Protein–RNA interactions for Protein: P40896

YJL213W, Uncharacterized protein YJL213W, yeastyeast

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL213WP40896 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.41■□□□□ 0.22
YJL213WP40896 NSR1YGR159C 1245 nt16.39■□□□□ 0.21
YJL213WP40896 NOP1YDL014W 984 nt15.92■□□□□ 0.14
YJL213WP40896 MDJ1YFL016C 1536 nt14.73□□□□□ -0.05
YJL213WP40896 YKL036CYKL036C 393 nt14.62□□□□□ -0.07
YJL213WP40896 Q0297Q0297 156 nt13.88□□□□□ -0.19
YJL213WP40896 SRX1YKL086W 384 nt13.88□□□□□ -0.19
YJL213WP40896 YJL027CYJL027C 417 nt13.64□□□□□ -0.23
YJL213WP40896 SCS3YGL126W 1143 nt13.24□□□□□ -0.29
YJL213WP40896 YCR051WYCR051W 669 nt13.18□□□□□ -0.3
YJL213WP40896 DBP2YNL112W 1641 nt12.99□□□□□ -0.33
YJL213WP40896 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL213WP40896 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL213WP40896 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL213WP40896 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL213WP40896 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL213WP40896 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL213WP40896 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL213WP40896 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL213WP40896 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL213WP40896 YOL085CYOL085C 342 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL213WP40896 YBR190WYBR190W 312 nt12.54□□□□□ -0.4
YJL213WP40896 CCC1YLR220W 969 nt12.53□□□□□ -0.4
YJL213WP40896 PKP1YIL042C 1185 nt12.48□□□□□ -0.41
YJL213WP40896 RPP1BYDL130W 321 nt12.45□□□□□ -0.42
YJL213WP40896 RTC3YHR087W 336 nt12.27□□□□□ -0.45
YJL213WP40896 SSA3YBL075C 1950 nt12.16□□□□□ -0.46
YJL213WP40896 SCJ1YMR214W 1134 nt12.1□□□□□ -0.47
YJL213WP40896 RVS167YDR388W 1449 nt12.09□□□□□ -0.47
YJL213WP40896 PET122YER153C 765 nt11.94□□□□□ -0.5
YJL213WP40896 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.93□□□□□ -0.5
YJL213WP40896 ATS1YAL020C 1002 nt11.87□□□□□ -0.51
YJL213WP40896 SCR1SCR1 522 nt11.82□□□□□ -0.52
YJL213WP40896 SHR5YOL110W 714 nt11.69□□□□□ -0.54
YJL213WP40896 RRN5YLR141W 1092 nt11.59□□□□□ -0.55
YJL213WP40896 PUT4YOR348C 1884 nt11.52□□□□□ -0.57
YJL213WP40896 YDJ1YNL064C 1230 nt11.51□□□□□ -0.57
YJL213WP40896 URN1YPR152C 1398 nt11.45□□□□□ -0.58
YJL213WP40896 DEP1YAL013W 1218 nt11.45□□□□□ -0.58
YJL213WP40896 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.35□□□□□ -0.59
YJL213WP40896 GAR1YHR089C 618 nt11.31□□□□□ -0.6
YJL213WP40896 SAH1YER043C 1350 nt11.3□□□□□ -0.6
YJL213WP40896 OPI9YLR338W 858 nt11.3□□□□□ -0.6
YJL213WP40896 RSB1YOR049C 1065 nt11.29□□□□□ -0.6
YJL213WP40896 ARE1YCR048W 1833 nt11.28□□□□□ -0.6
YJL213WP40896 YNL208WYNL208W 600 nt11.2□□□□□ -0.62
YJL213WP40896 RPN10YHR200W 807 nt11.19□□□□□ -0.62
YJL213WP40896 POA1YBR022W 534 nt11.18□□□□□ -0.62
YJL213WP40896 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.13□□□□□ -0.63
YJL213WP40896 PST2YDR032C 597 nt10.98□□□□□ -0.65
YJL213WP40896 BSC6YOL137W 1494 nt10.94□□□□□ -0.66
YJL213WP40896 PUN1YLR414C 792 nt10.94□□□□□ -0.66
YJL213WP40896 TIR1YER011W 765 nt10.92□□□□□ -0.66
YJL213WP40896 YJR018WYJR018W 363 nt10.91□□□□□ -0.66
YJL213WP40896 PTC2YER089C 1395 nt10.88□□□□□ -0.67
YJL213WP40896 BUD23YCR047C 828 nt10.87□□□□□ -0.67
YJL213WP40896 SSA1YAL005C 1929 nt10.84□□□□□ -0.67
YJL213WP40896 YJR120WYJR120W 351 nt10.78□□□□□ -0.68
YJL213WP40896 NAB2YGL122C 1578 nt10.72□□□□□ -0.69
YJL213WP40896 SRB2YHR041C 633 nt10.71□□□□□ -0.69
YJL213WP40896 RPP2BYDR382W 333 nt10.62□□□□□ -0.71
YJL213WP40896 FIS1YIL065C 468 nt10.59□□□□□ -0.71
YJL213WP40896 YKL097CYKL097C 411 nt10.58□□□□□ -0.72
YJL213WP40896 DAL1YIR027C 1383 nt10.56□□□□□ -0.72
YJL213WP40896 FPR4YLR449W 1179 nt10.56□□□□□ -0.72
YJL213WP40896 INM2YDR287W 879 nt10.52□□□□□ -0.73
YJL213WP40896 SHU1YHL006C 453 nt10.52□□□□□ -0.73
YJL213WP40896 SPT5YML010W 3192 nt10.51□□□□□ -0.73
YJL213WP40896 PHO4YFR034C 939 nt10.48□□□□□ -0.73
YJL213WP40896 WWM1YFL010C 636 nt10.45□□□□□ -0.74
YJL213WP40896 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.44□□□□□ -0.74
YJL213WP40896 SSA4YER103W 1929 nt10.42□□□□□ -0.74
YJL213WP40896 BDH2YAL061W 1254 nt10.41□□□□□ -0.74
YJL213WP40896 YBL100CYBL100C 315 nt10.41□□□□□ -0.74
YJL213WP40896 YGR021WYGR021W 873 nt10.34□□□□□ -0.75
YJL213WP40896 YPS1YLR120C 1710 nt10.31□□□□□ -0.76
YJL213WP40896 FUN26YAL022C 1554 nt10.3□□□□□ -0.76
YJL213WP40896 HOM6YJR139C 1080 nt10.29□□□□□ -0.76
YJL213WP40896 PAC11YDR488C 1602 nt10.28□□□□□ -0.76
YJL213WP40896 MEP2YNL142W 1500 nt10.28□□□□□ -0.76
YJL213WP40896 MNP1YGL068W 585 nt10.24□□□□□ -0.77
YJL213WP40896 LSM3YLR438C-A 270 nt10.24□□□□□ -0.77
YJL213WP40896 YDR095CYDR095C 411 nt10.23□□□□□ -0.77
YJL213WP40896 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.23□□□□□ -0.77
YJL213WP40896 TRM9YML014W 840 nt10.23□□□□□ -0.77
YJL213WP40896 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.21□□□□□ -0.77
YJL213WP40896 ALF1YNL148C 765 nt10.15□□□□□ -0.78
YJL213WP40896 DCW1YKL046C 1350 nt10.14□□□□□ -0.79
YJL213WP40896 RKM5YLR137W 1104 nt10.13□□□□□ -0.79
YJL213WP40896 CCT6YDR188W 1641 nt10.13□□□□□ -0.79
YJL213WP40896 BDF1YLR399C 2061 nt10.12□□□□□ -0.79
YJL213WP40896 NVJ2YPR091C 2313 nt10.1□□□□□ -0.79
YJL213WP40896 NPL3YDR432W 1245 nt10.09□□□□□ -0.79
YJL213WP40896 YOL037CYOL037C 354 nt10.07□□□□□ -0.8
YJL213WP40896 YOR139CYOR139C 393 nt10.07□□□□□ -0.8
YJL213WP40896 PTP1YDL230W 1008 nt10.06□□□□□ -0.8
YJL213WP40896 RPP2AYOL039W 321 nt10.04□□□□□ -0.8
YJL213WP40896 SIS1YNL007C 1059 nt10.03□□□□□ -0.8
YJL213WP40896 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.02□□□□□ -0.81
YJL213WP40896 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.8 ms