Protein–RNA interactions for Protein: P28004

PRP45, Pre-mRNA-processing protein 45, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP45P28004 YML009W-BYML009W-B 477 nt27.39■■□□□ 1.98
PRP45P28004 NOP1YDL014W 984 nt26.87■■□□□ 1.89
PRP45P28004 NSR1YGR159C 1245 nt26.64■■□□□ 1.86
PRP45P28004 YKL036CYKL036C 393 nt25.44■■□□□ 1.66
PRP45P28004 YJL027CYJL027C 417 nt23.88■■□□□ 1.41
PRP45P28004 Q0297Q0297 156 nt23.76■■□□□ 1.39
PRP45P28004 SCS3YGL126W 1143 nt23.51■■□□□ 1.35
PRP45P28004 SRX1YKL086W 384 nt23.51■■□□□ 1.35
PRP45P28004 MDJ1YFL016C 1536 nt23.03■■□□□ 1.28
PRP45P28004 YCR051WYCR051W 669 nt22.36■■□□□ 1.17
PRP45P28004 YOL085CYOL085C 342 nt22.04■■□□□ 1.12
PRP45P28004 PKP1YIL042C 1185 nt21.64■■□□□ 1.05
PRP45P28004 SCJ1YMR214W 1134 nt21.64■■□□□ 1.05
PRP45P28004 RPP1BYDL130W 321 nt21.33■■□□□ 1.01
PRP45P28004 ATS1YAL020C 1002 nt21.22■□□□□ 0.99
PRP45P28004 TRN1tP(UGG)A 72 nt20.86■□□□□ 0.93
PRP45P28004 SUF9tP(UGG)F 72 nt20.86■□□□□ 0.93
PRP45P28004 SUF8tP(UGG)H 72 nt20.86■□□□□ 0.93
PRP45P28004 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt20.86■□□□□ 0.93
PRP45P28004 SUF7tP(UGG)M 72 nt20.86■□□□□ 0.93
PRP45P28004 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt20.86■□□□□ 0.93
PRP45P28004 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt20.86■□□□□ 0.93
PRP45P28004 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt20.86■□□□□ 0.93
PRP45P28004 SUF11tP(UGG)O2 72 nt20.86■□□□□ 0.93
PRP45P28004 DBP2YNL112W 1641 nt20.68■□□□□ 0.9
PRP45P28004 CCC1YLR220W 969 nt20.68■□□□□ 0.9
PRP45P28004 PET122YER153C 765 nt20.31■□□□□ 0.84
PRP45P28004 SCR1SCR1 522 nt20.25■□□□□ 0.83
PRP45P28004 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt19.97■□□□□ 0.79
PRP45P28004 RRN5YLR141W 1092 nt19.81■□□□□ 0.76
PRP45P28004 RTC3YHR087W 336 nt19.7■□□□□ 0.74
PRP45P28004 RSB1YOR049C 1065 nt19.58■□□□□ 0.72
PRP45P28004 PST2YDR032C 597 nt19.56■□□□□ 0.72
PRP45P28004 RVS167YDR388W 1449 nt19.53■□□□□ 0.72
PRP45P28004 YBR190WYBR190W 312 nt19.44■□□□□ 0.7
PRP45P28004 YER088W-BYER088W-B 147 nt19.42■□□□□ 0.7
PRP45P28004 YDJ1YNL064C 1230 nt19.28■□□□□ 0.68
PRP45P28004 YKL097CYKL097C 411 nt19.1■□□□□ 0.65
PRP45P28004 SHR5YOL110W 714 nt19.03■□□□□ 0.64
PRP45P28004 GAR1YHR089C 618 nt18.78■□□□□ 0.6
PRP45P28004 SHU1YHL006C 453 nt18.6■□□□□ 0.57
PRP45P28004 DEP1YAL013W 1218 nt18.3■□□□□ 0.52
PRP45P28004 YOR139CYOR139C 393 nt18.25■□□□□ 0.51
PRP45P28004 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt18.13■□□□□ 0.49
PRP45P28004 TIR1YER011W 765 nt18.11■□□□□ 0.49
PRP45P28004 URN1YPR152C 1398 nt18.1■□□□□ 0.49
PRP45P28004 YNL208WYNL208W 600 nt18.06■□□□□ 0.48
PRP45P28004 RPN10YHR200W 807 nt17.94■□□□□ 0.46
PRP45P28004 NPL3YDR432W 1245 nt17.91■□□□□ 0.46
PRP45P28004 SSA1YAL005C 1929 nt17.78■□□□□ 0.44
PRP45P28004 OPI9YLR338W 858 nt17.68■□□□□ 0.42
PRP45P28004 SRB2YHR041C 633 nt17.64■□□□□ 0.41
PRP45P28004 MNP1YGL068W 585 nt17.53■□□□□ 0.4
PRP45P28004 HOM6YJR139C 1080 nt17.51■□□□□ 0.39
PRP45P28004 YGR021WYGR021W 873 nt17.5■□□□□ 0.39
PRP45P28004 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt17.49■□□□□ 0.39
PRP45P28004 IMT4tM(CAU)E 72 nt17.49■□□□□ 0.39
PRP45P28004 IMT3tM(CAU)J3 72 nt17.49■□□□□ 0.39
PRP45P28004 IMT1tM(CAU)O1 72 nt17.49■□□□□ 0.39
PRP45P28004 IMT2tM(CAU)P 72 nt17.49■□□□□ 0.39
PRP45P28004 YOL037CYOL037C 354 nt17.47■□□□□ 0.39
PRP45P28004 WWM1YFL010C 636 nt17.44■□□□□ 0.38
PRP45P28004 SAH1YER043C 1350 nt17.42■□□□□ 0.38
PRP45P28004 YJR018WYJR018W 363 nt17.3■□□□□ 0.36
PRP45P28004 RKM5YLR137W 1104 nt17.25■□□□□ 0.35
PRP45P28004 YJR120WYJR120W 351 nt17.2■□□□□ 0.34
PRP45P28004 PUT4YOR348C 1884 nt17.16■□□□□ 0.34
PRP45P28004 PUN1YLR414C 792 nt17.16■□□□□ 0.34
PRP45P28004 RPP2BYDR382W 333 nt17.11■□□□□ 0.33
PRP45P28004 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt17.11■□□□□ 0.33
PRP45P28004 PUS2YGL063W 1113 nt17.11■□□□□ 0.33
PRP45P28004 ARE1YCR048W 1833 nt17.07■□□□□ 0.32
PRP45P28004 MOT3YMR070W 1473 nt17.06■□□□□ 0.32
PRP45P28004 YLR281CYLR281C 468 nt17.05■□□□□ 0.32
PRP45P28004 SSA3YBL075C 1950 nt17.02■□□□□ 0.32
PRP45P28004 BDH2YAL061W 1254 nt16.9■□□□□ 0.3
PRP45P28004 WHI5YOR083W 888 nt16.89■□□□□ 0.29
PRP45P28004 BSC6YOL137W 1494 nt16.87■□□□□ 0.29
PRP45P28004 PTC2YER089C 1395 nt16.87■□□□□ 0.29
PRP45P28004 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.82■□□□□ 0.28
PRP45P28004 LSM3YLR438C-A 270 nt16.81■□□□□ 0.28
PRP45P28004 POA1YBR022W 534 nt16.69■□□□□ 0.26
PRP45P28004 FMP45YDL222C 930 nt16.67■□□□□ 0.26
PRP45P28004 YPR011CYPR011C 981 nt16.67■□□□□ 0.26
PRP45P28004 MRPL8YJL063C 717 nt16.61■□□□□ 0.25
PRP45P28004 DSK2YMR276W 1122 nt16.6■□□□□ 0.25
PRP45P28004 INM2YDR287W 879 nt16.59■□□□□ 0.25
PRP45P28004 YLR236CYLR236C 324 nt16.55■□□□□ 0.24
PRP45P28004 YBL100CYBL100C 315 nt16.55■□□□□ 0.24
PRP45P28004 YCH1YGR203W 447 nt16.54■□□□□ 0.24
PRP45P28004 NAB2YGL122C 1578 nt16.54■□□□□ 0.24
PRP45P28004 BUD23YCR047C 828 nt16.49■□□□□ 0.23
PRP45P28004 IMP2'YIL154C 1041 nt16.48■□□□□ 0.23
PRP45P28004 TRM9YML014W 840 nt16.47■□□□□ 0.23
PRP45P28004 DAL1YIR027C 1383 nt16.45■□□□□ 0.22
PRP45P28004 FPR4YLR449W 1179 nt16.44■□□□□ 0.22
PRP45P28004 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt16.4■□□□□ 0.22
PRP45P28004 FUN26YAL022C 1554 nt16.38■□□□□ 0.21
PRP45P28004 FIS1YIL065C 468 nt16.38■□□□□ 0.21
PRP45P28004 UBX6YJL048C 1191 nt16.33■□□□□ 0.2
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