Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcp4l1Q6W8Q3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcp4l1Q6W8Q3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcp4l1Q6W8Q3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcp4l1Q6W8Q3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcp4l1Q6W8Q3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcp4l1Q6W8Q3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcp4l1Q6W8Q3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcp4l1Q6W8Q3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcp4l1Q6W8Q3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcp4l1Q6W8Q3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcp4l1Q6W8Q3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcp4l1Q6W8Q3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcp4l1Q6W8Q3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcp4l1Q6W8Q3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcp4l1Q6W8Q3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcp4l1Q6W8Q3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms