Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X0

Ankrd39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39Q9D2X0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Ankrd39Q9D2X0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Ankrd39Q9D2X0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Ankrd39Q9D2X0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23,05■■□□□ 1,28
Ankrd39Q9D2X0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22,79■■□□□ 1,24
Ankrd39Q9D2X0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Ankrd39Q9D2X0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ankrd39Q9D2X0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Ankrd39Q9D2X0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Ankrd39Q9D2X0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Ankrd39Q9D2X0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Ankrd39Q9D2X0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Ankrd39Q9D2X0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Ankrd39Q9D2X0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Ankrd39Q9D2X0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Ankrd39Q9D2X0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Ankrd39Q9D2X0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Ankrd39Q9D2X0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,25■□□□□ 0,99
Ankrd39Q9D2X0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Ankrd39Q9D2X0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ankrd39Q9D2X0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Ankrd39Q9D2X0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ankrd39Q9D2X0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20,95■□□□□ 0,94
Ankrd39Q9D2X0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ankrd39Q9D2X0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Ankrd39Q9D2X0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ankrd39Q9D2X0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Ankrd39Q9D2X0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Ankrd39Q9D2X0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Ankrd39Q9D2X0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Ankrd39Q9D2X0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20,63■□□□□ 0,89
Ankrd39Q9D2X0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Ankrd39Q9D2X0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Ankrd39Q9D2X0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ankrd39Q9D2X0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ankrd39Q9D2X0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20,52■□□□□ 0,88
Ankrd39Q9D2X0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ankrd39Q9D2X0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ankrd39Q9D2X0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,49■□□□□ 0,87
Ankrd39Q9D2X0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ankrd39Q9D2X0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Ankrd39Q9D2X0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Ankrd39Q9D2X0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ankrd39Q9D2X0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20,43■□□□□ 0,86
Ankrd39Q9D2X0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Ankrd39Q9D2X0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Ankrd39Q9D2X0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Ankrd39Q9D2X0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Ankrd39Q9D2X0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Ankrd39Q9D2X0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Ankrd39Q9D2X0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Ankrd39Q9D2X0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,19■□□□□ 0,82
Ankrd39Q9D2X0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Ankrd39Q9D2X0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Ankrd39Q9D2X0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,14■□□□□ 0,81
Ankrd39Q9D2X0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Ankrd39Q9D2X0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Ankrd39Q9D2X0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Ankrd39Q9D2X0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Ankrd39Q9D2X0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Ankrd39Q9D2X0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Ankrd39Q9D2X0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Ankrd39Q9D2X0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Ankrd39Q9D2X0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
Ankrd39Q9D2X0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Ankrd39Q9D2X0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Ankrd39Q9D2X0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Ankrd39Q9D2X0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19,74■□□□□ 0,75
Ankrd39Q9D2X0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,71■□□□□ 0,75
Ankrd39Q9D2X0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Ankrd39Q9D2X0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Ankrd39Q9D2X0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Ankrd39Q9D2X0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Ankrd39Q9D2X0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,63■□□□□ 0,73
Ankrd39Q9D2X0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19,62■□□□□ 0,73
Ankrd39Q9D2X0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,62■□□□□ 0,73
Ankrd39Q9D2X0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19,61■□□□□ 0,73
Ankrd39Q9D2X0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
Ankrd39Q9D2X0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Ankrd39Q9D2X0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19,51■□□□□ 0,71
Ankrd39Q9D2X0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,5■□□□□ 0,71
Ankrd39Q9D2X0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Ankrd39Q9D2X0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
Ankrd39Q9D2X0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Ankrd39Q9D2X0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Ankrd39Q9D2X0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19,41■□□□□ 0,7
Ankrd39Q9D2X0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,41■□□□□ 0,7
Ankrd39Q9D2X0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,41■□□□□ 0,7
Ankrd39Q9D2X0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,38■□□□□ 0,69
Ankrd39Q9D2X0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,38■□□□□ 0,69
Ankrd39Q9D2X0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Ankrd39Q9D2X0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19,35■□□□□ 0,69
Ankrd39Q9D2X0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,33■□□□□ 0,68
Ankrd39Q9D2X0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19,29■□□□□ 0,68
Ankrd39Q9D2X0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19,27■□□□□ 0,68
Ankrd39Q9D2X0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,27■□□□□ 0,68
Ankrd39Q9D2X0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19,26■□□□□ 0,67
Ankrd39Q9D2X0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Ankrd39Q9D2X0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19,23■□□□□ 0,67
Ankrd39Q9D2X0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms