Protein–RNA interactions for Protein: P41808

SMK1, Sporulation-specific mitogen-activated protein kinase SMK1, yeastyeast

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMK1P41808 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.79■□□□□ 0.6
SMK1P41808 NSR1YGR159C 1245 nt18.74■□□□□ 0.59
SMK1P41808 NOP1YDL014W 984 nt18.24■□□□□ 0.51
SMK1P41808 YKL036CYKL036C 393 nt16.74■□□□□ 0.27
SMK1P41808 MDJ1YFL016C 1536 nt16.71■□□□□ 0.27
SMK1P41808 SRX1YKL086W 384 nt15.93■□□□□ 0.14
SMK1P41808 Q0297Q0297 156 nt15.92■□□□□ 0.14
SMK1P41808 YJL027CYJL027C 417 nt15.62■□□□□ 0.09
SMK1P41808 SCS3YGL126W 1143 nt15.19■□□□□ 0.02
SMK1P41808 YCR051WYCR051W 669 nt15.12■□□□□ 0.01
SMK1P41808 DBP2YNL112W 1641 nt14.74□□□□□ -0.05
SMK1P41808 YOL085CYOL085C 342 nt14.5□□□□□ -0.09
SMK1P41808 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.44□□□□□ -0.1
SMK1P41808 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.44□□□□□ -0.1
SMK1P41808 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.44□□□□□ -0.1
SMK1P41808 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.44□□□□□ -0.1
SMK1P41808 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.44□□□□□ -0.1
SMK1P41808 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.44□□□□□ -0.1
SMK1P41808 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.44□□□□□ -0.1
SMK1P41808 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.44□□□□□ -0.1
SMK1P41808 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.44□□□□□ -0.1
SMK1P41808 CCC1YLR220W 969 nt14.32□□□□□ -0.12
SMK1P41808 PKP1YIL042C 1185 nt14.3□□□□□ -0.12
SMK1P41808 RPP1BYDL130W 321 nt14.29□□□□□ -0.12
SMK1P41808 YBR190WYBR190W 312 nt14.27□□□□□ -0.13
SMK1P41808 RTC3YHR087W 336 nt13.97□□□□□ -0.17
SMK1P41808 RVS167YDR388W 1449 nt13.87□□□□□ -0.19
SMK1P41808 SCJ1YMR214W 1134 nt13.75□□□□□ -0.21
SMK1P41808 PET122YER153C 765 nt13.66□□□□□ -0.22
SMK1P41808 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.64□□□□□ -0.23
SMK1P41808 ATS1YAL020C 1002 nt13.56□□□□□ -0.24
SMK1P41808 SCR1SCR1 522 nt13.51□□□□□ -0.25
SMK1P41808 Q0182Q0182 405 nt13.35□□□□□ -0.27
SMK1P41808 SHR5YOL110W 714 nt13.35□□□□□ -0.27
SMK1P41808 RRN5YLR141W 1092 nt13.26□□□□□ -0.29
SMK1P41808 YDJ1YNL064C 1230 nt13.2□□□□□ -0.3
SMK1P41808 URN1YPR152C 1398 nt13.04□□□□□ -0.32
SMK1P41808 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.01□□□□□ -0.33
SMK1P41808 DEP1YAL013W 1218 nt13.01□□□□□ -0.33
SMK1P41808 PUT4YOR348C 1884 nt13.01□□□□□ -0.33
SMK1P41808 RSB1YOR049C 1065 nt12.97□□□□□ -0.33
SMK1P41808 GAR1YHR089C 618 nt12.92□□□□□ -0.34
SMK1P41808 OPI9YLR338W 858 nt12.86□□□□□ -0.35
SMK1P41808 RPN10YHR200W 807 nt12.84□□□□□ -0.35
SMK1P41808 YNL208WYNL208W 600 nt12.8□□□□□ -0.36
SMK1P41808 SAH1YER043C 1350 nt12.8□□□□□ -0.36
SMK1P41808 ARE1YCR048W 1833 nt12.75□□□□□ -0.37
SMK1P41808 MOT3YMR070W 1473 nt12.72□□□□□ -0.37
SMK1P41808 POA1YBR022W 534 nt12.61□□□□□ -0.39
SMK1P41808 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.6□□□□□ -0.39
SMK1P41808 PST2YDR032C 597 nt12.57□□□□□ -0.4
SMK1P41808 SSA3YBL075C 1950 nt12.51□□□□□ -0.41
SMK1P41808 TIR1YER011W 765 nt12.49□□□□□ -0.41
SMK1P41808 PUN1YLR414C 792 nt12.49□□□□□ -0.41
SMK1P41808 YJR018WYJR018W 363 nt12.43□□□□□ -0.42
SMK1P41808 SSA1YAL005C 1929 nt12.35□□□□□ -0.43
SMK1P41808 PTC2YER089C 1395 nt12.35□□□□□ -0.43
SMK1P41808 BSC6YOL137W 1494 nt12.34□□□□□ -0.43
SMK1P41808 BUD23YCR047C 828 nt12.32□□□□□ -0.44
SMK1P41808 YJR120WYJR120W 351 nt12.2□□□□□ -0.46
SMK1P41808 NAB2YGL122C 1578 nt12.2□□□□□ -0.46
SMK1P41808 RPP2BYDR382W 333 nt12.17□□□□□ -0.46
SMK1P41808 SRB2YHR041C 633 nt12.12□□□□□ -0.47
SMK1P41808 SHU1YHL006C 453 nt12.08□□□□□ -0.48
SMK1P41808 YKL097CYKL097C 411 nt12.04□□□□□ -0.48
SMK1P41808 DAL1YIR027C 1383 nt12.03□□□□□ -0.48
SMK1P41808 FIS1YIL065C 468 nt12.01□□□□□ -0.49
SMK1P41808 FPR4YLR449W 1179 nt12.01□□□□□ -0.49
SMK1P41808 INM2YDR287W 879 nt12□□□□□ -0.49
SMK1P41808 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.93□□□□□ -0.5
SMK1P41808 WWM1YFL010C 636 nt11.92□□□□□ -0.5
SMK1P41808 PHO4YFR034C 939 nt11.91□□□□□ -0.5
SMK1P41808 BDH2YAL061W 1254 nt11.9□□□□□ -0.5
SMK1P41808 YBL100CYBL100C 315 nt11.87□□□□□ -0.51
SMK1P41808 YGR021WYGR021W 873 nt11.83□□□□□ -0.52
SMK1P41808 SPT5YML010W 3192 nt11.79□□□□□ -0.52
SMK1P41808 HOM6YJR139C 1080 nt11.78□□□□□ -0.52
SMK1P41808 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.74□□□□□ -0.53
SMK1P41808 FUN26YAL022C 1554 nt11.73□□□□□ -0.53
SMK1P41808 LSM3YLR438C-A 270 nt11.73□□□□□ -0.53
SMK1P41808 MNP1YGL068W 585 nt11.72□□□□□ -0.53
SMK1P41808 YPS1YLR120C 1710 nt11.71□□□□□ -0.54
SMK1P41808 TRM9YML014W 840 nt11.7□□□□□ -0.54
SMK1P41808 YDR095CYDR095C 411 nt11.62□□□□□ -0.55
SMK1P41808 RKM5YLR137W 1104 nt11.61□□□□□ -0.55
SMK1P41808 MEP2YNL142W 1500 nt11.6□□□□□ -0.55
SMK1P41808 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.59□□□□□ -0.55
SMK1P41808 ALF1YNL148C 765 nt11.59□□□□□ -0.55
SMK1P41808 CCT6YDR188W 1641 nt11.57□□□□□ -0.56
SMK1P41808 YOR139CYOR139C 393 nt11.56□□□□□ -0.56
SMK1P41808 NPL3YDR432W 1245 nt11.5□□□□□ -0.57
SMK1P41808 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.49□□□□□ -0.57
SMK1P41808 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.49□□□□□ -0.57
SMK1P41808 YOL037CYOL037C 354 nt11.49□□□□□ -0.57
SMK1P41808 DCW1YKL046C 1350 nt11.41□□□□□ -0.58
SMK1P41808 RPP2AYOL039W 321 nt11.41□□□□□ -0.58
SMK1P41808 SIS1YNL007C 1059 nt11.4□□□□□ -0.58
SMK1P41808 SSA4YER103W 1929 nt11.4□□□□□ -0.58
SMK1P41808 PTP1YDL230W 1008 nt11.35□□□□□ -0.59
SMK1P41808 CAC2YML102W 1407 nt11.27□□□□□ -0.6
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