Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB60

Fam213b, Prostamide/prostaglandin F synthase, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam213bQ9DB60 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Fam213bQ9DB60 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Fam213bQ9DB60 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Fam213bQ9DB60 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Fam213bQ9DB60 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Fam213bQ9DB60 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,93■■□□□ 1,42
Fam213bQ9DB60 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Fam213bQ9DB60 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Fam213bQ9DB60 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Fam213bQ9DB60 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Fam213bQ9DB60 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Fam213bQ9DB60 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Fam213bQ9DB60 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,59■■□□□ 1,21
Fam213bQ9DB60 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Fam213bQ9DB60 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Fam213bQ9DB60 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Fam213bQ9DB60 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Fam213bQ9DB60 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Fam213bQ9DB60 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22,18■■□□□ 1,14
Fam213bQ9DB60 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,16■■□□□ 1,14
Fam213bQ9DB60 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
Fam213bQ9DB60 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Fam213bQ9DB60 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Fam213bQ9DB60 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Fam213bQ9DB60 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,92■■□□□ 1,1
Fam213bQ9DB60 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Fam213bQ9DB60 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Fam213bQ9DB60 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Fam213bQ9DB60 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Fam213bQ9DB60 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Fam213bQ9DB60 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Fam213bQ9DB60 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Fam213bQ9DB60 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Fam213bQ9DB60 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Fam213bQ9DB60 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Fam213bQ9DB60 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,44■■□□□ 1,02
Fam213bQ9DB60 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Fam213bQ9DB60 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
Fam213bQ9DB60 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Fam213bQ9DB60 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21,27■■□□□ 1
Fam213bQ9DB60 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,12■□□□□ 0,97
Fam213bQ9DB60 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Fam213bQ9DB60 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Fam213bQ9DB60 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Fam213bQ9DB60 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Fam213bQ9DB60 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Fam213bQ9DB60 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Fam213bQ9DB60 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Fam213bQ9DB60 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Fam213bQ9DB60 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Fam213bQ9DB60 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Fam213bQ9DB60 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Fam213bQ9DB60 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Fam213bQ9DB60 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Fam213bQ9DB60 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Fam213bQ9DB60 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Fam213bQ9DB60 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Fam213bQ9DB60 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Fam213bQ9DB60 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Fam213bQ9DB60 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Fam213bQ9DB60 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Fam213bQ9DB60 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Fam213bQ9DB60 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Fam213bQ9DB60 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Fam213bQ9DB60 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Fam213bQ9DB60 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Fam213bQ9DB60 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20,58■□□□□ 0,88
Fam213bQ9DB60 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Fam213bQ9DB60 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Fam213bQ9DB60 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Fam213bQ9DB60 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Fam213bQ9DB60 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Fam213bQ9DB60 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Fam213bQ9DB60 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Fam213bQ9DB60 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Fam213bQ9DB60 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20,41■□□□□ 0,86
Fam213bQ9DB60 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Fam213bQ9DB60 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Fam213bQ9DB60 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Fam213bQ9DB60 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Fam213bQ9DB60 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20,34■□□□□ 0,85
Fam213bQ9DB60 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Fam213bQ9DB60 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Fam213bQ9DB60 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Fam213bQ9DB60 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Fam213bQ9DB60 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Fam213bQ9DB60 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,21■□□□□ 0,83
Fam213bQ9DB60 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Fam213bQ9DB60 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Fam213bQ9DB60 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Fam213bQ9DB60 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,17■□□□□ 0,82
Fam213bQ9DB60 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,15■□□□□ 0,82
Fam213bQ9DB60 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,15■□□□□ 0,82
Fam213bQ9DB60 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,82
Fam213bQ9DB60 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Fam213bQ9DB60 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,13■□□□□ 0,81
Fam213bQ9DB60 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Fam213bQ9DB60 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,1■□□□□ 0,81
Fam213bQ9DB60 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Fam213bQ9DB60 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms