RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trdv2-1A0A0G2JGB9 116 aa11,16□□□□□ -0,62
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Ltb-201ENSMUST00000025262 PlnP61014 52 aa11,16□□□□□ -0,62
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm1968Q3T9I3 115 aa11,16□□□□□ -0,62
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q3UNZ8 350 aa11,15□□□□□ -0,62
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem97Q8VD00 176 aa11,15□□□□□ -0,62
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ifitm1Q9D103 106 aa11,15□□□□□ -0,62
Ltb-201ENSMUST00000025262 Obox2E9PXV9 151 aa11,14□□□□□ -0,63
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm20726G3UX18 150 aa11,14□□□□□ -0,63
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm21693J3QK27 380 aa11,14□□□□□ -0,63
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam213bQ9DB60 201 aa11,13□□□□□ -0,63
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm10061D3Z714 54 aa11,12□□□□□ -0,63
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm11569B1AQB1 180 aa11,11□□□□□ -0,63
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Ltb-201ENSMUST00000025262 BC025920Q3US60 128 aa11,08□□□□□ -0,64
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Cib3Q0P523 160 aa11,04□□□□□ -0,64
Ltb-201ENSMUST00000025262 Scgb1b15A0A087WP50 93 aa11,03□□□□□ -0,64
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trav11A0A0B4J1J9 114 aa11,03□□□□□ -0,64
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cks1bP61025 79 aa11,03□□□□□ -0,64
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rpl18aP62717 176 aaKnown RBP11,03□□□□□ -0,64
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cystm1Q8K353 104 aa11,03□□□□□ -0,64
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ifi27l2bQ8VC49 283 aa11,03□□□□□ -0,64
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pam16Q9CQV1 125 aa11,03□□□□□ -0,64
Ltb-201ENSMUST00000025262 Josd1Q9DBJ6 202 aa11,03□□□□□ -0,64
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Ss18l2Q9D174 77 aa11,01□□□□□ -0,65
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Trav13-2A0A075B649 110 aa10,83□□□□□ -0,68
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