Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBJ6

Josd1, Josephin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Josd1Q9DBJ6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Josd1Q9DBJ6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Josd1Q9DBJ6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Josd1Q9DBJ6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Josd1Q9DBJ6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Josd1Q9DBJ6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Josd1Q9DBJ6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Josd1Q9DBJ6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Josd1Q9DBJ6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Josd1Q9DBJ6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Josd1Q9DBJ6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Josd1Q9DBJ6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Josd1Q9DBJ6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Josd1Q9DBJ6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Josd1Q9DBJ6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Josd1Q9DBJ6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Josd1Q9DBJ6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Josd1Q9DBJ6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Josd1Q9DBJ6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Josd1Q9DBJ6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Josd1Q9DBJ6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Josd1Q9DBJ6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Josd1Q9DBJ6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Josd1Q9DBJ6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Josd1Q9DBJ6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Josd1Q9DBJ6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Josd1Q9DBJ6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Josd1Q9DBJ6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Josd1Q9DBJ6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Josd1Q9DBJ6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Josd1Q9DBJ6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Josd1Q9DBJ6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Josd1Q9DBJ6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Josd1Q9DBJ6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Josd1Q9DBJ6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Josd1Q9DBJ6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Josd1Q9DBJ6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Josd1Q9DBJ6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Josd1Q9DBJ6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Josd1Q9DBJ6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Josd1Q9DBJ6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Josd1Q9DBJ6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Josd1Q9DBJ6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Josd1Q9DBJ6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Josd1Q9DBJ6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Josd1Q9DBJ6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Josd1Q9DBJ6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Josd1Q9DBJ6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Josd1Q9DBJ6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Josd1Q9DBJ6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Josd1Q9DBJ6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Josd1Q9DBJ6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Josd1Q9DBJ6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Josd1Q9DBJ6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Josd1Q9DBJ6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Josd1Q9DBJ6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Josd1Q9DBJ6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Josd1Q9DBJ6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Josd1Q9DBJ6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Josd1Q9DBJ6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Josd1Q9DBJ6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Josd1Q9DBJ6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Josd1Q9DBJ6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Josd1Q9DBJ6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Josd1Q9DBJ6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Josd1Q9DBJ6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Josd1Q9DBJ6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Josd1Q9DBJ6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Josd1Q9DBJ6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Josd1Q9DBJ6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Josd1Q9DBJ6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Josd1Q9DBJ6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Josd1Q9DBJ6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Josd1Q9DBJ6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Josd1Q9DBJ6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Josd1Q9DBJ6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Josd1Q9DBJ6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Josd1Q9DBJ6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Josd1Q9DBJ6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Josd1Q9DBJ6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Josd1Q9DBJ6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Josd1Q9DBJ6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Josd1Q9DBJ6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Josd1Q9DBJ6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Josd1Q9DBJ6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Josd1Q9DBJ6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Josd1Q9DBJ6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Josd1Q9DBJ6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Josd1Q9DBJ6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Josd1Q9DBJ6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Josd1Q9DBJ6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Josd1Q9DBJ6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Josd1Q9DBJ6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Josd1Q9DBJ6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Josd1Q9DBJ6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Josd1Q9DBJ6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Josd1Q9DBJ6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Josd1Q9DBJ6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Josd1Q9DBJ6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Josd1Q9DBJ6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms