Protein–RNA interactions for Protein: F6WYW0

Scgb1b19, ABPA19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb1b19F6WYW0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Scgb1b19F6WYW0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Scgb1b19F6WYW0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Scgb1b19F6WYW0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Scgb1b19F6WYW0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,72■■□□□ 1,39
Scgb1b19F6WYW0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Scgb1b19F6WYW0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Scgb1b19F6WYW0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Scgb1b19F6WYW0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Scgb1b19F6WYW0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Scgb1b19F6WYW0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Scgb1b19F6WYW0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Scgb1b19F6WYW0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Scgb1b19F6WYW0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Scgb1b19F6WYW0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Scgb1b19F6WYW0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Scgb1b19F6WYW0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Scgb1b19F6WYW0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Scgb1b19F6WYW0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Scgb1b19F6WYW0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Scgb1b19F6WYW0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Scgb1b19F6WYW0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,96■■□□□ 1,11
Scgb1b19F6WYW0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21,87■■□□□ 1,09
Scgb1b19F6WYW0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Scgb1b19F6WYW0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Scgb1b19F6WYW0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Scgb1b19F6WYW0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
Scgb1b19F6WYW0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Scgb1b19F6WYW0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Scgb1b19F6WYW0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Scgb1b19F6WYW0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Scgb1b19F6WYW0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Scgb1b19F6WYW0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Scgb1b19F6WYW0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,28■■□□□ 1
Scgb1b19F6WYW0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Scgb1b19F6WYW0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,99
Scgb1b19F6WYW0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Scgb1b19F6WYW0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Scgb1b19F6WYW0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Scgb1b19F6WYW0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Scgb1b19F6WYW0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Scgb1b19F6WYW0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Scgb1b19F6WYW0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Scgb1b19F6WYW0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Scgb1b19F6WYW0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Scgb1b19F6WYW0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Scgb1b19F6WYW0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Scgb1b19F6WYW0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Scgb1b19F6WYW0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20,81■□□□□ 0,92
Scgb1b19F6WYW0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20,78■□□□□ 0,92
Scgb1b19F6WYW0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Scgb1b19F6WYW0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Scgb1b19F6WYW0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Scgb1b19F6WYW0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Scgb1b19F6WYW0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Scgb1b19F6WYW0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Scgb1b19F6WYW0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Scgb1b19F6WYW0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Scgb1b19F6WYW0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Scgb1b19F6WYW0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Scgb1b19F6WYW0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,58■□□□□ 0,89
Scgb1b19F6WYW0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Scgb1b19F6WYW0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Scgb1b19F6WYW0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Scgb1b19F6WYW0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Scgb1b19F6WYW0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Scgb1b19F6WYW0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Scgb1b19F6WYW0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Scgb1b19F6WYW0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Scgb1b19F6WYW0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,31■□□□□ 0,84
Scgb1b19F6WYW0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Scgb1b19F6WYW0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Scgb1b19F6WYW0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Scgb1b19F6WYW0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20,24■□□□□ 0,83
Scgb1b19F6WYW0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,23■□□□□ 0,83
Scgb1b19F6WYW0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,2■□□□□ 0,82
Scgb1b19F6WYW0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Scgb1b19F6WYW0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Scgb1b19F6WYW0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Scgb1b19F6WYW0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Scgb1b19F6WYW0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,06■□□□□ 0,8
Scgb1b19F6WYW0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Scgb1b19F6WYW0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Scgb1b19F6WYW0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Scgb1b19F6WYW0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Scgb1b19F6WYW0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Scgb1b19F6WYW0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Scgb1b19F6WYW0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Scgb1b19F6WYW0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Scgb1b19F6WYW0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,03■□□□□ 0,8
Scgb1b19F6WYW0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Scgb1b19F6WYW0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Scgb1b19F6WYW0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Scgb1b19F6WYW0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Scgb1b19F6WYW0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Scgb1b19F6WYW0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,99■□□□□ 0,79
Scgb1b19F6WYW0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Scgb1b19F6WYW0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Scgb1b19F6WYW0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Scgb1b19F6WYW0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19,93■□□□□ 0,78
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