Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Hist2h2beQ64524 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Hist2h2beQ64524 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Hist2h2beQ64524 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Hist2h2beQ64524 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,27■■□□□ 1,48
Hist2h2beQ64524 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Hist2h2beQ64524 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Hist2h2beQ64524 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Hist2h2beQ64524 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Hist2h2beQ64524 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Hist2h2beQ64524 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Hist2h2beQ64524 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Hist2h2beQ64524 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Hist2h2beQ64524 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Hist2h2beQ64524 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Hist2h2beQ64524 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Hist2h2beQ64524 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,65■■□□□ 1,22
Hist2h2beQ64524 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Hist2h2beQ64524 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Hist2h2beQ64524 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Hist2h2beQ64524 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Hist2h2beQ64524 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Hist2h2beQ64524 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Hist2h2beQ64524 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,34■■□□□ 1,17
Hist2h2beQ64524 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Hist2h2beQ64524 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Hist2h2beQ64524 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,15
Hist2h2beQ64524 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Hist2h2beQ64524 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Hist2h2beQ64524 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Hist2h2beQ64524 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Hist2h2beQ64524 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Hist2h2beQ64524 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Hist2h2beQ64524 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Hist2h2beQ64524 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Hist2h2beQ64524 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Hist2h2beQ64524 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Hist2h2beQ64524 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Hist2h2beQ64524 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Hist2h2beQ64524 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Hist2h2beQ64524 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Hist2h2beQ64524 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Hist2h2beQ64524 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Hist2h2beQ64524 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Hist2h2beQ64524 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Hist2h2beQ64524 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Hist2h2beQ64524 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,43■■□□□ 1,02
Hist2h2beQ64524 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Hist2h2beQ64524 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Hist2h2beQ64524 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Hist2h2beQ64524 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Hist2h2beQ64524 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Hist2h2beQ64524 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Hist2h2beQ64524 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Hist2h2beQ64524 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Hist2h2beQ64524 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21,17■□□□□ 0,98
Hist2h2beQ64524 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,14■□□□□ 0,98
Hist2h2beQ64524 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Hist2h2beQ64524 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Hist2h2beQ64524 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Hist2h2beQ64524 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Hist2h2beQ64524 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Hist2h2beQ64524 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Hist2h2beQ64524 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Hist2h2beQ64524 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Hist2h2beQ64524 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Hist2h2beQ64524 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Hist2h2beQ64524 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Hist2h2beQ64524 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20,92■□□□□ 0,94
Hist2h2beQ64524 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Hist2h2beQ64524 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Hist2h2beQ64524 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Hist2h2beQ64524 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Hist2h2beQ64524 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Hist2h2beQ64524 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Hist2h2beQ64524 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20,76■□□□□ 0,91
Hist2h2beQ64524 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Hist2h2beQ64524 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Hist2h2beQ64524 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Hist2h2beQ64524 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Hist2h2beQ64524 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,69■□□□□ 0,9
Hist2h2beQ64524 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Hist2h2beQ64524 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Hist2h2beQ64524 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Hist2h2beQ64524 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Hist2h2beQ64524 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Hist2h2beQ64524 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Hist2h2beQ64524 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Hist2h2beQ64524 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Hist2h2beQ64524 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Hist2h2beQ64524 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Hist2h2beQ64524 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Hist2h2beQ64524 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Hist2h2beQ64524 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Hist2h2beQ64524 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Hist2h2beQ64524 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Hist2h2beQ64524 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Hist2h2beQ64524 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Hist2h2beQ64524 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Hist2h2beQ64524 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,33■□□□□ 0,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms