RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W IES1P43579 692 aa3.84□□□□□ -1.79
VFA1YER128W TAH11P47112 604 aa3.84□□□□□ -1.79
VFA1YER128W PXR1P53335 271 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
VFA1YER128W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
VFA1YER128W APC5Q08683 685 aa3.84□□□□□ -1.79
VFA1YER128W BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
VFA1YER128W SGT2Q12118 346 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
VFA1YER128W CEX1Q12453 761 aa3.84□□□□□ -1.79
VFA1YER128W CHD1P32657 1468 aa3.84□□□□□ -1.8
VFA1YER128W OPI1P21957 404 aa3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W KIN3P22209 435 aa3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W ROX1P25042 368 aa3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W ILV6P25605 309 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W PEX5P35056 612 aa3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W VBA5P36172 582 aa3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W YRO2P38079 344 aa3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W MUM2P38236 366 aa3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W ERP2P39704 215 aa3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W CEP3P40969 608 aa3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W BTN2P53286 410 aa3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W ESF2P53743 316 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W VPS16Q03308 798 aa3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W UBX5Q06682 500 aa3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W PSR1Q07800 427 aa3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W RIX7Q07844 837 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W YAP7Q08182 245 aa3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
VFA1YER128W MET6P05694 767 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
VFA1YER128W PWP2P25635 923 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
VFA1YER128W SEC6P32844 805 aa3.82□□□□□ -1.8
VFA1YER128W STE5P32917 917 aa3.82□□□□□ -1.8
VFA1YER128W AFR1P33304 620 aa3.82□□□□□ -1.8
VFA1YER128W EXO84P38261 753 aa3.82□□□□□ -1.8
VFA1YER128W ECM1P39715 212 aa3.82□□□□□ -1.8
VFA1YER128W NDC80P40460 691 aa3.82□□□□□ -1.8
VFA1YER128W YJL163CP46996 555 aa3.82□□□□□ -1.8
VFA1YER128W KEL2P50090 882 aa3.82□□□□□ -1.8
VFA1YER128W YKR011CQ02209 353 aa3.82□□□□□ -1.8
VFA1YER128W ORM2Q06144 216 aa3.82□□□□□ -1.8
VFA1YER128W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
VFA1YER128W ICT1Q12385 394 aa3.82□□□□□ -1.8
VFA1YER128W CDC31P06704 161 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W RAD3P06839 778 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W CLB1P24868 471 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W PUP2P32379 260 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W TIF3P34167 436 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W KDX1P36005 433 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W FLO10P36170 1169 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W YBR053CP38235 358 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W YHR078WP38799 552 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W PET100P38958 111 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W YIL166CP40445 542 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W BFA1P47113 574 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W AMA1P50082 593 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W MRPS35P53292 345 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W DSL1P53847 754 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W SHE9Q04172 456 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W YDL121CQ07541 149 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W APC2Q12440 853 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W ERP4Q12450 207 aa3.81□□□□□ -1.8
VFA1YER128W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
VFA1YER128W ARC19P33204 171 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
VFA1YER128W TOM20P35180 183 aa3.8□□□□□ -1.8
VFA1YER128W SWH1P35845 1188 aa3.8□□□□□ -1.8
VFA1YER128W BEM4P39011 633 aa3.8□□□□□ -1.8
VFA1YER128W VHR1P40522 640 aa3.8□□□□□ -1.8
VFA1YER128W IAH1P41734 238 aa3.8□□□□□ -1.8
VFA1YER128W YNL050CP53952 270 aa3.8□□□□□ -1.8
VFA1YER128W VPS60Q03390 229 aa3.8□□□□□ -1.8
VFA1YER128W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
VFA1YER128W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W CLN2P20438 545 aa3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W URA1P28272 314 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W HIR2P32480 875 aa3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W SIT1P39980 628 aa3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W OCA1P50946 238 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W SHE4P51534 789 aa3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W PUS2P53167 370 aa3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W RSC1P53236 928 aa3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W CWC24P53769 259 aa3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W YNL058CP53947 316 aa3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W HDA1P53973 706 aa3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W YML119WQ03208 357 aa3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W ATG26Q06321 1198 aa3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W ARO10Q06408 635 aa3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W PCL8Q08966 492 aa3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W SEC39Q12745 709 aa3.79□□□□□ -1.8
VFA1YER128W ECM5Q03214 1411 aa3.78□□□□□ -1.8
VFA1YER128W MMS1Q06211 1407 aa3.78□□□□□ -1.8
VFA1YER128W RAD50P12753 1312 aa3.78□□□□□ -1.8
VFA1YER128W PRP4P20053 465 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
VFA1YER128W FAR1P21268 830 aa3.78□□□□□ -1.8
VFA1YER128W COY1P34237 679 aa3.78□□□□□ -1.8
VFA1YER128W PAM1P37304 830 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
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