Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Defa20Q45VN2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Defa20Q45VN2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa20Q45VN2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa20Q45VN2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa20Q45VN2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa20Q45VN2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Defa20Q45VN2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Defa20Q45VN2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Defa20Q45VN2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Defa20Q45VN2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Defa20Q45VN2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Defa20Q45VN2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Defa20Q45VN2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa20Q45VN2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Defa20Q45VN2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa20Q45VN2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa20Q45VN2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa20Q45VN2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Defa20Q45VN2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa20Q45VN2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Defa20Q45VN2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa20Q45VN2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Defa20Q45VN2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Defa20Q45VN2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Defa20Q45VN2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Defa20Q45VN2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Defa20Q45VN2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Defa20Q45VN2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Defa20Q45VN2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Defa20Q45VN2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Defa20Q45VN2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Defa20Q45VN2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Defa20Q45VN2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Defa20Q45VN2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Defa20Q45VN2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Defa20Q45VN2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Defa20Q45VN2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Defa20Q45VN2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Defa20Q45VN2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Defa20Q45VN2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Defa20Q45VN2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Defa20Q45VN2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Defa20Q45VN2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Defa20Q45VN2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Defa20Q45VN2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Defa20Q45VN2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa20Q45VN2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa20Q45VN2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa20Q45VN2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa20Q45VN2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa20Q45VN2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa20Q45VN2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa20Q45VN2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa20Q45VN2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Defa20Q45VN2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa20Q45VN2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa20Q45VN2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa20Q45VN2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Defa20Q45VN2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa20Q45VN2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa20Q45VN2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa20Q45VN2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa20Q45VN2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa20Q45VN2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Defa20Q45VN2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa20Q45VN2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa20Q45VN2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa20Q45VN2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa20Q45VN2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa20Q45VN2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa20Q45VN2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa20Q45VN2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa20Q45VN2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa20Q45VN2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa20Q45VN2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa20Q45VN2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa20Q45VN2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa20Q45VN2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa20Q45VN2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa20Q45VN2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Defa20Q45VN2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa20Q45VN2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa20Q45VN2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa20Q45VN2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa20Q45VN2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa20Q45VN2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa20Q45VN2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa20Q45VN2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa20Q45VN2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa20Q45VN2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa20Q45VN2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa20Q45VN2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa20Q45VN2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa20Q45VN2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa20Q45VN2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa20Q45VN2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa20Q45VN2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa20Q45VN2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa20Q45VN2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms