Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hist2h2beQ64524 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hist2h2beQ64524 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hist2h2beQ64524 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hist2h2beQ64524 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hist2h2beQ64524 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hist2h2beQ64524 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hist2h2beQ64524 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hist2h2beQ64524 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hist2h2beQ64524 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hist2h2beQ64524 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hist2h2beQ64524 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hist2h2beQ64524 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hist2h2beQ64524 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hist2h2beQ64524 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hist2h2beQ64524 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hist2h2beQ64524 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist2h2beQ64524 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist2h2beQ64524 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hist2h2beQ64524 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hist2h2beQ64524 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hist2h2beQ64524 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hist2h2beQ64524 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hist2h2beQ64524 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hist2h2beQ64524 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hist2h2beQ64524 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hist2h2beQ64524 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hist2h2beQ64524 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hist2h2beQ64524 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hist2h2beQ64524 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hist2h2beQ64524 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hist2h2beQ64524 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hist2h2beQ64524 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hist2h2beQ64524 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hist2h2beQ64524 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hist2h2beQ64524 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist2h2beQ64524 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist2h2beQ64524 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hist2h2beQ64524 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hist2h2beQ64524 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hist2h2beQ64524 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hist2h2beQ64524 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hist2h2beQ64524 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hist2h2beQ64524 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hist2h2beQ64524 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hist2h2beQ64524 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hist2h2beQ64524 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hist2h2beQ64524 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hist2h2beQ64524 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hist2h2beQ64524 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hist2h2beQ64524 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hist2h2beQ64524 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hist2h2beQ64524 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hist2h2beQ64524 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hist2h2beQ64524 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hist2h2beQ64524 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hist2h2beQ64524 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hist2h2beQ64524 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hist2h2beQ64524 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hist2h2beQ64524 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hist2h2beQ64524 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hist2h2beQ64524 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hist2h2beQ64524 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hist2h2beQ64524 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hist2h2beQ64524 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hist2h2beQ64524 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hist2h2beQ64524 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hist2h2beQ64524 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hist2h2beQ64524 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hist2h2beQ64524 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hist2h2beQ64524 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hist2h2beQ64524 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hist2h2beQ64524 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hist2h2beQ64524 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hist2h2beQ64524 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hist2h2beQ64524 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hist2h2beQ64524 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hist2h2beQ64524 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hist2h2beQ64524 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hist2h2beQ64524 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hist2h2beQ64524 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Hist2h2beQ64524 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hist2h2beQ64524 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hist2h2beQ64524 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hist2h2beQ64524 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hist2h2beQ64524 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hist2h2beQ64524 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hist2h2beQ64524 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hist2h2beQ64524 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hist2h2beQ64524 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hist2h2beQ64524 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hist2h2beQ64524 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hist2h2beQ64524 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hist2h2beQ64524 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hist2h2beQ64524 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hist2h2beQ64524 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hist2h2beQ64524 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hist2h2beQ64524 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hist2h2beQ64524 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hist2h2beQ64524 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms