Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22,36■■□□□ 1,17
Ccdc179J3QM76 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Ccdc179J3QM76 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ccdc179J3QM76 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ccdc179J3QM76 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Ccdc179J3QM76 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Ccdc179J3QM76 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19,93■□□□□ 0,78
Ccdc179J3QM76 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19,47■□□□□ 0,71
Ccdc179J3QM76 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19,41■□□□□ 0,7
Ccdc179J3QM76 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Ccdc179J3QM76 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,31■□□□□ 0,68
Ccdc179J3QM76 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Ccdc179J3QM76 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19,16■□□□□ 0,66
Ccdc179J3QM76 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Ccdc179J3QM76 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC19,06■□□□□ 0,64
Ccdc179J3QM76 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Ccdc179J3QM76 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19■□□□□ 0,63
Ccdc179J3QM76 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Ccdc179J3QM76 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Ccdc179J3QM76 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Ccdc179J3QM76 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18,85■□□□□ 0,61
Ccdc179J3QM76 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Ccdc179J3QM76 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Ccdc179J3QM76 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Ccdc179J3QM76 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,62■□□□□ 0,57
Ccdc179J3QM76 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,61■□□□□ 0,57
Ccdc179J3QM76 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,54■□□□□ 0,56
Ccdc179J3QM76 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,54■□□□□ 0,56
Ccdc179J3QM76 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,52■□□□□ 0,56
Ccdc179J3QM76 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18,51■□□□□ 0,55
Ccdc179J3QM76 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,51■□□□□ 0,55
Ccdc179J3QM76 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,48■□□□□ 0,55
Ccdc179J3QM76 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,47■□□□□ 0,55
Ccdc179J3QM76 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18,46■□□□□ 0,55
Ccdc179J3QM76 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18,38■□□□□ 0,53
Ccdc179J3QM76 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18,37■□□□□ 0,53
Ccdc179J3QM76 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18,29■□□□□ 0,52
Ccdc179J3QM76 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
Ccdc179J3QM76 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,25■□□□□ 0,51
Ccdc179J3QM76 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Ccdc179J3QM76 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,15■□□□□ 0,5
Ccdc179J3QM76 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18,14■□□□□ 0,49
Ccdc179J3QM76 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Ccdc179J3QM76 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Ccdc179J3QM76 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Ccdc179J3QM76 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Ccdc179J3QM76 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC17,84■□□□□ 0,45
Ccdc179J3QM76 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Ccdc179J3QM76 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Ccdc179J3QM76 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Ccdc179J3QM76 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Ccdc179J3QM76 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Ccdc179J3QM76 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC17,69■□□□□ 0,42
Ccdc179J3QM76 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Ccdc179J3QM76 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Ccdc179J3QM76 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Ccdc179J3QM76 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Ccdc179J3QM76 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17,67■□□□□ 0,42
Ccdc179J3QM76 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Ccdc179J3QM76 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17,66■□□□□ 0,42
Ccdc179J3QM76 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,63■□□□□ 0,41
Ccdc179J3QM76 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
Ccdc179J3QM76 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,58■□□□□ 0,4
Ccdc179J3QM76 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Ccdc179J3QM76 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,56■□□□□ 0,4
Ccdc179J3QM76 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Ccdc179J3QM76 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17,55■□□□□ 0,4
Ccdc179J3QM76 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,4
Ccdc179J3QM76 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,4
Ccdc179J3QM76 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17,5■□□□□ 0,39
Ccdc179J3QM76 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17,49■□□□□ 0,39
Ccdc179J3QM76 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17,48■□□□□ 0,39
Ccdc179J3QM76 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Ccdc179J3QM76 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17,47■□□□□ 0,39
Ccdc179J3QM76 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17,47■□□□□ 0,39
Ccdc179J3QM76 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17,46■□□□□ 0,39
Ccdc179J3QM76 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,44■□□□□ 0,38
Ccdc179J3QM76 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,44■□□□□ 0,38
Ccdc179J3QM76 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17,41■□□□□ 0,38
Ccdc179J3QM76 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Ccdc179J3QM76 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Ccdc179J3QM76 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Ccdc179J3QM76 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Ccdc179J3QM76 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17,35■□□□□ 0,37
Ccdc179J3QM76 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Ccdc179J3QM76 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17,32■□□□□ 0,36
Ccdc179J3QM76 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,27■□□□□ 0,36
Ccdc179J3QM76 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
Ccdc179J3QM76 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17,25■□□□□ 0,35
Ccdc179J3QM76 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,24■□□□□ 0,35
Ccdc179J3QM76 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17,23■□□□□ 0,35
Ccdc179J3QM76 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17,21■□□□□ 0,35
Ccdc179J3QM76 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Ccdc179J3QM76 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Ccdc179J3QM76 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Ccdc179J3QM76 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,13■□□□□ 0,33
Ccdc179J3QM76 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Ccdc179J3QM76 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Ccdc179J3QM76 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
Ccdc179J3QM76 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms