0.51
YPR022CQ12139 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.86□□□□□ -0.51
YPR022CQ12139 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.86□□□□□ -0.51
YPR022CQ12139 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.86□□□□□ -0.51
YPR022CQ12139 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.86□□□□□ -0.51
YPR022CQ12139 YLR281CYLR281C 468 nt11.84□□□□□ -0.51
YPR022CQ12139 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.82□□□□□ -0.52
YPR022CQ12139 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.8□□□□□ -0.52
YPR022CQ12139 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.8□□□□□ -0.52
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