Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP50

Scgb1b15, ABPA15_a17, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb1b15A0A087WP50 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Scgb1b15A0A087WP50 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Scgb1b15A0A087WP50 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Scgb1b15A0A087WP50 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,51
Scgb1b15A0A087WP50 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,35■■□□□ 1,49
Scgb1b15A0A087WP50 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Scgb1b15A0A087WP50 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Scgb1b15A0A087WP50 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Scgb1b15A0A087WP50 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Scgb1b15A0A087WP50 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Scgb1b15A0A087WP50 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Scgb1b15A0A087WP50 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Scgb1b15A0A087WP50 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,27■■□□□ 1,32
Scgb1b15A0A087WP50 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Scgb1b15A0A087WP50 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Scgb1b15A0A087WP50 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Scgb1b15A0A087WP50 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Scgb1b15A0A087WP50 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Scgb1b15A0A087WP50 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Scgb1b15A0A087WP50 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,76■■□□□ 1,23
Scgb1b15A0A087WP50 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Scgb1b15A0A087WP50 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Scgb1b15A0A087WP50 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Scgb1b15A0A087WP50 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Scgb1b15A0A087WP50 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Scgb1b15A0A087WP50 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Scgb1b15A0A087WP50 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,3■■□□□ 1,16
Scgb1b15A0A087WP50 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22,26■■□□□ 1,15
Scgb1b15A0A087WP50 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Scgb1b15A0A087WP50 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Scgb1b15A0A087WP50 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Scgb1b15A0A087WP50 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,08■■□□□ 1,13
Scgb1b15A0A087WP50 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Scgb1b15A0A087WP50 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Scgb1b15A0A087WP50 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Scgb1b15A0A087WP50 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Scgb1b15A0A087WP50 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Scgb1b15A0A087WP50 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Scgb1b15A0A087WP50 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Scgb1b15A0A087WP50 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Scgb1b15A0A087WP50 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Scgb1b15A0A087WP50 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Scgb1b15A0A087WP50 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Scgb1b15A0A087WP50 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Scgb1b15A0A087WP50 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Scgb1b15A0A087WP50 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Scgb1b15A0A087WP50 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Scgb1b15A0A087WP50 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Scgb1b15A0A087WP50 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Scgb1b15A0A087WP50 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Scgb1b15A0A087WP50 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Scgb1b15A0A087WP50 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Scgb1b15A0A087WP50 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Scgb1b15A0A087WP50 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Scgb1b15A0A087WP50 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Scgb1b15A0A087WP50 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,39■■□□□ 1,01
Scgb1b15A0A087WP50 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Scgb1b15A0A087WP50 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Scgb1b15A0A087WP50 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,33■■□□□ 1
Scgb1b15A0A087WP50 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Scgb1b15A0A087WP50 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,23■□□□□ 0,99
Scgb1b15A0A087WP50 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Scgb1b15A0A087WP50 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Scgb1b15A0A087WP50 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Scgb1b15A0A087WP50 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Scgb1b15A0A087WP50 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,12■□□□□ 0,97
Scgb1b15A0A087WP50 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Scgb1b15A0A087WP50 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Scgb1b15A0A087WP50 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Scgb1b15A0A087WP50 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Scgb1b15A0A087WP50 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Scgb1b15A0A087WP50 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Scgb1b15A0A087WP50 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Scgb1b15A0A087WP50 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Scgb1b15A0A087WP50 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Scgb1b15A0A087WP50 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Scgb1b15A0A087WP50 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Scgb1b15A0A087WP50 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Scgb1b15A0A087WP50 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Scgb1b15A0A087WP50 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Scgb1b15A0A087WP50 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Scgb1b15A0A087WP50 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Scgb1b15A0A087WP50 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Scgb1b15A0A087WP50 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Scgb1b15A0A087WP50 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Scgb1b15A0A087WP50 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Scgb1b15A0A087WP50 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Scgb1b15A0A087WP50 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,76■□□□□ 0,91
Scgb1b15A0A087WP50 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Scgb1b15A0A087WP50 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Scgb1b15A0A087WP50 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,74■□□□□ 0,91
Scgb1b15A0A087WP50 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Scgb1b15A0A087WP50 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Scgb1b15A0A087WP50 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Scgb1b15A0A087WP50 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Scgb1b15A0A087WP50 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Scgb1b15A0A087WP50 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Scgb1b15A0A087WP50 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Scgb1b15A0A087WP50 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Scgb1b15A0A087WP50 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
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