Protein–RNA interactions for Protein: P47044

YJL055W, LOG family protein YJL055W, yeastyeast

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL055WP47044 NSR1YGR159C 1245 nt17.79■□□□□ 0.44
YJL055WP47044 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.74■□□□□ 0.43
YJL055WP47044 NOP1YDL014W 984 nt17.32■□□□□ 0.36
YJL055WP47044 MDJ1YFL016C 1536 nt16.61■□□□□ 0.25
YJL055WP47044 YKL036CYKL036C 393 nt15.89■□□□□ 0.13
YJL055WP47044 YJL027CYJL027C 417 nt15.24■□□□□ 0.03
YJL055WP47044 Q0297Q0297 156 nt15.13■□□□□ 0.01
YJL055WP47044 SRX1YKL086W 384 nt15.11■□□□□ 0.01
YJL055WP47044 SSA3YBL075C 1950 nt14.87□□□□□ -0.03
YJL055WP47044 SCS3YGL126W 1143 nt14.39□□□□□ -0.11
YJL055WP47044 YBR190WYBR190W 312 nt14.37□□□□□ -0.11
YJL055WP47044 DBP2YNL112W 1641 nt14.34□□□□□ -0.11
YJL055WP47044 YCR051WYCR051W 669 nt14.27□□□□□ -0.13
YJL055WP47044 RTC3YHR087W 336 nt14.01□□□□□ -0.17
YJL055WP47044 YOL085CYOL085C 342 nt13.73□□□□□ -0.21
YJL055WP47044 PUT4YOR348C 1884 nt13.7□□□□□ -0.22
YJL055WP47044 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.68□□□□□ -0.22
YJL055WP47044 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.68□□□□□ -0.22
YJL055WP47044 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.68□□□□□ -0.22
YJL055WP47044 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.68□□□□□ -0.22
YJL055WP47044 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.68□□□□□ -0.22
YJL055WP47044 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.68□□□□□ -0.22
YJL055WP47044 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.68□□□□□ -0.22
YJL055WP47044 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.68□□□□□ -0.22
YJL055WP47044 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.68□□□□□ -0.22
YJL055WP47044 RPP1BYDL130W 321 nt13.56□□□□□ -0.24
YJL055WP47044 PKP1YIL042C 1185 nt13.45□□□□□ -0.26
YJL055WP47044 CCC1YLR220W 969 nt13.45□□□□□ -0.26
YJL055WP47044 RVS167YDR388W 1449 nt13.3□□□□□ -0.28
YJL055WP47044 POA1YBR022W 534 nt13.2□□□□□ -0.3
YJL055WP47044 ARE1YCR048W 1833 nt13.19□□□□□ -0.3
YJL055WP47044 BSC6YOL137W 1494 nt13.09□□□□□ -0.31
YJL055WP47044 SCJ1YMR214W 1134 nt13.08□□□□□ -0.32
YJL055WP47044 SPT5YML010W 3192 nt13.07□□□□□ -0.32
YJL055WP47044 SSA4YER103W 1929 nt13.06□□□□□ -0.32
YJL055WP47044 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.05□□□□□ -0.32
YJL055WP47044 SAH1YER043C 1350 nt12.94□□□□□ -0.34
YJL055WP47044 PET122YER153C 765 nt12.91□□□□□ -0.34
YJL055WP47044 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.9□□□□□ -0.34
YJL055WP47044 ATS1YAL020C 1002 nt12.86□□□□□ -0.35
YJL055WP47044 SCR1SCR1 522 nt12.83□□□□□ -0.36
YJL055WP47044 URN1YPR152C 1398 nt12.81□□□□□ -0.36
YJL055WP47044 OPI9YLR338W 858 nt12.8□□□□□ -0.36
YJL055WP47044 Q0182Q0182 405 nt12.75□□□□□ -0.37
YJL055WP47044 BUD23YCR047C 828 nt12.68□□□□□ -0.38
YJL055WP47044 SHR5YOL110W 714 nt12.66□□□□□ -0.38
YJL055WP47044 BDF1YLR399C 2061 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL055WP47044 DEP1YAL013W 1218 nt12.58□□□□□ -0.4
YJL055WP47044 YDJ1YNL064C 1230 nt12.55□□□□□ -0.4
YJL055WP47044 RRN5YLR141W 1092 nt12.52□□□□□ -0.41
YJL055WP47044 TAT1YBR069C 1860 nt12.45□□□□□ -0.42
YJL055WP47044 RPN10YHR200W 807 nt12.44□□□□□ -0.42
YJL055WP47044 PUN1YLR414C 792 nt12.42□□□□□ -0.42
YJL055WP47044 PTC2YER089C 1395 nt12.41□□□□□ -0.42
YJL055WP47044 PAC11YDR488C 1602 nt12.39□□□□□ -0.43
YJL055WP47044 MEP2YNL142W 1500 nt12.37□□□□□ -0.43
YJL055WP47044 NAB2YGL122C 1578 nt12.36□□□□□ -0.43
YJL055WP47044 SSA1YAL005C 1929 nt12.29□□□□□ -0.44
YJL055WP47044 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.29□□□□□ -0.44
YJL055WP47044 YNL208WYNL208W 600 nt12.27□□□□□ -0.45
YJL055WP47044 RSB1YOR049C 1065 nt12.26□□□□□ -0.45
YJL055WP47044 GAR1YHR089C 618 nt12.17□□□□□ -0.46
YJL055WP47044 YJR018WYJR018W 363 nt12.17□□□□□ -0.46
YJL055WP47044 DCW1YKL046C 1350 nt12.16□□□□□ -0.46
YJL055WP47044 FIS1YIL065C 468 nt12.12□□□□□ -0.47
YJL055WP47044 DAL1YIR027C 1383 nt12.04□□□□□ -0.48
YJL055WP47044 YBR220CYBR220C 1683 nt12.03□□□□□ -0.48
YJL055WP47044 NVJ2YPR091C 2313 nt12.02□□□□□ -0.49
YJL055WP47044 FPR4YLR449W 1179 nt12□□□□□ -0.49
YJL055WP47044 YPS1YLR120C 1710 nt12□□□□□ -0.49
YJL055WP47044 EMI2YDR516C 1503 nt11.96□□□□□ -0.49
YJL055WP47044 YMR090WYMR090W 684 nt11.95□□□□□ -0.5
YJL055WP47044 PHO4YFR034C 939 nt11.94□□□□□ -0.5
YJL055WP47044 MOT3YMR070W 1473 nt11.94□□□□□ -0.5
YJL055WP47044 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.93□□□□□ -0.5
YJL055WP47044 PST2YDR032C 597 nt11.92□□□□□ -0.5
YJL055WP47044 FPS1YLL043W 2010 nt11.89□□□□□ -0.51
YJL055WP47044 SDH1YKL148C 1923 nt11.82□□□□□ -0.52
YJL055WP47044 INM2YDR287W 879 nt11.82□□□□□ -0.52
YJL055WP47044 YDL221WYDL221W 552 nt11.81□□□□□ -0.52
YJL055WP47044 TIR1YER011W 765 nt11.81□□□□□ -0.52
YJL055WP47044 YJR120WYJR120W 351 nt11.81□□□□□ -0.52
YJL055WP47044 PCH2YBR186W 1695 nt11.81□□□□□ -0.52
YJL055WP47044 YDR095CYDR095C 411 nt11.79□□□□□ -0.52
YJL055WP47044 GUT2YIL155C 1950 nt11.76□□□□□ -0.53
YJL055WP47044 SEC11YIR022W 504 nt11.73□□□□□ -0.53
YJL055WP47044 RPP2BYDR382W 333 nt11.7□□□□□ -0.54
YJL055WP47044 CAC2YML102W 1407 nt11.67□□□□□ -0.54
YJL055WP47044 SCC4YER147C 1875 nt11.62□□□□□ -0.55
YJL055WP47044 PTP1YDL230W 1008 nt11.6□□□□□ -0.55
YJL055WP47044 YBL100CYBL100C 315 nt11.6□□□□□ -0.55
YJL055WP47044 RPP2AYOL039W 321 nt11.56□□□□□ -0.56
YJL055WP47044 PIB2YGL023C 1908 nt11.54□□□□□ -0.56
YJL055WP47044 IRC15YPL017C 1500 nt11.5□□□□□ -0.57
YJL055WP47044 YSC84YHR016C 1407 nt11.47□□□□□ -0.57
YJL055WP47044 ALF1YNL148C 765 nt11.45□□□□□ -0.58
YJL055WP47044 YKL097CYKL097C 411 nt11.44□□□□□ -0.58
YJL055WP47044 GIS3YLR094C 1509 nt11.44□□□□□ -0.58
YJL055WP47044 RTF1YGL244W 1677 nt11.43□□□□□ -0.58
YJL055WP47044 FUN26YAL022C 1554 nt11.42□□□□□ -0.58
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