Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNZ8

Quinone oxidoreductase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UNZ8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q3UNZ8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3UNZ8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q3UNZ8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q3UNZ8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3UNZ8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UNZ8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UNZ8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q3UNZ8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UNZ8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3UNZ8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UNZ8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UNZ8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UNZ8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UNZ8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3UNZ8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UNZ8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UNZ8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UNZ8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3UNZ8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3UNZ8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UNZ8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UNZ8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3UNZ8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3UNZ8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3UNZ8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3UNZ8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3UNZ8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3UNZ8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3UNZ8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3UNZ8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UNZ8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UNZ8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UNZ8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UNZ8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UNZ8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UNZ8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UNZ8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UNZ8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UNZ8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UNZ8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3UNZ8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q3UNZ8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q3UNZ8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3UNZ8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q3UNZ8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q3UNZ8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q3UNZ8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Q3UNZ8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q3UNZ8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Q3UNZ8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3UNZ8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UNZ8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3UNZ8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3UNZ8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3UNZ8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q3UNZ8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UNZ8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3UNZ8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3UNZ8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3UNZ8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3UNZ8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UNZ8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3UNZ8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3UNZ8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3UNZ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3UNZ8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3UNZ8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UNZ8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UNZ8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UNZ8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UNZ8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3UNZ8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3UNZ8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3UNZ8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3UNZ8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3UNZ8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3UNZ8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UNZ8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3UNZ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3UNZ8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q3UNZ8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UNZ8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UNZ8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3UNZ8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3UNZ8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3UNZ8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3UNZ8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3UNZ8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3UNZ8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3UNZ8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3UNZ8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3UNZ8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3UNZ8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3UNZ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q3UNZ8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q3UNZ8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q3UNZ8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q3UNZ8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q3UNZ8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms