Protein–RNA interactions for Protein: Q04893

YMR317W, Uncharacterized protein YMR317W, yeastyeast

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR317WQ04893 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.84■□□□□ 0.29
YMR317WQ04893 NSR1YGR159C 1245 nt16.61■□□□□ 0.25
YMR317WQ04893 NOP1YDL014W 984 nt16.46■□□□□ 0.23
YMR317WQ04893 YKL036CYKL036C 393 nt15.33■□□□□ 0.04
YMR317WQ04893 MDJ1YFL016C 1536 nt14.56□□□□□ -0.08
YMR317WQ04893 Q0297Q0297 156 nt14.45□□□□□ -0.1
YMR317WQ04893 SRX1YKL086W 384 nt14.37□□□□□ -0.11
YMR317WQ04893 YJL027CYJL027C 417 nt14.34□□□□□ -0.11
YMR317WQ04893 SCS3YGL126W 1143 nt14.01□□□□□ -0.17
YMR317WQ04893 YCR051WYCR051W 669 nt13.66□□□□□ -0.22
YMR317WQ04893 YOL085CYOL085C 342 nt13.27□□□□□ -0.29
YMR317WQ04893 PKP1YIL042C 1185 nt13.05□□□□□ -0.32
YMR317WQ04893 RPP1BYDL130W 321 nt12.97□□□□□ -0.33
YMR317WQ04893 DBP2YNL112W 1641 nt12.94□□□□□ -0.34
YMR317WQ04893 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR317WQ04893 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR317WQ04893 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR317WQ04893 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR317WQ04893 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR317WQ04893 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR317WQ04893 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR317WQ04893 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR317WQ04893 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR317WQ04893 CCC1YLR220W 969 nt12.79□□□□□ -0.36
YMR317WQ04893 SCJ1YMR214W 1134 nt12.62□□□□□ -0.39
YMR317WQ04893 ATS1YAL020C 1002 nt12.59□□□□□ -0.39
YMR317WQ04893 YBR190WYBR190W 312 nt12.4□□□□□ -0.42
YMR317WQ04893 PET122YER153C 765 nt12.36□□□□□ -0.43
YMR317WQ04893 SCR1SCR1 522 nt12.29□□□□□ -0.44
YMR317WQ04893 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.25□□□□□ -0.45
YMR317WQ04893 RVS167YDR388W 1449 nt12.23□□□□□ -0.45
YMR317WQ04893 RTC3YHR087W 336 nt12.15□□□□□ -0.46
YMR317WQ04893 RRN5YLR141W 1092 nt12.04□□□□□ -0.48
YMR317WQ04893 YDJ1YNL064C 1230 nt11.85□□□□□ -0.51
YMR317WQ04893 SHR5YOL110W 714 nt11.84□□□□□ -0.51
YMR317WQ04893 RSB1YOR049C 1065 nt11.84□□□□□ -0.51
YMR317WQ04893 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.8□□□□□ -0.52
YMR317WQ04893 PST2YDR032C 597 nt11.63□□□□□ -0.55
YMR317WQ04893 GAR1YHR089C 618 nt11.57□□□□□ -0.56
YMR317WQ04893 SSA3YBL075C 1950 nt11.56□□□□□ -0.56
YMR317WQ04893 DEP1YAL013W 1218 nt11.47□□□□□ -0.57
YMR317WQ04893 URN1YPR152C 1398 nt11.41□□□□□ -0.58
YMR317WQ04893 YNL208WYNL208W 600 nt11.3□□□□□ -0.6
YMR317WQ04893 RPN10YHR200W 807 nt11.29□□□□□ -0.6
YMR317WQ04893 YKL097CYKL097C 411 nt11.26□□□□□ -0.61
YMR317WQ04893 OPI9YLR338W 858 nt11.21□□□□□ -0.61
YMR317WQ04893 TIR1YER011W 765 nt11.17□□□□□ -0.62
YMR317WQ04893 SHU1YHL006C 453 nt11.12□□□□□ -0.63
YMR317WQ04893 SAH1YER043C 1350 nt11.1□□□□□ -0.63
YMR317WQ04893 PUT4YOR348C 1884 nt11.1□□□□□ -0.63
YMR317WQ04893 SSA1YAL005C 1929 nt10.98□□□□□ -0.65
YMR317WQ04893 ARE1YCR048W 1833 nt10.95□□□□□ -0.66
YMR317WQ04893 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.92□□□□□ -0.66
YMR317WQ04893 YJR018WYJR018W 363 nt10.91□□□□□ -0.66
YMR317WQ04893 PUN1YLR414C 792 nt10.89□□□□□ -0.67
YMR317WQ04893 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.82□□□□□ -0.68
YMR317WQ04893 SRB2YHR041C 633 nt10.81□□□□□ -0.68
YMR317WQ04893 POA1YBR022W 534 nt10.8□□□□□ -0.68
YMR317WQ04893 YOR139CYOR139C 393 nt10.76□□□□□ -0.69
YMR317WQ04893 RPP2BYDR382W 333 nt10.74□□□□□ -0.69
YMR317WQ04893 YJR120WYJR120W 351 nt10.73□□□□□ -0.69
YMR317WQ04893 PTC2YER089C 1395 nt10.73□□□□□ -0.69
YMR317WQ04893 WWM1YFL010C 636 nt10.71□□□□□ -0.69
YMR317WQ04893 YGR021WYGR021W 873 nt10.69□□□□□ -0.7
YMR317WQ04893 NPL3YDR432W 1245 nt10.66□□□□□ -0.7
YMR317WQ04893 HOM6YJR139C 1080 nt10.65□□□□□ -0.7
YMR317WQ04893 BUD23YCR047C 828 nt10.61□□□□□ -0.71
YMR317WQ04893 MNP1YGL068W 585 nt10.61□□□□□ -0.71
YMR317WQ04893 NAB2YGL122C 1578 nt10.56□□□□□ -0.72
YMR317WQ04893 BDH2YAL061W 1254 nt10.54□□□□□ -0.72
YMR317WQ04893 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.53□□□□□ -0.72
YMR317WQ04893 BSC6YOL137W 1494 nt10.51□□□□□ -0.73
YMR317WQ04893 INM2YDR287W 879 nt10.51□□□□□ -0.73
YMR317WQ04893 YOL037CYOL037C 354 nt10.5□□□□□ -0.73
YMR317WQ04893 RKM5YLR137W 1104 nt10.49□□□□□ -0.73
YMR317WQ04893 FPR4YLR449W 1179 nt10.46□□□□□ -0.73
YMR317WQ04893 DAL1YIR027C 1383 nt10.46□□□□□ -0.74
YMR317WQ04893 LSM3YLR438C-A 270 nt10.45□□□□□ -0.74
YMR317WQ04893 YBL100CYBL100C 315 nt10.42□□□□□ -0.74
YMR317WQ04893 FIS1YIL065C 468 nt10.39□□□□□ -0.75
YMR317WQ04893 PHO4YFR034C 939 nt10.35□□□□□ -0.75
YMR317WQ04893 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.35□□□□□ -0.75
YMR317WQ04893 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.35□□□□□ -0.75
YMR317WQ04893 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.35□□□□□ -0.75
YMR317WQ04893 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.35□□□□□ -0.75
YMR317WQ04893 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.35□□□□□ -0.75
YMR317WQ04893 TRM9YML014W 840 nt10.34□□□□□ -0.75
YMR317WQ04893 FUN26YAL022C 1554 nt10.31□□□□□ -0.76
YMR317WQ04893 YLR281CYLR281C 468 nt10.27□□□□□ -0.77
YMR317WQ04893 PUS2YGL063W 1113 nt10.25□□□□□ -0.77
YMR317WQ04893 WHI5YOR083W 888 nt10.22□□□□□ -0.77
YMR317WQ04893 CCT6YDR188W 1641 nt10.18□□□□□ -0.78
YMR317WQ04893 ALF1YNL148C 765 nt10.13□□□□□ -0.79
YMR317WQ04893 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.11□□□□□ -0.79
YMR317WQ04893 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.11□□□□□ -0.79
YMR317WQ04893 YPS1YLR120C 1710 nt10.08□□□□□ -0.8
YMR317WQ04893 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.08□□□□□ -0.8
YMR317WQ04893 SPT5YML010W 3192 nt10.08□□□□□ -0.8
YMR317WQ04893 YDR095CYDR095C 411 nt10.04□□□□□ -0.8
YMR317WQ04893 SSA4YER103W 1929 nt10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms