Protein–RNA interactions for Protein: P53167

PUS2, tRNA pseudouridine(27/28) synthase, yeastyeast

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS2P53167 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.67■■□□□ 1.06
PUS2P53167 NSR1YGR159C 1245 nt21.43■■□□□ 1.02
PUS2P53167 NOP1YDL014W 984 nt20.91■□□□□ 0.94
PUS2P53167 YKL036CYKL036C 393 nt19.3■□□□□ 0.68
PUS2P53167 MDJ1YFL016C 1536 nt19.24■□□□□ 0.67
PUS2P53167 Q0297Q0297 156 nt18.28■□□□□ 0.52
PUS2P53167 SRX1YKL086W 384 nt18.28■□□□□ 0.52
PUS2P53167 YJL027CYJL027C 417 nt18.05■□□□□ 0.48
PUS2P53167 SCS3YGL126W 1143 nt17.58■□□□□ 0.4
PUS2P53167 YCR051WYCR051W 669 nt17.45■□□□□ 0.38
PUS2P53167 DBP2YNL112W 1641 nt16.95■□□□□ 0.3
PUS2P53167 YOL085CYOL085C 342 nt16.74■□□□□ 0.27
PUS2P53167 PKP1YIL042C 1185 nt16.62■□□□□ 0.25
PUS2P53167 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.58■□□□□ 0.24
PUS2P53167 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.58■□□□□ 0.24
PUS2P53167 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.58■□□□□ 0.24
PUS2P53167 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.58■□□□□ 0.24
PUS2P53167 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.58■□□□□ 0.24
PUS2P53167 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.58■□□□□ 0.24
PUS2P53167 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.58■□□□□ 0.24
PUS2P53167 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.58■□□□□ 0.24
PUS2P53167 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.58■□□□□ 0.24
PUS2P53167 CCC1YLR220W 969 nt16.56■□□□□ 0.24
PUS2P53167 RPP1BYDL130W 321 nt16.44■□□□□ 0.22
PUS2P53167 YBR190WYBR190W 312 nt16.27■□□□□ 0.2
PUS2P53167 RTC3YHR087W 336 nt16.04■□□□□ 0.16
PUS2P53167 SCJ1YMR214W 1134 nt15.87■□□□□ 0.13
PUS2P53167 RVS167YDR388W 1449 nt15.85■□□□□ 0.13
PUS2P53167 PET122YER153C 765 nt15.79■□□□□ 0.12
PUS2P53167 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.7■□□□□ 0.1
PUS2P53167 ATS1YAL020C 1002 nt15.69■□□□□ 0.1
PUS2P53167 SCR1SCR1 522 nt15.53■□□□□ 0.08
PUS2P53167 RRN5YLR141W 1092 nt15.33■□□□□ 0.04
PUS2P53167 SHR5YOL110W 714 nt15.3■□□□□ 0.04
PUS2P53167 YDJ1YNL064C 1230 nt15.1■□□□□ 0.01
PUS2P53167 DEP1YAL013W 1218 nt15.05■□□□□ -0
PUS2P53167 RSB1YOR049C 1065 nt15.01□□□□□ -0.01
PUS2P53167 YER088W-BYER088W-B 147 nt15□□□□□ -0.01
PUS2P53167 URN1YPR152C 1398 nt14.97□□□□□ -0.01
PUS2P53167 GAR1YHR089C 618 nt14.92□□□□□ -0.02
PUS2P53167 PUT4YOR348C 1884 nt14.86□□□□□ -0.03
PUS2P53167 SAH1YER043C 1350 nt14.71□□□□□ -0.06
PUS2P53167 OPI9YLR338W 858 nt14.68□□□□□ -0.06
PUS2P53167 YNL208WYNL208W 600 nt14.65□□□□□ -0.06
PUS2P53167 RPN10YHR200W 807 nt14.63□□□□□ -0.07
PUS2P53167 ARE1YCR048W 1833 nt14.61□□□□□ -0.07
PUS2P53167 PST2YDR032C 597 nt14.52□□□□□ -0.09
PUS2P53167 POA1YBR022W 534 nt14.48□□□□□ -0.09
PUS2P53167 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.44□□□□□ -0.1
PUS2P53167 TIR1YER011W 765 nt14.37□□□□□ -0.11
PUS2P53167 YJR018WYJR018W 363 nt14.25□□□□□ -0.13
PUS2P53167 SSA1YAL005C 1929 nt14.25□□□□□ -0.13
PUS2P53167 PUN1YLR414C 792 nt14.24□□□□□ -0.13
PUS2P53167 PTC2YER089C 1395 nt14.18□□□□□ -0.14
PUS2P53167 BUD23YCR047C 828 nt14.16□□□□□ -0.14
PUS2P53167 BSC6YOL137W 1494 nt14.13□□□□□ -0.15
PUS2P53167 SRB2YHR041C 633 nt14.07□□□□□ -0.16
PUS2P53167 YJR120WYJR120W 351 nt14.05□□□□□ -0.16
PUS2P53167 SHU1YHL006C 453 nt14□□□□□ -0.17
PUS2P53167 YKL097CYKL097C 411 nt13.94□□□□□ -0.18
PUS2P53167 NAB2YGL122C 1578 nt13.92□□□□□ -0.18
PUS2P53167 RPP2BYDR382W 333 nt13.92□□□□□ -0.18
PUS2P53167 SSA3YBL075C 1950 nt13.91□□□□□ -0.18
PUS2P53167 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.91□□□□□ -0.18
PUS2P53167 FPR4YLR449W 1179 nt13.85□□□□□ -0.19
PUS2P53167 WWM1YFL010C 636 nt13.79□□□□□ -0.2
PUS2P53167 FIS1YIL065C 468 nt13.75□□□□□ -0.21
PUS2P53167 DAL1YIR027C 1383 nt13.74□□□□□ -0.21
PUS2P53167 INM2YDR287W 879 nt13.68□□□□□ -0.22
PUS2P53167 PHO4YFR034C 939 nt13.65□□□□□ -0.22
PUS2P53167 BDH2YAL061W 1254 nt13.62□□□□□ -0.23
PUS2P53167 YBL100CYBL100C 315 nt13.62□□□□□ -0.23
PUS2P53167 MNP1YGL068W 585 nt13.6□□□□□ -0.23
PUS2P53167 HOM6YJR139C 1080 nt13.56□□□□□ -0.24
PUS2P53167 YGR021WYGR021W 873 nt13.55□□□□□ -0.24
PUS2P53167 FUN26YAL022C 1554 nt13.45□□□□□ -0.26
PUS2P53167 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.44□□□□□ -0.26
PUS2P53167 YOR139CYOR139C 393 nt13.43□□□□□ -0.26
PUS2P53167 TRM9YML014W 840 nt13.41□□□□□ -0.26
PUS2P53167 LSM3YLR438C-A 270 nt13.39□□□□□ -0.27
PUS2P53167 SPT5YML010W 3192 nt13.39□□□□□ -0.27
PUS2P53167 RKM5YLR137W 1104 nt13.37□□□□□ -0.27
PUS2P53167 YPS1YLR120C 1710 nt13.36□□□□□ -0.27
PUS2P53167 NPL3YDR432W 1245 nt13.3□□□□□ -0.28
PUS2P53167 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.28□□□□□ -0.28
PUS2P53167 ALF1YNL148C 765 nt13.27□□□□□ -0.29
PUS2P53167 YDR095CYDR095C 411 nt13.25□□□□□ -0.29
PUS2P53167 CCT6YDR188W 1641 nt13.22□□□□□ -0.29
PUS2P53167 MEP2YNL142W 1500 nt13.22□□□□□ -0.29
PUS2P53167 YOL037CYOL037C 354 nt13.19□□□□□ -0.3
PUS2P53167 DCW1YKL046C 1350 nt13.1□□□□□ -0.31
PUS2P53167 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.09□□□□□ -0.31
PUS2P53167 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.09□□□□□ -0.31
PUS2P53167 SIS1YNL007C 1059 nt13.02□□□□□ -0.33
PUS2P53167 RPP2AYOL039W 321 nt13.02□□□□□ -0.33
PUS2P53167 PTP1YDL230W 1008 nt13□□□□□ -0.33
PUS2P53167 SSA4YER103W 1929 nt12.96□□□□□ -0.33
PUS2P53167 CAC2YML102W 1407 nt12.96□□□□□ -0.34
PUS2P53167 WHI5YOR083W 888 nt12.95□□□□□ -0.34
PUS2P53167 YLR281CYLR281C 468 nt12.94□□□□□ -0.34
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