Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1J8

Tcrg-V4, T cell receptor gamma, variable 4 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,03■■□□□ 1,44
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1,43
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,56■■□□□ 1,2
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22,49■■□□□ 1,19
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,32■■□□□ 1,16
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,27■■□□□ 1,16
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,53■■□□□ 1,04
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,51■■□□□ 1,03
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,36■■□□□ 1,01
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,35■■□□□ 1,01
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,24■□□□□ 0,99
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0,95
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20,65■□□□□ 0,9
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20,64■□□□□ 0,89
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,56■□□□□ 0,88
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20,48■□□□□ 0,87
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
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