Protein–RNA interactions for Protein: Q03028

ODC1, Mitochondrial 2-oxodicarboxylate carrier 1, yeastyeast

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ODC1Q03028 NSR1YGR159C 1245 nt16.42■□□□□ 0.22
ODC1Q03028 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.99■□□□□ 0.15
ODC1Q03028 NOP1YDL014W 984 nt15.5■□□□□ 0.07
ODC1Q03028 MDJ1YFL016C 1536 nt15.33■□□□□ 0.04
ODC1Q03028 YJL027CYJL027C 417 nt14.04□□□□□ -0.16
ODC1Q03028 YKL036CYKL036C 393 nt13.98□□□□□ -0.17
ODC1Q03028 SSA3YBL075C 1950 nt13.63□□□□□ -0.23
ODC1Q03028 SRX1YKL086W 384 nt13.52□□□□□ -0.25
ODC1Q03028 Q0297Q0297 156 nt13.46□□□□□ -0.25
ODC1Q03028 DBP2YNL112W 1641 nt13.26□□□□□ -0.29
ODC1Q03028 YBR190WYBR190W 312 nt13.22□□□□□ -0.29
ODC1Q03028 RTC3YHR087W 336 nt12.91□□□□□ -0.34
ODC1Q03028 YCR051WYCR051W 669 nt12.74□□□□□ -0.37
ODC1Q03028 PUT4YOR348C 1884 nt12.61□□□□□ -0.39
ODC1Q03028 SCS3YGL126W 1143 nt12.53□□□□□ -0.4
ODC1Q03028 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.41□□□□□ -0.42
ODC1Q03028 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.41□□□□□ -0.42
ODC1Q03028 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.41□□□□□ -0.42
ODC1Q03028 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.41□□□□□ -0.42
ODC1Q03028 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.41□□□□□ -0.42
ODC1Q03028 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.41□□□□□ -0.42
ODC1Q03028 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.41□□□□□ -0.42
ODC1Q03028 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.41□□□□□ -0.42
ODC1Q03028 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.41□□□□□ -0.42
ODC1Q03028 CCC1YLR220W 969 nt12.29□□□□□ -0.44
ODC1Q03028 RVS167YDR388W 1449 nt12.25□□□□□ -0.45
ODC1Q03028 ARE1YCR048W 1833 nt12.16□□□□□ -0.46
ODC1Q03028 POA1YBR022W 534 nt12.15□□□□□ -0.46
ODC1Q03028 YOL085CYOL085C 342 nt12.09□□□□□ -0.47
ODC1Q03028 SCJ1YMR214W 1134 nt12.08□□□□□ -0.48
ODC1Q03028 RPP1BYDL130W 321 nt12.06□□□□□ -0.48
ODC1Q03028 SPT5YML010W 3192 nt12.05□□□□□ -0.48
ODC1Q03028 BSC6YOL137W 1494 nt12.03□□□□□ -0.48
ODC1Q03028 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12□□□□□ -0.49
ODC1Q03028 SSA4YER103W 1929 nt11.99□□□□□ -0.49
ODC1Q03028 SAH1YER043C 1350 nt11.92□□□□□ -0.5
ODC1Q03028 PKP1YIL042C 1185 nt11.86□□□□□ -0.51
ODC1Q03028 URN1YPR152C 1398 nt11.81□□□□□ -0.52
ODC1Q03028 OPI9YLR338W 858 nt11.78□□□□□ -0.52
ODC1Q03028 BUD23YCR047C 828 nt11.66□□□□□ -0.54
ODC1Q03028 SHR5YOL110W 714 nt11.66□□□□□ -0.54
ODC1Q03028 DEP1YAL013W 1218 nt11.62□□□□□ -0.55
ODC1Q03028 BDF1YLR399C 2061 nt11.61□□□□□ -0.55
ODC1Q03028 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.61□□□□□ -0.55
ODC1Q03028 PET122YER153C 765 nt11.52□□□□□ -0.57
ODC1Q03028 PTC2YER089C 1395 nt11.43□□□□□ -0.58
ODC1Q03028 TAT1YBR069C 1860 nt11.42□□□□□ -0.58
ODC1Q03028 RPN10YHR200W 807 nt11.42□□□□□ -0.58
ODC1Q03028 PUN1YLR414C 792 nt11.42□□□□□ -0.58
ODC1Q03028 NAB2YGL122C 1578 nt11.37□□□□□ -0.59
ODC1Q03028 MEP2YNL142W 1500 nt11.37□□□□□ -0.59
ODC1Q03028 SCR1SCR1 522 nt11.36□□□□□ -0.59
ODC1Q03028 PAC11YDR488C 1602 nt11.33□□□□□ -0.6
ODC1Q03028 YNL208WYNL208W 600 nt11.31□□□□□ -0.6
ODC1Q03028 YDJ1YNL064C 1230 nt11.29□□□□□ -0.6
ODC1Q03028 YJR018WYJR018W 363 nt11.21□□□□□ -0.61
ODC1Q03028 DCW1YKL046C 1350 nt11.2□□□□□ -0.62
ODC1Q03028 FIS1YIL065C 468 nt11.15□□□□□ -0.62
ODC1Q03028 RRN5YLR141W 1092 nt11.14□□□□□ -0.63
ODC1Q03028 ATS1YAL020C 1002 nt11.12□□□□□ -0.63
ODC1Q03028 DAL1YIR027C 1383 nt11.08□□□□□ -0.64
ODC1Q03028 YBR220CYBR220C 1683 nt11.06□□□□□ -0.64
ODC1Q03028 FPR4YLR449W 1179 nt11.06□□□□□ -0.64
ODC1Q03028 YPS1YLR120C 1710 nt11.04□□□□□ -0.64
ODC1Q03028 NVJ2YPR091C 2313 nt11.01□□□□□ -0.65
ODC1Q03028 EMI2YDR516C 1503 nt11□□□□□ -0.65
ODC1Q03028 GAR1YHR089C 618 nt11□□□□□ -0.65
ODC1Q03028 PHO4YFR034C 939 nt10.99□□□□□ -0.65
ODC1Q03028 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.96□□□□□ -0.65
ODC1Q03028 YMR090WYMR090W 684 nt10.96□□□□□ -0.65
ODC1Q03028 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.93□□□□□ -0.66
ODC1Q03028 YJR120WYJR120W 351 nt10.91□□□□□ -0.66
ODC1Q03028 INM2YDR287W 879 nt10.89□□□□□ -0.67
ODC1Q03028 SDH1YKL148C 1923 nt10.87□□□□□ -0.67
ODC1Q03028 YDL221WYDL221W 552 nt10.85□□□□□ -0.67
ODC1Q03028 YDR095CYDR095C 411 nt10.84□□□□□ -0.67
ODC1Q03028 PCH2YBR186W 1695 nt10.83□□□□□ -0.68
ODC1Q03028 RSB1YOR049C 1065 nt10.81□□□□□ -0.68
ODC1Q03028 GUT2YIL155C 1950 nt10.81□□□□□ -0.68
ODC1Q03028 CAC2YML102W 1407 nt10.77□□□□□ -0.68
ODC1Q03028 RPP2BYDR382W 333 nt10.76□□□□□ -0.69
ODC1Q03028 SEC11YIR022W 504 nt10.73□□□□□ -0.69
ODC1Q03028 FPS1YLL043W 2010 nt10.73□□□□□ -0.69
ODC1Q03028 SSA1YAL005C 1929 nt10.7□□□□□ -0.7
ODC1Q03028 PTP1YDL230W 1008 nt10.7□□□□□ -0.7
ODC1Q03028 Q0182Q0182 405 nt10.7□□□□□ -0.7
ODC1Q03028 TIR1YER011W 765 nt10.69□□□□□ -0.7
ODC1Q03028 SCC4YER147C 1875 nt10.69□□□□□ -0.7
ODC1Q03028 YBL100CYBL100C 315 nt10.68□□□□□ -0.7
ODC1Q03028 RPP2AYOL039W 321 nt10.65□□□□□ -0.7
ODC1Q03028 PIB2YGL023C 1908 nt10.64□□□□□ -0.71
ODC1Q03028 IRC15YPL017C 1500 nt10.6□□□□□ -0.71
ODC1Q03028 YSC84YHR016C 1407 nt10.55□□□□□ -0.72
ODC1Q03028 GIS3YLR094C 1509 nt10.54□□□□□ -0.72
ODC1Q03028 FUN26YAL022C 1554 nt10.54□□□□□ -0.72
ODC1Q03028 ALF1YNL148C 765 nt10.53□□□□□ -0.72
ODC1Q03028 RTF1YGL244W 1677 nt10.5□□□□□ -0.73
ODC1Q03028 YHL050CYHL050C 2094 nt10.47□□□□□ -0.73
ODC1Q03028 BDH2YAL061W 1254 nt10.43□□□□□ -0.74
ODC1Q03028 SRB2YHR041C 633 nt10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.4 ms