Protein–RNA interactions for Protein: Q12046

CWC2, Pre-mRNA-splicing factor CWC2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CWC2Q12046 NSR1YGR159C 1245 nt22.09■■□□□ 1.13
CWC2Q12046 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.06■■□□□ 1.12
CWC2Q12046 NOP1YDL014W 984 nt21.28■■□□□ 1
CWC2Q12046 MDJ1YFL016C 1536 nt19.91■□□□□ 0.78
CWC2Q12046 YKL036CYKL036C 393 nt19.48■□□□□ 0.71
CWC2Q12046 SRX1YKL086W 384 nt18.65■□□□□ 0.58
CWC2Q12046 Q0297Q0297 156 nt18.63■□□□□ 0.57
CWC2Q12046 YJL027CYJL027C 417 nt18.27■□□□□ 0.52
CWC2Q12046 YCR051WYCR051W 669 nt17.68■□□□□ 0.42
CWC2Q12046 SCS3YGL126W 1143 nt17.68■□□□□ 0.42
CWC2Q12046 DBP2YNL112W 1641 nt17.57■□□□□ 0.4
CWC2Q12046 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.03■□□□□ 0.32
CWC2Q12046 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.03■□□□□ 0.32
CWC2Q12046 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.03■□□□□ 0.32
CWC2Q12046 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.03■□□□□ 0.32
CWC2Q12046 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.03■□□□□ 0.32
CWC2Q12046 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.03■□□□□ 0.32
CWC2Q12046 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.03■□□□□ 0.32
CWC2Q12046 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.03■□□□□ 0.32
CWC2Q12046 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.03■□□□□ 0.32
CWC2Q12046 YBR190WYBR190W 312 nt16.96■□□□□ 0.31
CWC2Q12046 YOL085CYOL085C 342 nt16.93■□□□□ 0.3
CWC2Q12046 CCC1YLR220W 969 nt16.85■□□□□ 0.29
CWC2Q12046 PKP1YIL042C 1185 nt16.73■□□□□ 0.27
CWC2Q12046 RPP1BYDL130W 321 nt16.71■□□□□ 0.27
CWC2Q12046 RTC3YHR087W 336 nt16.56■□□□□ 0.24
CWC2Q12046 SCJ1YMR214W 1134 nt16.33■□□□□ 0.2
CWC2Q12046 RVS167YDR388W 1449 nt16.3■□□□□ 0.2
CWC2Q12046 PET122YER153C 765 nt16.04■□□□□ 0.16
CWC2Q12046 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.03■□□□□ 0.16
CWC2Q12046 ATS1YAL020C 1002 nt15.74■□□□□ 0.11
CWC2Q12046 SHR5YOL110W 714 nt15.74■□□□□ 0.11
CWC2Q12046 SCR1SCR1 522 nt15.69■□□□□ 0.1
CWC2Q12046 PUT4YOR348C 1884 nt15.65■□□□□ 0.1
CWC2Q12046 RRN5YLR141W 1092 nt15.54■□□□□ 0.08
CWC2Q12046 YDJ1YNL064C 1230 nt15.48■□□□□ 0.07
CWC2Q12046 URN1YPR152C 1398 nt15.46■□□□□ 0.07
CWC2Q12046 DEP1YAL013W 1218 nt15.42■□□□□ 0.06
CWC2Q12046 ARE1YCR048W 1833 nt15.31■□□□□ 0.04
CWC2Q12046 OPI9YLR338W 858 nt15.27■□□□□ 0.04
CWC2Q12046 SAH1YER043C 1350 nt15.26■□□□□ 0.03
CWC2Q12046 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.25■□□□□ 0.03
CWC2Q12046 GAR1YHR089C 618 nt15.2■□□□□ 0.02
CWC2Q12046 RSB1YOR049C 1065 nt15.12■□□□□ 0.01
CWC2Q12046 POA1YBR022W 534 nt15.12■□□□□ 0.01
CWC2Q12046 SSA3YBL075C 1950 nt15.12■□□□□ 0.01
CWC2Q12046 YNL208WYNL208W 600 nt15.08■□□□□ 0
CWC2Q12046 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.07■□□□□ 0
CWC2Q12046 RPN10YHR200W 807 nt15.07■□□□□ 0
CWC2Q12046 BSC6YOL137W 1494 nt14.83□□□□□ -0.03
CWC2Q12046 PUN1YLR414C 792 nt14.77□□□□□ -0.05
CWC2Q12046 YJR018WYJR018W 363 nt14.71□□□□□ -0.05
CWC2Q12046 PTC2YER089C 1395 nt14.7□□□□□ -0.06
CWC2Q12046 TIR1YER011W 765 nt14.69□□□□□ -0.06
CWC2Q12046 BUD23YCR047C 828 nt14.68□□□□□ -0.06
CWC2Q12046 PST2YDR032C 597 nt14.63□□□□□ -0.07
CWC2Q12046 SSA1YAL005C 1929 nt14.62□□□□□ -0.07
CWC2Q12046 YJR120WYJR120W 351 nt14.56□□□□□ -0.08
CWC2Q12046 NAB2YGL122C 1578 nt14.49□□□□□ -0.09
CWC2Q12046 SRB2YHR041C 633 nt14.43□□□□□ -0.1
CWC2Q12046 SPT5YML010W 3192 nt14.42□□□□□ -0.1
CWC2Q12046 FIS1YIL065C 468 nt14.35□□□□□ -0.11
CWC2Q12046 RPP2BYDR382W 333 nt14.29□□□□□ -0.12
CWC2Q12046 DAL1YIR027C 1383 nt14.28□□□□□ -0.12
CWC2Q12046 FPR4YLR449W 1179 nt14.24□□□□□ -0.13
CWC2Q12046 INM2YDR287W 879 nt14.17□□□□□ -0.14
CWC2Q12046 PHO4YFR034C 939 nt14.17□□□□□ -0.14
CWC2Q12046 SHU1YHL006C 453 nt14.11□□□□□ -0.15
CWC2Q12046 WWM1YFL010C 636 nt14.05□□□□□ -0.16
CWC2Q12046 YBL100CYBL100C 315 nt14.05□□□□□ -0.16
CWC2Q12046 BDH2YAL061W 1254 nt14.03□□□□□ -0.16
CWC2Q12046 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.98□□□□□ -0.17
CWC2Q12046 YPS1YLR120C 1710 nt13.98□□□□□ -0.17
CWC2Q12046 MEP2YNL142W 1500 nt13.94□□□□□ -0.18
CWC2Q12046 SSA4YER103W 1929 nt13.9□□□□□ -0.18
CWC2Q12046 FUN26YAL022C 1554 nt13.89□□□□□ -0.19
CWC2Q12046 YKL097CYKL097C 411 nt13.88□□□□□ -0.19
CWC2Q12046 YDR095CYDR095C 411 nt13.85□□□□□ -0.19
CWC2Q12046 HOM6YJR139C 1080 nt13.83□□□□□ -0.2
CWC2Q12046 YGR021WYGR021W 873 nt13.8□□□□□ -0.2
CWC2Q12046 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.79□□□□□ -0.2
CWC2Q12046 LSM3YLR438C-A 270 nt13.78□□□□□ -0.2
CWC2Q12046 MNP1YGL068W 585 nt13.77□□□□□ -0.21
CWC2Q12046 DCW1YKL046C 1350 nt13.77□□□□□ -0.21
CWC2Q12046 TRM9YML014W 840 nt13.77□□□□□ -0.21
CWC2Q12046 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.76□□□□□ -0.21
CWC2Q12046 CCT6YDR188W 1641 nt13.69□□□□□ -0.22
CWC2Q12046 ALF1YNL148C 765 nt13.67□□□□□ -0.22
CWC2Q12046 PTP1YDL230W 1008 nt13.63□□□□□ -0.23
CWC2Q12046 RKM5YLR137W 1104 nt13.61□□□□□ -0.23
CWC2Q12046 RPP2AYOL039W 321 nt13.56□□□□□ -0.24
CWC2Q12046 CAC2YML102W 1407 nt13.56□□□□□ -0.24
CWC2Q12046 SIS1YNL007C 1059 nt13.54□□□□□ -0.24
CWC2Q12046 EMI2YDR516C 1503 nt13.54□□□□□ -0.24
CWC2Q12046 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.5□□□□□ -0.25
CWC2Q12046 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.5□□□□□ -0.25
CWC2Q12046 YOR139CYOR139C 393 nt13.46□□□□□ -0.25
CWC2Q12046 BDF1YLR399C 2061 nt13.43□□□□□ -0.26
CWC2Q12046 YDL221WYDL221W 552 nt13.42□□□□□ -0.26
CWC2Q12046 ART5YGR068C 1761 nt13.39□□□□□ -0.27
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