Protein–RNA interactions for Protein: Q12446

LAS17, Proline-rich protein LAS17, yeastyeast

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LAS17Q12446 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.09■□□□□ 0.17
LAS17Q12446 NSR1YGR159C 1245 nt15.8■□□□□ 0.12
LAS17Q12446 NOP1YDL014W 984 nt15.62■□□□□ 0.09
LAS17Q12446 YKL036CYKL036C 393 nt14.56□□□□□ -0.08
LAS17Q12446 MDJ1YFL016C 1536 nt14.5□□□□□ -0.09
LAS17Q12446 Q0297Q0297 156 nt13.72□□□□□ -0.21
LAS17Q12446 SRX1YKL086W 384 nt13.66□□□□□ -0.22
LAS17Q12446 YJL027CYJL027C 417 nt13.64□□□□□ -0.23
LAS17Q12446 SCS3YGL126W 1143 nt13.35□□□□□ -0.27
LAS17Q12446 YCR051WYCR051W 669 nt13.03□□□□□ -0.32
LAS17Q12446 SSA3YBL075C 1950 nt12.86□□□□□ -0.35
LAS17Q12446 YOL085CYOL085C 342 nt12.63□□□□□ -0.39
LAS17Q12446 DBP2YNL112W 1641 nt12.59□□□□□ -0.39
LAS17Q12446 YBR190WYBR190W 312 nt12.54□□□□□ -0.4
LAS17Q12446 PKP1YIL042C 1185 nt12.49□□□□□ -0.41
LAS17Q12446 RPP1BYDL130W 321 nt12.33□□□□□ -0.44
LAS17Q12446 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.28□□□□□ -0.44
LAS17Q12446 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.28□□□□□ -0.44
LAS17Q12446 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.28□□□□□ -0.44
LAS17Q12446 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.28□□□□□ -0.44
LAS17Q12446 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.28□□□□□ -0.44
LAS17Q12446 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.28□□□□□ -0.44
LAS17Q12446 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.28□□□□□ -0.44
LAS17Q12446 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.28□□□□□ -0.44
LAS17Q12446 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.28□□□□□ -0.44
LAS17Q12446 CCC1YLR220W 969 nt12.24□□□□□ -0.45
LAS17Q12446 RTC3YHR087W 336 nt12.18□□□□□ -0.46
LAS17Q12446 ATS1YAL020C 1002 nt11.97□□□□□ -0.49
LAS17Q12446 PUT4YOR348C 1884 nt11.95□□□□□ -0.5
LAS17Q12446 SCJ1YMR214W 1134 nt11.9□□□□□ -0.5
LAS17Q12446 PET122YER153C 765 nt11.81□□□□□ -0.52
LAS17Q12446 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.69□□□□□ -0.54
LAS17Q12446 SCR1SCR1 522 nt11.66□□□□□ -0.54
LAS17Q12446 RVS167YDR388W 1449 nt11.64□□□□□ -0.55
LAS17Q12446 ARE1YCR048W 1833 nt11.51□□□□□ -0.57
LAS17Q12446 RRN5YLR141W 1092 nt11.49□□□□□ -0.57
LAS17Q12446 POA1YBR022W 534 nt11.48□□□□□ -0.57
LAS17Q12446 Q0182Q0182 405 nt11.46□□□□□ -0.57
LAS17Q12446 SPT5YML010W 3192 nt11.45□□□□□ -0.58
LAS17Q12446 MOT3YMR070W 1473 nt11.37□□□□□ -0.59
LAS17Q12446 BSC6YOL137W 1494 nt11.37□□□□□ -0.59
LAS17Q12446 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.33□□□□□ -0.6
LAS17Q12446 SSA4YER103W 1929 nt11.33□□□□□ -0.6
LAS17Q12446 SHR5YOL110W 714 nt11.28□□□□□ -0.6
LAS17Q12446 RSB1YOR049C 1065 nt11.28□□□□□ -0.6
LAS17Q12446 SAH1YER043C 1350 nt11.28□□□□□ -0.6
LAS17Q12446 YDJ1YNL064C 1230 nt11.26□□□□□ -0.61
LAS17Q12446 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.25□□□□□ -0.61
LAS17Q12446 URN1YPR152C 1398 nt11.18□□□□□ -0.62
LAS17Q12446 OPI9YLR338W 858 nt11.17□□□□□ -0.62
LAS17Q12446 PST2YDR032C 597 nt11.06□□□□□ -0.64
LAS17Q12446 GAR1YHR089C 618 nt11.06□□□□□ -0.64
LAS17Q12446 DEP1YAL013W 1218 nt11.01□□□□□ -0.65
LAS17Q12446 BDF1YLR399C 2061 nt11□□□□□ -0.65
LAS17Q12446 BUD23YCR047C 828 nt10.99□□□□□ -0.65
LAS17Q12446 TAT1YBR069C 1860 nt10.83□□□□□ -0.68
LAS17Q12446 RPN10YHR200W 807 nt10.82□□□□□ -0.68
LAS17Q12446 PTC2YER089C 1395 nt10.81□□□□□ -0.68
LAS17Q12446 PUN1YLR414C 792 nt10.81□□□□□ -0.68
LAS17Q12446 NAB2YGL122C 1578 nt10.77□□□□□ -0.69
LAS17Q12446 MEP2YNL142W 1500 nt10.76□□□□□ -0.69
LAS17Q12446 YNL208WYNL208W 600 nt10.76□□□□□ -0.69
LAS17Q12446 YKL097CYKL097C 411 nt10.69□□□□□ -0.7
LAS17Q12446 TIR1YER011W 765 nt10.66□□□□□ -0.7
LAS17Q12446 PAC11YDR488C 1602 nt10.66□□□□□ -0.7
LAS17Q12446 YJR018WYJR018W 363 nt10.62□□□□□ -0.71
LAS17Q12446 SHU1YHL006C 453 nt10.61□□□□□ -0.71
LAS17Q12446 DCW1YKL046C 1350 nt10.58□□□□□ -0.72
LAS17Q12446 FIS1YIL065C 468 nt10.58□□□□□ -0.72
LAS17Q12446 SSA1YAL005C 1929 nt10.52□□□□□ -0.72
LAS17Q12446 DAL1YIR027C 1383 nt10.5□□□□□ -0.73
LAS17Q12446 YBR220CYBR220C 1683 nt10.47□□□□□ -0.73
LAS17Q12446 NVJ2YPR091C 2313 nt10.46□□□□□ -0.73
LAS17Q12446 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.46□□□□□ -0.73
LAS17Q12446 YPS1YLR120C 1710 nt10.46□□□□□ -0.74
LAS17Q12446 SRB2YHR041C 633 nt10.43□□□□□ -0.74
LAS17Q12446 FPR4YLR449W 1179 nt10.42□□□□□ -0.74
LAS17Q12446 EMI2YDR516C 1503 nt10.4□□□□□ -0.74
LAS17Q12446 PHO4YFR034C 939 nt10.4□□□□□ -0.74
LAS17Q12446 YJR120WYJR120W 351 nt10.37□□□□□ -0.75
LAS17Q12446 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.35□□□□□ -0.75
LAS17Q12446 YMR090WYMR090W 684 nt10.35□□□□□ -0.75
LAS17Q12446 INM2YDR287W 879 nt10.32□□□□□ -0.76
LAS17Q12446 SDH1YKL148C 1923 nt10.29□□□□□ -0.76
LAS17Q12446 YDR095CYDR095C 411 nt10.28□□□□□ -0.76
LAS17Q12446 YDL221WYDL221W 552 nt10.27□□□□□ -0.77
LAS17Q12446 YOR139CYOR139C 393 nt10.27□□□□□ -0.77
LAS17Q12446 PCH2YBR186W 1695 nt10.25□□□□□ -0.77
LAS17Q12446 WWM1YFL010C 636 nt10.25□□□□□ -0.77
LAS17Q12446 FPS1YLL043W 2010 nt10.24□□□□□ -0.77
LAS17Q12446 GUT2YIL155C 1950 nt10.23□□□□□ -0.77
LAS17Q12446 RPP2BYDR382W 333 nt10.21□□□□□ -0.77
LAS17Q12446 CAC2YML102W 1407 nt10.19□□□□□ -0.78
LAS17Q12446 MNP1YGL068W 585 nt10.18□□□□□ -0.78
LAS17Q12446 SEC11YIR022W 504 nt10.16□□□□□ -0.78
LAS17Q12446 PTP1YDL230W 1008 nt10.15□□□□□ -0.78
LAS17Q12446 HOM6YJR139C 1080 nt10.15□□□□□ -0.78
LAS17Q12446 YGR021WYGR021W 873 nt10.14□□□□□ -0.79
LAS17Q12446 NPL3YDR432W 1245 nt10.13□□□□□ -0.79
LAS17Q12446 YBL100CYBL100C 315 nt10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms