RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	YCR061W	P25639	631 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	GSH1	P32477	678 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	GSM1	P42950	618 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	ACS1	Q01574	713 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	FMP42	Q04991	504 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	SIP1	P32578	815 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	YBR139W	P38109	508 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	BZZ1	P38822	633 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	QRI7	P43122	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	THI3	Q07471	609 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	DAL3	P32459	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	YOX1	P34161	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	SPC105	P53148	917 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	HOL1	P53389	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	YNR071C	P53757	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	TAH18	Q12181	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	CTT1	P06115	562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	STL1	P39932	569 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	YND1	P40009	630 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	VFA1	P40080	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	UBP8	P50102	471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	PDR8	Q06149	701 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	OCT1	P35999	772 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	MAD2	P40958	196 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	CRF1	Q04930	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEM1	YHR004C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	EAF5	P39995	279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	SLD3	P53135	668 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	ECI1	Q05871	280 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	DIN7	Q12086	430 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	TIP41	Q12199	356 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	MNN2	P38069	597 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	TPM2	P40414	161 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	UBP7	P40453	1071 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	TRI1	Q05024	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	POS5	Q06892	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	EMP65	P40085	556 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	CRZ1	P53968	678 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	TRS31	Q03337	283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	IZH1	Q03419	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	MCH4	Q08268	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	PDE1	P22434	369 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	DPB3	P27344	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	ERC1	P38767	581 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	VPS41	P38959	992 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	SND1	Q04007	877 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	PIG1	Q06216	648 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	CDC23	P16522	626 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	GRX4	P32642	244 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	GRX7	P38068	203 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	FCP1	Q03254	732 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	CAC2	Q04199	468 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	SWF1	Q04629	336 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEM1	YHR004C	KAR1	P11927	433 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	CDC1	P40986	491 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	NIT2	P47016	307 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	YJR142W	P47173	342 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	TAF5	P38129	798 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	YPR003C	P53394	754 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	ARP9	Q05123	467 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	YOL057W	Q08225	711 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	LAC1	P28496	418 aa		4.5	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	ASG1	P40467	964 aa		4.5	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	CUL3	P53202	744 aa		4.5	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	PSF3	Q12146	194 aa		4.5	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	YJL070C	P40361	888 aa		4.49	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	POL31	P46957	487 aa		4.49	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	NPA3	P47122	385 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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