Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B649

Trav13-2, T cell receptor alpha variable 13-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav13-2A0A075B649 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Trav13-2A0A075B649 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22,63■■□□□ 1,21
Trav13-2A0A075B649 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Trav13-2A0A075B649 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Trav13-2A0A075B649 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21,27■■□□□ 1
Trav13-2A0A075B649 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Trav13-2A0A075B649 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Trav13-2A0A075B649 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Trav13-2A0A075B649 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Trav13-2A0A075B649 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Trav13-2A0A075B649 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Trav13-2A0A075B649 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Trav13-2A0A075B649 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20,36■□□□□ 0,85
Trav13-2A0A075B649 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Trav13-2A0A075B649 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Trav13-2A0A075B649 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Trav13-2A0A075B649 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20,22■□□□□ 0,83
Trav13-2A0A075B649 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Trav13-2A0A075B649 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Trav13-2A0A075B649 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19,98■□□□□ 0,79
Trav13-2A0A075B649 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Trav13-2A0A075B649 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Trav13-2A0A075B649 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Trav13-2A0A075B649 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19,7■□□□□ 0,74
Trav13-2A0A075B649 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Trav13-2A0A075B649 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Trav13-2A0A075B649 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,73
Trav13-2A0A075B649 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Trav13-2A0A075B649 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19,63■□□□□ 0,73
Trav13-2A0A075B649 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Trav13-2A0A075B649 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Trav13-2A0A075B649 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Trav13-2A0A075B649 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
Trav13-2A0A075B649 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19,54■□□□□ 0,72
Trav13-2A0A075B649 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19,49■□□□□ 0,71
Trav13-2A0A075B649 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Trav13-2A0A075B649 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19,43■□□□□ 0,7
Trav13-2A0A075B649 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,41■□□□□ 0,7
Trav13-2A0A075B649 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,38■□□□□ 0,69
Trav13-2A0A075B649 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,32■□□□□ 0,68
Trav13-2A0A075B649 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19,31■□□□□ 0,68
Trav13-2A0A075B649 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19,26■□□□□ 0,67
Trav13-2A0A075B649 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
Trav13-2A0A075B649 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19,23■□□□□ 0,67
Trav13-2A0A075B649 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
Trav13-2A0A075B649 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,18■□□□□ 0,66
Trav13-2A0A075B649 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19,13■□□□□ 0,65
Trav13-2A0A075B649 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,64
Trav13-2A0A075B649 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Trav13-2A0A075B649 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Trav13-2A0A075B649 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18,99■□□□□ 0,63
Trav13-2A0A075B649 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18,95■□□□□ 0,62
Trav13-2A0A075B649 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Trav13-2A0A075B649 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Trav13-2A0A075B649 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Trav13-2A0A075B649 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Trav13-2A0A075B649 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Trav13-2A0A075B649 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Trav13-2A0A075B649 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Trav13-2A0A075B649 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,81■□□□□ 0,6
Trav13-2A0A075B649 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Trav13-2A0A075B649 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Trav13-2A0A075B649 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18,77■□□□□ 0,6
Trav13-2A0A075B649 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Trav13-2A0A075B649 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
Trav13-2A0A075B649 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18,73■□□□□ 0,59
Trav13-2A0A075B649 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Trav13-2A0A075B649 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,69■□□□□ 0,58
Trav13-2A0A075B649 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,68■□□□□ 0,58
Trav13-2A0A075B649 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18,66■□□□□ 0,58
Trav13-2A0A075B649 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
Trav13-2A0A075B649 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
Trav13-2A0A075B649 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,62■□□□□ 0,57
Trav13-2A0A075B649 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,58■□□□□ 0,57
Trav13-2A0A075B649 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,56■□□□□ 0,56
Trav13-2A0A075B649 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,56■□□□□ 0,56
Trav13-2A0A075B649 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,56■□□□□ 0,56
Trav13-2A0A075B649 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,52■□□□□ 0,56
Trav13-2A0A075B649 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,52■□□□□ 0,55
Trav13-2A0A075B649 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,49■□□□□ 0,55
Trav13-2A0A075B649 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,47■□□□□ 0,55
Trav13-2A0A075B649 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18,42■□□□□ 0,54
Trav13-2A0A075B649 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
Trav13-2A0A075B649 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,41■□□□□ 0,54
Trav13-2A0A075B649 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
Trav13-2A0A075B649 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,34■□□□□ 0,53
Trav13-2A0A075B649 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,52
Trav13-2A0A075B649 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
Trav13-2A0A075B649 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,25■□□□□ 0,51
Trav13-2A0A075B649 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Trav13-2A0A075B649 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Trav13-2A0A075B649 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Trav13-2A0A075B649 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Trav13-2A0A075B649 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Trav13-2A0A075B649 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Trav13-2A0A075B649 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18,14■□□□□ 0,49
Trav13-2A0A075B649 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18,11■□□□□ 0,49
Trav13-2A0A075B649 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Trav13-2A0A075B649 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Trav13-2A0A075B649 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18,06■□□□□ 0,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms