Protein–RNA interactions for Protein: P53743

ESF2, Pre-rRNA-processing protein ESF2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ESF2P53743 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.61■□□□□ 0.73
ESF2P53743 NSR1YGR159C 1245 nt19.38■□□□□ 0.69
ESF2P53743 NOP1YDL014W 984 nt19.18■□□□□ 0.66
ESF2P53743 YKL036CYKL036C 393 nt17.83■□□□□ 0.44
ESF2P53743 MDJ1YFL016C 1536 nt17.03■□□□□ 0.32
ESF2P53743 Q0297Q0297 156 nt16.83■□□□□ 0.28
ESF2P53743 SRX1YKL086W 384 nt16.74■□□□□ 0.27
ESF2P53743 YJL027CYJL027C 417 nt16.67■□□□□ 0.26
ESF2P53743 SCS3YGL126W 1143 nt16.29■□□□□ 0.2
ESF2P53743 YCR051WYCR051W 669 nt15.88■□□□□ 0.13
ESF2P53743 YOL085CYOL085C 342 nt15.43■□□□□ 0.06
ESF2P53743 SSA3YBL075C 1950 nt15.21■□□□□ 0.03
ESF2P53743 PKP1YIL042C 1185 nt15.14■□□□□ 0.01
ESF2P53743 DBP2YNL112W 1641 nt15.1■□□□□ 0.01
ESF2P53743 RPP1BYDL130W 321 nt15.09■□□□□ 0.01
ESF2P53743 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.02■□□□□ -0
ESF2P53743 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.02■□□□□ -0
ESF2P53743 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.02■□□□□ -0
ESF2P53743 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.02■□□□□ -0
ESF2P53743 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.02■□□□□ -0
ESF2P53743 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.02■□□□□ -0
ESF2P53743 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.02■□□□□ -0
ESF2P53743 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.02■□□□□ -0
ESF2P53743 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.02■□□□□ -0
ESF2P53743 CCC1YLR220W 969 nt14.85□□□□□ -0.03
ESF2P53743 YBR190WYBR190W 312 nt14.77□□□□□ -0.05
ESF2P53743 SCJ1YMR214W 1134 nt14.7□□□□□ -0.06
ESF2P53743 ATS1YAL020C 1002 nt14.62□□□□□ -0.07
ESF2P53743 Q0182Q0182 405 nt14.53□□□□□ -0.08
ESF2P53743 PET122YER153C 765 nt14.38□□□□□ -0.11
ESF2P53743 SCR1SCR1 522 nt14.32□□□□□ -0.12
ESF2P53743 RVS167YDR388W 1449 nt14.31□□□□□ -0.12
ESF2P53743 RTC3YHR087W 336 nt14.3□□□□□ -0.12
ESF2P53743 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.27□□□□□ -0.13
ESF2P53743 RRN5YLR141W 1092 nt13.99□□□□□ -0.17
ESF2P53743 YDJ1YNL064C 1230 nt13.83□□□□□ -0.2
ESF2P53743 SHR5YOL110W 714 nt13.83□□□□□ -0.2
ESF2P53743 PUT4YOR348C 1884 nt13.82□□□□□ -0.2
ESF2P53743 RSB1YOR049C 1065 nt13.75□□□□□ -0.21
ESF2P53743 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.71□□□□□ -0.21
ESF2P53743 MOT3YMR070W 1473 nt13.54□□□□□ -0.24
ESF2P53743 PST2YDR032C 597 nt13.51□□□□□ -0.25
ESF2P53743 GAR1YHR089C 618 nt13.45□□□□□ -0.26
ESF2P53743 ARE1YCR048W 1833 nt13.39□□□□□ -0.27
ESF2P53743 SSA1YAL005C 1929 nt13.34□□□□□ -0.27
ESF2P53743 DEP1YAL013W 1218 nt13.32□□□□□ -0.28
ESF2P53743 URN1YPR152C 1398 nt13.32□□□□□ -0.28
ESF2P53743 POA1YBR022W 534 nt13.28□□□□□ -0.28
ESF2P53743 RPN10YHR200W 807 nt13.21□□□□□ -0.29
ESF2P53743 OPI9YLR338W 858 nt13.2□□□□□ -0.3
ESF2P53743 YNL208WYNL208W 600 nt13.19□□□□□ -0.3
ESF2P53743 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.18□□□□□ -0.3
ESF2P53743 SAH1YER043C 1350 nt13.18□□□□□ -0.3
ESF2P53743 BSC6YOL137W 1494 nt13.13□□□□□ -0.31
ESF2P53743 YKL097CYKL097C 411 nt13.08□□□□□ -0.32
ESF2P53743 SPT5YML010W 3192 nt13.04□□□□□ -0.32
ESF2P53743 SSA4YER103W 1929 nt13.03□□□□□ -0.32
ESF2P53743 TIR1YER011W 765 nt13.01□□□□□ -0.33
ESF2P53743 SHU1YHL006C 453 nt12.91□□□□□ -0.34
ESF2P53743 PUN1YLR414C 792 nt12.83□□□□□ -0.36
ESF2P53743 PAC11YDR488C 1602 nt12.8□□□□□ -0.36
ESF2P53743 BUD23YCR047C 828 nt12.78□□□□□ -0.36
ESF2P53743 YJR018WYJR018W 363 nt12.72□□□□□ -0.37
ESF2P53743 BDF1YLR399C 2061 nt12.72□□□□□ -0.37
ESF2P53743 NVJ2YPR091C 2313 nt12.71□□□□□ -0.38
ESF2P53743 PTC2YER089C 1395 nt12.69□□□□□ -0.38
ESF2P53743 NAB2YGL122C 1578 nt12.66□□□□□ -0.38
ESF2P53743 FPS1YLL043W 2010 nt12.66□□□□□ -0.38
ESF2P53743 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.63□□□□□ -0.39
ESF2P53743 SRB2YHR041C 633 nt12.57□□□□□ -0.4
ESF2P53743 RPP2BYDR382W 333 nt12.54□□□□□ -0.4
ESF2P53743 TAT1YBR069C 1860 nt12.53□□□□□ -0.4
ESF2P53743 YJR120WYJR120W 351 nt12.52□□□□□ -0.41
ESF2P53743 YOR139CYOR139C 393 nt12.49□□□□□ -0.41
ESF2P53743 YGR021WYGR021W 873 nt12.48□□□□□ -0.41
ESF2P53743 WWM1YFL010C 636 nt12.44□□□□□ -0.42
ESF2P53743 FIS1YIL065C 468 nt12.42□□□□□ -0.42
ESF2P53743 MEP2YNL142W 1500 nt12.42□□□□□ -0.42
ESF2P53743 HOM6YJR139C 1080 nt12.41□□□□□ -0.42
ESF2P53743 NPL3YDR432W 1245 nt12.39□□□□□ -0.43
ESF2P53743 DAL1YIR027C 1383 nt12.39□□□□□ -0.43
ESF2P53743 MNP1YGL068W 585 nt12.34□□□□□ -0.43
ESF2P53743 YJL225CYJL225C 5277 nt12.31□□□□□ -0.44
ESF2P53743 BDH2YAL061W 1254 nt12.3□□□□□ -0.44
ESF2P53743 INM2YDR287W 879 nt12.28□□□□□ -0.44
ESF2P53743 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.28□□□□□ -0.44
ESF2P53743 YOL037CYOL037C 354 nt12.27□□□□□ -0.45
ESF2P53743 PHO4YFR034C 939 nt12.25□□□□□ -0.45
ESF2P53743 YPS1YLR120C 1710 nt12.23□□□□□ -0.45
ESF2P53743 RKM5YLR137W 1104 nt12.23□□□□□ -0.45
ESF2P53743 FPR4YLR449W 1179 nt12.22□□□□□ -0.45
ESF2P53743 LSM3YLR438C-A 270 nt12.19□□□□□ -0.46
ESF2P53743 YBL100CYBL100C 315 nt12.16□□□□□ -0.46
ESF2P53743 DCW1YKL046C 1350 nt12.14□□□□□ -0.47
ESF2P53743 YDR095CYDR095C 411 nt12.08□□□□□ -0.48
ESF2P53743 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.08□□□□□ -0.48
ESF2P53743 RPM1RPM1 483 nt12.08□□□□□ -0.48
ESF2P53743 TRM9YML014W 840 nt12.05□□□□□ -0.48
ESF2P53743 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.03□□□□□ -0.48
ESF2P53743 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.03□□□□□ -0.48
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