Protein–RNA interactions for Protein: P38204

RRN10, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN10, yeastyeast

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN10P38204 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.67■□□□□ 0.74
RRN10P38204 NSR1YGR159C 1245 nt19.55■□□□□ 0.72
RRN10P38204 NOP1YDL014W 984 nt19.16■□□□□ 0.66
RRN10P38204 YKL036CYKL036C 393 nt17.69■□□□□ 0.42
RRN10P38204 MDJ1YFL016C 1536 nt17.31■□□□□ 0.36
RRN10P38204 Q0297Q0297 156 nt16.77■□□□□ 0.28
RRN10P38204 SRX1YKL086W 384 nt16.73■□□□□ 0.27
RRN10P38204 YJL027CYJL027C 417 nt16.51■□□□□ 0.23
RRN10P38204 SCS3YGL126W 1143 nt16.1■□□□□ 0.17
RRN10P38204 YCR051WYCR051W 669 nt15.86■□□□□ 0.13
RRN10P38204 DBP2YNL112W 1641 nt15.33■□□□□ 0.04
RRN10P38204 YOL085CYOL085C 342 nt15.31■□□□□ 0.04
RRN10P38204 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RRN10P38204 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RRN10P38204 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RRN10P38204 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RRN10P38204 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RRN10P38204 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RRN10P38204 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RRN10P38204 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RRN10P38204 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RRN10P38204 RPP1BYDL130W 321 nt15.05■□□□□ -0
RRN10P38204 PKP1YIL042C 1185 nt15.05■□□□□ -0
RRN10P38204 CCC1YLR220W 969 nt14.93□□□□□ -0.02
RRN10P38204 YBR190WYBR190W 312 nt14.78□□□□□ -0.04
RRN10P38204 RVS167YDR388W 1449 nt14.44□□□□□ -0.1
RRN10P38204 RTC3YHR087W 336 nt14.43□□□□□ -0.1
RRN10P38204 ATS1YAL020C 1002 nt14.4□□□□□ -0.1
RRN10P38204 PET122YER153C 765 nt14.36□□□□□ -0.11
RRN10P38204 SCJ1YMR214W 1134 nt14.36□□□□□ -0.11
RRN10P38204 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.3□□□□□ -0.12
RRN10P38204 SCR1SCR1 522 nt14.23□□□□□ -0.13
RRN10P38204 SHR5YOL110W 714 nt13.95□□□□□ -0.18
RRN10P38204 RRN5YLR141W 1092 nt13.94□□□□□ -0.18
RRN10P38204 YDJ1YNL064C 1230 nt13.85□□□□□ -0.19
RRN10P38204 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.68□□□□□ -0.22
RRN10P38204 RSB1YOR049C 1065 nt13.67□□□□□ -0.22
RRN10P38204 URN1YPR152C 1398 nt13.53□□□□□ -0.24
RRN10P38204 GAR1YHR089C 618 nt13.51□□□□□ -0.25
RRN10P38204 DEP1YAL013W 1218 nt13.51□□□□□ -0.25
RRN10P38204 PUT4YOR348C 1884 nt13.39□□□□□ -0.27
RRN10P38204 RPN10YHR200W 807 nt13.36□□□□□ -0.27
RRN10P38204 PST2YDR032C 597 nt13.34□□□□□ -0.27
RRN10P38204 OPI9YLR338W 858 nt13.34□□□□□ -0.27
RRN10P38204 YNL208WYNL208W 600 nt13.33□□□□□ -0.28
RRN10P38204 SAH1YER043C 1350 nt13.22□□□□□ -0.29
RRN10P38204 ARE1YCR048W 1833 nt13.15□□□□□ -0.3
RRN10P38204 TIR1YER011W 765 nt13.07□□□□□ -0.32
RRN10P38204 SSA3YBL075C 1950 nt13.05□□□□□ -0.32
RRN10P38204 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.99□□□□□ -0.33
RRN10P38204 PUN1YLR414C 792 nt12.96□□□□□ -0.33
RRN10P38204 POA1YBR022W 534 nt12.95□□□□□ -0.34
RRN10P38204 YJR018WYJR018W 363 nt12.91□□□□□ -0.34
RRN10P38204 SSA1YAL005C 1929 nt12.9□□□□□ -0.35
RRN10P38204 YKL097CYKL097C 411 nt12.83□□□□□ -0.36
RRN10P38204 SHU1YHL006C 453 nt12.78□□□□□ -0.36
RRN10P38204 PTC2YER089C 1395 nt12.77□□□□□ -0.37
RRN10P38204 YJR120WYJR120W 351 nt12.71□□□□□ -0.37
RRN10P38204 BSC6YOL137W 1494 nt12.68□□□□□ -0.38
RRN10P38204 BUD23YCR047C 828 nt12.68□□□□□ -0.38
RRN10P38204 RPP2BYDR382W 333 nt12.67□□□□□ -0.38
RRN10P38204 SRB2YHR041C 633 nt12.67□□□□□ -0.38
RRN10P38204 NAB2YGL122C 1578 nt12.61□□□□□ -0.39
RRN10P38204 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.56□□□□□ -0.4
RRN10P38204 WWM1YFL010C 636 nt12.48□□□□□ -0.41
RRN10P38204 DAL1YIR027C 1383 nt12.46□□□□□ -0.41
RRN10P38204 YGR021WYGR021W 873 nt12.46□□□□□ -0.41
RRN10P38204 INM2YDR287W 879 nt12.45□□□□□ -0.42
RRN10P38204 FIS1YIL065C 468 nt12.45□□□□□ -0.42
RRN10P38204 BDH2YAL061W 1254 nt12.42□□□□□ -0.42
RRN10P38204 FPR4YLR449W 1179 nt12.4□□□□□ -0.42
RRN10P38204 HOM6YJR139C 1080 nt12.39□□□□□ -0.43
RRN10P38204 PHO4YFR034C 939 nt12.34□□□□□ -0.43
RRN10P38204 YBL100CYBL100C 315 nt12.34□□□□□ -0.43
RRN10P38204 MNP1YGL068W 585 nt12.32□□□□□ -0.44
RRN10P38204 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.31□□□□□ -0.44
RRN10P38204 YOR139CYOR139C 393 nt12.29□□□□□ -0.44
RRN10P38204 LSM3YLR438C-A 270 nt12.27□□□□□ -0.45
RRN10P38204 RKM5YLR137W 1104 nt12.21□□□□□ -0.45
RRN10P38204 NPL3YDR432W 1245 nt12.2□□□□□ -0.46
RRN10P38204 FUN26YAL022C 1554 nt12.19□□□□□ -0.46
RRN10P38204 TRM9YML014W 840 nt12.17□□□□□ -0.46
RRN10P38204 YOL037CYOL037C 354 nt12.16□□□□□ -0.46
RRN10P38204 YPS1YLR120C 1710 nt12.08□□□□□ -0.47
RRN10P38204 CCT6YDR188W 1641 nt12.06□□□□□ -0.48
RRN10P38204 SPT5YML010W 3192 nt12.05□□□□□ -0.48
RRN10P38204 YDR095CYDR095C 411 nt12.02□□□□□ -0.49
RRN10P38204 ALF1YNL148C 765 nt12.01□□□□□ -0.49
RRN10P38204 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.96□□□□□ -0.49
RRN10P38204 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.96□□□□□ -0.49
RRN10P38204 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.94□□□□□ -0.5
RRN10P38204 MEP2YNL142W 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
RRN10P38204 YLR281CYLR281C 468 nt11.86□□□□□ -0.51
RRN10P38204 SIS1YNL007C 1059 nt11.83□□□□□ -0.52
RRN10P38204 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.82□□□□□ -0.52
RRN10P38204 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.82□□□□□ -0.52
RRN10P38204 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.82□□□□□ -0.52
RRN10P38204 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.82□□□□□ -0.52
RRN10P38204 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.82□□□□□ -0.52
RRN10P38204 WHI5YOR083W 888 nt11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms