RNA–Protein interactions for RNA: YOL027C

MDM38, Transcript of Mitochondrial protein, yeast

Gene MDM38, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM38	YOL027C	CDS1	P38221	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	PPE1	P38796	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	LYS9	P38999	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	RAD26	P40352	1085 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	MNT3	P40549	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	YDL183C	P48569	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	MEP3	P53390	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	RRN3	P36070	627 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	SMK1	P41808	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	BNA1	P47096	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	SPT20	P50875	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	TFC6	Q06339	672 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	THI22	Q06490	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	PEX1	P24004	1043 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	CHS3	P29465	1165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
MDM38	YOL027C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	BAP3	P41815	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	TAH11	P47112	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	MTL1	P53214	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	AAD4	Q07747	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	HOS1	Q12214	470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	LAS17	Q12446	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	POL3	P15436	1097 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	RER1	P25560	188 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	FKH2	P41813	862 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	ECL1	P48235	211 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	INP52	P50942	1183 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	ENT2	Q05785	613 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	ENB1	Q08299	606 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	YBR138C	P38277	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	FTR1	P40088	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	GSM1	P42950	618 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	CRD1	Q07560	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	SOD2	P00447	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	NUC1	P08466	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	CLB4	P24871	460 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	IMP2'	P32351	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	LST4	P34239	828 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	HOS4	P40480	1083 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	MDR1	P53258	950 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	TUP1	P16649	713 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	FMO1	P38866	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	YIR042C	P40586	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	IMA1	P53051	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	ACS1	Q01574	713 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	FDC1	Q03034	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	VID22	Q05934	901 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	RGA2	Q06407	1009 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	SEC15	P22224	910 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	RIT1	P23796	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	SLC1	P33333	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	SEG2	P34250	1132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	OMA1	P36163	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	IFA38	P38286	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	COS111	P38308	924 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	NUP60	P39705	539 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	PSF2	P40359	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	TMA108	P40462	946 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	CTF18	P49956	741 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	AMA1	P50082	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	AIM41	Q12032	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	RTP1	Q12751	981 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	YBR053C	P38235	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	EHT1	P38295	451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	NPR3	P38742	1146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	SFB3	P38810	929 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM38	YOL027C	AXL2	P38928	823 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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