Protein–RNA interactions for Protein: P43607

RRT5, Regulator of rDNA transcription protein 5, yeastyeast

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT5P43607 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.09■□□□□ 0.97
RRT5P43607 NSR1YGR159C 1245 nt20.98■□□□□ 0.95
RRT5P43607 NOP1YDL014W 984 nt20.44■□□□□ 0.86
RRT5P43607 YKL036CYKL036C 393 nt18.87■□□□□ 0.61
RRT5P43607 MDJ1YFL016C 1536 nt18.72■□□□□ 0.59
RRT5P43607 Q0297Q0297 156 nt17.93■□□□□ 0.46
RRT5P43607 SRX1YKL086W 384 nt17.9■□□□□ 0.46
RRT5P43607 YJL027CYJL027C 417 nt17.6■□□□□ 0.41
RRT5P43607 SCS3YGL126W 1143 nt17.18■□□□□ 0.34
RRT5P43607 YCR051WYCR051W 669 nt16.98■□□□□ 0.31
RRT5P43607 DBP2YNL112W 1641 nt16.56■□□□□ 0.24
RRT5P43607 YOL085CYOL085C 342 nt16.37■□□□□ 0.21
RRT5P43607 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.23■□□□□ 0.19
RRT5P43607 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.23■□□□□ 0.19
RRT5P43607 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.23■□□□□ 0.19
RRT5P43607 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.23■□□□□ 0.19
RRT5P43607 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.23■□□□□ 0.19
RRT5P43607 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.23■□□□□ 0.19
RRT5P43607 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.23■□□□□ 0.19
RRT5P43607 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.23■□□□□ 0.19
RRT5P43607 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.23■□□□□ 0.19
RRT5P43607 PKP1YIL042C 1185 nt16.15■□□□□ 0.18
RRT5P43607 RPP1BYDL130W 321 nt16.09■□□□□ 0.17
RRT5P43607 CCC1YLR220W 969 nt16.07■□□□□ 0.16
RRT5P43607 YBR190WYBR190W 312 nt15.93■□□□□ 0.14
RRT5P43607 RTC3YHR087W 336 nt15.56■□□□□ 0.08
RRT5P43607 SCJ1YMR214W 1134 nt15.49■□□□□ 0.07
RRT5P43607 RVS167YDR388W 1449 nt15.46■□□□□ 0.07
RRT5P43607 PET122YER153C 765 nt15.41■□□□□ 0.06
RRT5P43607 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.34■□□□□ 0.05
RRT5P43607 ATS1YAL020C 1002 nt15.34■□□□□ 0.05
RRT5P43607 SCR1SCR1 522 nt15.15■□□□□ 0.02
RRT5P43607 SHR5YOL110W 714 nt14.96□□□□□ -0.01
RRT5P43607 RRN5YLR141W 1092 nt14.95□□□□□ -0.02
RRT5P43607 YDJ1YNL064C 1230 nt14.83□□□□□ -0.04
RRT5P43607 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.66□□□□□ -0.06
RRT5P43607 RSB1YOR049C 1065 nt14.61□□□□□ -0.07
RRT5P43607 DEP1YAL013W 1218 nt14.59□□□□□ -0.07
RRT5P43607 URN1YPR152C 1398 nt14.58□□□□□ -0.08
RRT5P43607 PUT4YOR348C 1884 nt14.52□□□□□ -0.08
RRT5P43607 GAR1YHR089C 618 nt14.51□□□□□ -0.09
RRT5P43607 OPI9YLR338W 858 nt14.37□□□□□ -0.11
RRT5P43607 YNL208WYNL208W 600 nt14.31□□□□□ -0.12
RRT5P43607 SAH1YER043C 1350 nt14.31□□□□□ -0.12
RRT5P43607 RPN10YHR200W 807 nt14.29□□□□□ -0.12
RRT5P43607 ARE1YCR048W 1833 nt14.25□□□□□ -0.13
RRT5P43607 PST2YDR032C 597 nt14.23□□□□□ -0.13
RRT5P43607 POA1YBR022W 534 nt14.07□□□□□ -0.16
RRT5P43607 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.06□□□□□ -0.16
RRT5P43607 TIR1YER011W 765 nt14.03□□□□□ -0.16
RRT5P43607 PUN1YLR414C 792 nt13.92□□□□□ -0.18
RRT5P43607 YJR018WYJR018W 363 nt13.9□□□□□ -0.18
RRT5P43607 SSA1YAL005C 1929 nt13.9□□□□□ -0.18
RRT5P43607 PTC2YER089C 1395 nt13.79□□□□□ -0.2
RRT5P43607 BSC6YOL137W 1494 nt13.77□□□□□ -0.21
RRT5P43607 YJR120WYJR120W 351 nt13.76□□□□□ -0.21
RRT5P43607 BUD23YCR047C 828 nt13.72□□□□□ -0.21
RRT5P43607 SRB2YHR041C 633 nt13.72□□□□□ -0.21
RRT5P43607 SHU1YHL006C 453 nt13.68□□□□□ -0.22
RRT5P43607 YKL097CYKL097C 411 nt13.61□□□□□ -0.23
RRT5P43607 NAB2YGL122C 1578 nt13.59□□□□□ -0.23
RRT5P43607 SSA3YBL075C 1950 nt13.58□□□□□ -0.24
RRT5P43607 RPP2BYDR382W 333 nt13.56□□□□□ -0.24
RRT5P43607 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.5□□□□□ -0.25
RRT5P43607 FIS1YIL065C 468 nt13.45□□□□□ -0.26
RRT5P43607 WWM1YFL010C 636 nt13.43□□□□□ -0.26
RRT5P43607 DAL1YIR027C 1383 nt13.42□□□□□ -0.26
RRT5P43607 FPR4YLR449W 1179 nt13.39□□□□□ -0.27
RRT5P43607 INM2YDR287W 879 nt13.38□□□□□ -0.27
RRT5P43607 BDH2YAL061W 1254 nt13.33□□□□□ -0.28
RRT5P43607 PHO4YFR034C 939 nt13.31□□□□□ -0.28
RRT5P43607 HOM6YJR139C 1080 nt13.28□□□□□ -0.28
RRT5P43607 YGR021WYGR021W 873 nt13.27□□□□□ -0.29
RRT5P43607 YBL100CYBL100C 315 nt13.27□□□□□ -0.29
RRT5P43607 MNP1YGL068W 585 nt13.24□□□□□ -0.29
RRT5P43607 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.17□□□□□ -0.3
RRT5P43607 SPT5YML010W 3192 nt13.16□□□□□ -0.3
RRT5P43607 YOR139CYOR139C 393 nt13.14□□□□□ -0.31
RRT5P43607 LSM3YLR438C-A 270 nt13.13□□□□□ -0.31
RRT5P43607 FUN26YAL022C 1554 nt13.12□□□□□ -0.31
RRT5P43607 RKM5YLR137W 1104 nt13.08□□□□□ -0.32
RRT5P43607 YPS1YLR120C 1710 nt13.06□□□□□ -0.32
RRT5P43607 TRM9YML014W 840 nt13.06□□□□□ -0.32
RRT5P43607 YDR095CYDR095C 411 nt12.98□□□□□ -0.33
RRT5P43607 NPL3YDR432W 1245 nt12.96□□□□□ -0.33
RRT5P43607 CCT6YDR188W 1641 nt12.95□□□□□ -0.34
RRT5P43607 YOL037CYOL037C 354 nt12.93□□□□□ -0.34
RRT5P43607 MEP2YNL142W 1500 nt12.92□□□□□ -0.34
RRT5P43607 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.9□□□□□ -0.34
RRT5P43607 ALF1YNL148C 765 nt12.9□□□□□ -0.34
RRT5P43607 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.79□□□□□ -0.36
RRT5P43607 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.79□□□□□ -0.36
RRT5P43607 DCW1YKL046C 1350 nt12.76□□□□□ -0.37
RRT5P43607 SIS1YNL007C 1059 nt12.75□□□□□ -0.37
RRT5P43607 PTP1YDL230W 1008 nt12.73□□□□□ -0.37
RRT5P43607 RPP2AYOL039W 321 nt12.72□□□□□ -0.37
RRT5P43607 YLR281CYLR281C 468 nt12.67□□□□□ -0.38
RRT5P43607 SSA4YER103W 1929 nt12.66□□□□□ -0.38
RRT5P43607 WHI5YOR083W 888 nt12.64□□□□□ -0.39
RRT5P43607 CAC2YML102W 1407 nt12.63□□□□□ -0.39
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