Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC49

Ifi27l2b, Interferon alpha-inducible protein 27-like protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi27l2bQ8VC49 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ifi27l2bQ8VC49 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Ifi27l2bQ8VC49 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Ifi27l2bQ8VC49 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Ifi27l2bQ8VC49 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Ifi27l2bQ8VC49 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,83■■□□□ 1,4
Ifi27l2bQ8VC49 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ifi27l2bQ8VC49 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Ifi27l2bQ8VC49 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ifi27l2bQ8VC49 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ifi27l2bQ8VC49 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ifi27l2bQ8VC49 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ifi27l2bQ8VC49 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ifi27l2bQ8VC49 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ifi27l2bQ8VC49 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ifi27l2bQ8VC49 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ifi27l2bQ8VC49 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ifi27l2bQ8VC49 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ifi27l2bQ8VC49 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22,62■■□□□ 1,21
Ifi27l2bQ8VC49 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Ifi27l2bQ8VC49 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Ifi27l2bQ8VC49 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,45■■□□□ 1,18
Ifi27l2bQ8VC49 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Ifi27l2bQ8VC49 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Ifi27l2bQ8VC49 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Ifi27l2bQ8VC49 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Ifi27l2bQ8VC49 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,15
Ifi27l2bQ8VC49 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ifi27l2bQ8VC49 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Ifi27l2bQ8VC49 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Ifi27l2bQ8VC49 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Ifi27l2bQ8VC49 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Ifi27l2bQ8VC49 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Ifi27l2bQ8VC49 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1,11
Ifi27l2bQ8VC49 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Ifi27l2bQ8VC49 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Ifi27l2bQ8VC49 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Ifi27l2bQ8VC49 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ifi27l2bQ8VC49 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ifi27l2bQ8VC49 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ifi27l2bQ8VC49 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Ifi27l2bQ8VC49 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Ifi27l2bQ8VC49 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Ifi27l2bQ8VC49 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Ifi27l2bQ8VC49 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Ifi27l2bQ8VC49 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Ifi27l2bQ8VC49 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Ifi27l2bQ8VC49 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,48■■□□□ 1,03
Ifi27l2bQ8VC49 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Ifi27l2bQ8VC49 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Ifi27l2bQ8VC49 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,4■■□□□ 1,02
Ifi27l2bQ8VC49 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Ifi27l2bQ8VC49 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Ifi27l2bQ8VC49 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Ifi27l2bQ8VC49 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Ifi27l2bQ8VC49 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Ifi27l2bQ8VC49 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Ifi27l2bQ8VC49 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,26■□□□□ 0,99
Ifi27l2bQ8VC49 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Ifi27l2bQ8VC49 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Ifi27l2bQ8VC49 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Ifi27l2bQ8VC49 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Ifi27l2bQ8VC49 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,19■□□□□ 0,98
Ifi27l2bQ8VC49 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Ifi27l2bQ8VC49 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ifi27l2bQ8VC49 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ifi27l2bQ8VC49 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ifi27l2bQ8VC49 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ifi27l2bQ8VC49 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ifi27l2bQ8VC49 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ifi27l2bQ8VC49 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ifi27l2bQ8VC49 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ifi27l2bQ8VC49 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ifi27l2bQ8VC49 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ifi27l2bQ8VC49 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20,94■□□□□ 0,94
Ifi27l2bQ8VC49 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ifi27l2bQ8VC49 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Ifi27l2bQ8VC49 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Ifi27l2bQ8VC49 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Ifi27l2bQ8VC49 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Ifi27l2bQ8VC49 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Ifi27l2bQ8VC49 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ifi27l2bQ8VC49 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,93
Ifi27l2bQ8VC49 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Ifi27l2bQ8VC49 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ifi27l2bQ8VC49 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ifi27l2bQ8VC49 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,91
Ifi27l2bQ8VC49 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Ifi27l2bQ8VC49 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Ifi27l2bQ8VC49 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Ifi27l2bQ8VC49 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Ifi27l2bQ8VC49 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Ifi27l2bQ8VC49 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Ifi27l2bQ8VC49 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Ifi27l2bQ8VC49 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Ifi27l2bQ8VC49 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Ifi27l2bQ8VC49 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Ifi27l2bQ8VC49 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Ifi27l2bQ8VC49 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Ifi27l2bQ8VC49 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms