Protein–RNA interactions for Protein: P53039

YIP1, Protein transport protein YIP1, yeastyeast

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YIP1P53039 NSR1YGR159C 1245 nt16.66■□□□□ 0.26
YIP1P53039 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.63■□□□□ 0.25
YIP1P53039 NOP1YDL014W 984 nt16.27■□□□□ 0.2
YIP1P53039 YKL036CYKL036C 393 nt14.88□□□□□ -0.03
YIP1P53039 MDJ1YFL016C 1536 nt14.71□□□□□ -0.06
YIP1P53039 Q0297Q0297 156 nt14.16□□□□□ -0.14
YIP1P53039 SRX1YKL086W 384 nt14.15□□□□□ -0.14
YIP1P53039 YJL027CYJL027C 417 nt13.86□□□□□ -0.19
YIP1P53039 SCS3YGL126W 1143 nt13.44□□□□□ -0.26
YIP1P53039 YCR051WYCR051W 669 nt13.38□□□□□ -0.27
YIP1P53039 DBP2YNL112W 1641 nt12.97□□□□□ -0.33
YIP1P53039 YOL085CYOL085C 342 nt12.84□□□□□ -0.35
YIP1P53039 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.8□□□□□ -0.36
YIP1P53039 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.8□□□□□ -0.36
YIP1P53039 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.8□□□□□ -0.36
YIP1P53039 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.8□□□□□ -0.36
YIP1P53039 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.8□□□□□ -0.36
YIP1P53039 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.8□□□□□ -0.36
YIP1P53039 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.8□□□□□ -0.36
YIP1P53039 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.8□□□□□ -0.36
YIP1P53039 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.8□□□□□ -0.36
YIP1P53039 RPP1BYDL130W 321 nt12.69□□□□□ -0.38
YIP1P53039 YBR190WYBR190W 312 nt12.68□□□□□ -0.38
YIP1P53039 CCC1YLR220W 969 nt12.61□□□□□ -0.39
YIP1P53039 PKP1YIL042C 1185 nt12.57□□□□□ -0.4
YIP1P53039 RVS167YDR388W 1449 nt12.37□□□□□ -0.43
YIP1P53039 RTC3YHR087W 336 nt12.36□□□□□ -0.43
YIP1P53039 SCJ1YMR214W 1134 nt12.11□□□□□ -0.47
YIP1P53039 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.08□□□□□ -0.48
YIP1P53039 PET122YER153C 765 nt12.06□□□□□ -0.48
YIP1P53039 SCR1SCR1 522 nt12.05□□□□□ -0.48
YIP1P53039 ATS1YAL020C 1002 nt12.02□□□□□ -0.49
YIP1P53039 SHR5YOL110W 714 nt11.87□□□□□ -0.51
YIP1P53039 YDJ1YNL064C 1230 nt11.75□□□□□ -0.53
YIP1P53039 SSA3YBL075C 1950 nt11.73□□□□□ -0.53
YIP1P53039 RRN5YLR141W 1092 nt11.72□□□□□ -0.53
YIP1P53039 URN1YPR152C 1398 nt11.53□□□□□ -0.56
YIP1P53039 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.49□□□□□ -0.57
YIP1P53039 RSB1YOR049C 1065 nt11.49□□□□□ -0.57
YIP1P53039 RPN10YHR200W 807 nt11.48□□□□□ -0.57
YIP1P53039 PUT4YOR348C 1884 nt11.47□□□□□ -0.57
YIP1P53039 DEP1YAL013W 1218 nt11.43□□□□□ -0.58
YIP1P53039 GAR1YHR089C 618 nt11.41□□□□□ -0.58
YIP1P53039 OPI9YLR338W 858 nt11.41□□□□□ -0.58
YIP1P53039 YNL208WYNL208W 600 nt11.38□□□□□ -0.59
YIP1P53039 SAH1YER043C 1350 nt11.28□□□□□ -0.6
YIP1P53039 ARE1YCR048W 1833 nt11.23□□□□□ -0.61
YIP1P53039 PUN1YLR414C 792 nt11.14□□□□□ -0.63
YIP1P53039 PST2YDR032C 597 nt11.13□□□□□ -0.63
YIP1P53039 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.12□□□□□ -0.63
YIP1P53039 POA1YBR022W 534 nt11.1□□□□□ -0.63
YIP1P53039 TIR1YER011W 765 nt11.06□□□□□ -0.64
YIP1P53039 YJR018WYJR018W 363 nt11.02□□□□□ -0.65
YIP1P53039 Q0182Q0182 405 nt10.92□□□□□ -0.66
YIP1P53039 PTC2YER089C 1395 nt10.91□□□□□ -0.66
YIP1P53039 BSC6YOL137W 1494 nt10.88□□□□□ -0.67
YIP1P53039 SSA1YAL005C 1929 nt10.87□□□□□ -0.67
YIP1P53039 BUD23YCR047C 828 nt10.86□□□□□ -0.67
YIP1P53039 RPP2BYDR382W 333 nt10.86□□□□□ -0.67
YIP1P53039 NAB2YGL122C 1578 nt10.84□□□□□ -0.67
YIP1P53039 YJR120WYJR120W 351 nt10.72□□□□□ -0.69
YIP1P53039 INM2YDR287W 879 nt10.7□□□□□ -0.7
YIP1P53039 YKL097CYKL097C 411 nt10.7□□□□□ -0.7
YIP1P53039 DAL1YIR027C 1383 nt10.67□□□□□ -0.7
YIP1P53039 SHU1YHL006C 453 nt10.65□□□□□ -0.7
YIP1P53039 FIS1YIL065C 468 nt10.61□□□□□ -0.71
YIP1P53039 FPR4YLR449W 1179 nt10.59□□□□□ -0.71
YIP1P53039 BDH2YAL061W 1254 nt10.58□□□□□ -0.72
YIP1P53039 YGR021WYGR021W 873 nt10.57□□□□□ -0.72
YIP1P53039 SRB2YHR041C 633 nt10.56□□□□□ -0.72
YIP1P53039 PHO4YFR034C 939 nt10.54□□□□□ -0.72
YIP1P53039 YBL100CYBL100C 315 nt10.53□□□□□ -0.72
YIP1P53039 WWM1YFL010C 636 nt10.51□□□□□ -0.73
YIP1P53039 LSM3YLR438C-A 270 nt10.47□□□□□ -0.73
YIP1P53039 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.45□□□□□ -0.74
YIP1P53039 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.44□□□□□ -0.74
YIP1P53039 HOM6YJR139C 1080 nt10.43□□□□□ -0.74
YIP1P53039 TRM9YML014W 840 nt10.41□□□□□ -0.74
YIP1P53039 MOT3YMR070W 1473 nt10.41□□□□□ -0.74
YIP1P53039 FUN26YAL022C 1554 nt10.39□□□□□ -0.75
YIP1P53039 YPS1YLR120C 1710 nt10.36□□□□□ -0.75
YIP1P53039 SPT5YML010W 3192 nt10.34□□□□□ -0.75
YIP1P53039 ALF1YNL148C 765 nt10.31□□□□□ -0.76
YIP1P53039 YDR095CYDR095C 411 nt10.3□□□□□ -0.76
YIP1P53039 MNP1YGL068W 585 nt10.3□□□□□ -0.76
YIP1P53039 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.29□□□□□ -0.76
YIP1P53039 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.29□□□□□ -0.76
YIP1P53039 RKM5YLR137W 1104 nt10.29□□□□□ -0.76
YIP1P53039 CCT6YDR188W 1641 nt10.29□□□□□ -0.76
YIP1P53039 YOL037CYOL037C 354 nt10.27□□□□□ -0.77
YIP1P53039 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.26□□□□□ -0.77
YIP1P53039 MEP2YNL142W 1500 nt10.25□□□□□ -0.77
YIP1P53039 FPS1YLL043W 2010 nt10.23□□□□□ -0.77
YIP1P53039 NPL3YDR432W 1245 nt10.23□□□□□ -0.77
YIP1P53039 SSA4YER103W 1929 nt10.22□□□□□ -0.77
YIP1P53039 YJL225CYJL225C 5277 nt10.21□□□□□ -0.78
YIP1P53039 NVJ2YPR091C 2313 nt10.19□□□□□ -0.78
YIP1P53039 YOR139CYOR139C 393 nt10.18□□□□□ -0.78
YIP1P53039 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.16□□□□□ -0.78
YIP1P53039 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.16□□□□□ -0.78
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