Protein–RNA interactions for Protein: P38799

YHR078W, Uncharacterized protein YHR078W, yeastyeast

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR078WP38799 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.48■□□□□ 0.87
YHR078WP38799 NSR1YGR159C 1245 nt20.16■□□□□ 0.82
YHR078WP38799 NOP1YDL014W 984 nt20.08■□□□□ 0.81
YHR078WP38799 YKL036CYKL036C 393 nt18.76■□□□□ 0.59
YHR078WP38799 Q0297Q0297 156 nt17.65■□□□□ 0.42
YHR078WP38799 YJL027CYJL027C 417 nt17.56■□□□□ 0.4
YHR078WP38799 MDJ1YFL016C 1536 nt17.56■□□□□ 0.4
YHR078WP38799 SRX1YKL086W 384 nt17.52■□□□□ 0.4
YHR078WP38799 SCS3YGL126W 1143 nt17.18■□□□□ 0.34
YHR078WP38799 YCR051WYCR051W 669 nt16.64■□□□□ 0.25
YHR078WP38799 YOL085CYOL085C 342 nt16.23■□□□□ 0.19
YHR078WP38799 PKP1YIL042C 1185 nt15.91■□□□□ 0.14
YHR078WP38799 RPP1BYDL130W 321 nt15.83■□□□□ 0.12
YHR078WP38799 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.66■□□□□ 0.1
YHR078WP38799 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.66■□□□□ 0.1
YHR078WP38799 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.66■□□□□ 0.1
YHR078WP38799 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.66■□□□□ 0.1
YHR078WP38799 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.66■□□□□ 0.1
YHR078WP38799 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.66■□□□□ 0.1
YHR078WP38799 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.66■□□□□ 0.1
YHR078WP38799 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.66■□□□□ 0.1
YHR078WP38799 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.66■□□□□ 0.1
YHR078WP38799 DBP2YNL112W 1641 nt15.65■□□□□ 0.1
YHR078WP38799 SCJ1YMR214W 1134 nt15.64■□□□□ 0.09
YHR078WP38799 CCC1YLR220W 969 nt15.49■□□□□ 0.07
YHR078WP38799 ATS1YAL020C 1002 nt15.46■□□□□ 0.07
YHR078WP38799 PET122YER153C 765 nt15.06■□□□□ 0
YHR078WP38799 SCR1SCR1 522 nt15.03■□□□□ -0
YHR078WP38799 YBR190WYBR190W 312 nt14.96□□□□□ -0.01
YHR078WP38799 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.91□□□□□ -0.02
YHR078WP38799 RVS167YDR388W 1449 nt14.86□□□□□ -0.03
YHR078WP38799 RRN5YLR141W 1092 nt14.67□□□□□ -0.06
YHR078WP38799 RTC3YHR087W 336 nt14.63□□□□□ -0.07
YHR078WP38799 YDJ1YNL064C 1230 nt14.46□□□□□ -0.09
YHR078WP38799 RSB1YOR049C 1065 nt14.46□□□□□ -0.09
YHR078WP38799 SSA3YBL075C 1950 nt14.43□□□□□ -0.1
YHR078WP38799 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.38□□□□□ -0.11
YHR078WP38799 SHR5YOL110W 714 nt14.38□□□□□ -0.11
YHR078WP38799 PST2YDR032C 597 nt14.27□□□□□ -0.13
YHR078WP38799 GAR1YHR089C 618 nt14.05□□□□□ -0.16
YHR078WP38799 YKL097CYKL097C 411 nt13.87□□□□□ -0.19
YHR078WP38799 DEP1YAL013W 1218 nt13.83□□□□□ -0.2
YHR078WP38799 URN1YPR152C 1398 nt13.79□□□□□ -0.2
YHR078WP38799 RPN10YHR200W 807 nt13.71□□□□□ -0.21
YHR078WP38799 YNL208WYNL208W 600 nt13.7□□□□□ -0.22
YHR078WP38799 SHU1YHL006C 453 nt13.6□□□□□ -0.23
YHR078WP38799 TIR1YER011W 765 nt13.58□□□□□ -0.24
YHR078WP38799 PUT4YOR348C 1884 nt13.58□□□□□ -0.24
YHR078WP38799 OPI9YLR338W 858 nt13.55□□□□□ -0.24
YHR078WP38799 SAH1YER043C 1350 nt13.34□□□□□ -0.27
YHR078WP38799 SSA1YAL005C 1929 nt13.32□□□□□ -0.28
YHR078WP38799 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.28□□□□□ -0.28
YHR078WP38799 YOR139CYOR139C 393 nt13.22□□□□□ -0.29
YHR078WP38799 YJR018WYJR018W 363 nt13.19□□□□□ -0.3
YHR078WP38799 PUN1YLR414C 792 nt13.18□□□□□ -0.3
YHR078WP38799 ARE1YCR048W 1833 nt13.15□□□□□ -0.3
YHR078WP38799 NPL3YDR432W 1245 nt13.1□□□□□ -0.31
YHR078WP38799 SRB2YHR041C 633 nt13.1□□□□□ -0.31
YHR078WP38799 YGR021WYGR021W 873 nt13.07□□□□□ -0.32
YHR078WP38799 RPP2BYDR382W 333 nt13.03□□□□□ -0.32
YHR078WP38799 POA1YBR022W 534 nt13.02□□□□□ -0.33
YHR078WP38799 WWM1YFL010C 636 nt13□□□□□ -0.33
YHR078WP38799 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13□□□□□ -0.33
YHR078WP38799 HOM6YJR139C 1080 nt13□□□□□ -0.33
YHR078WP38799 YJR120WYJR120W 351 nt12.98□□□□□ -0.33
YHR078WP38799 SPT5YML010W 3192 nt12.95□□□□□ -0.34
YHR078WP38799 MNP1YGL068W 585 nt12.94□□□□□ -0.34
YHR078WP38799 PTC2YER089C 1395 nt12.93□□□□□ -0.34
YHR078WP38799 BSC6YOL137W 1494 nt12.91□□□□□ -0.34
YHR078WP38799 YOL037CYOL037C 354 nt12.91□□□□□ -0.34
YHR078WP38799 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.83□□□□□ -0.36
YHR078WP38799 RKM5YLR137W 1104 nt12.81□□□□□ -0.36
YHR078WP38799 BDH2YAL061W 1254 nt12.79□□□□□ -0.36
YHR078WP38799 SSA4YER103W 1929 nt12.77□□□□□ -0.37
YHR078WP38799 NAB2YGL122C 1578 nt12.74□□□□□ -0.37
YHR078WP38799 BUD23YCR047C 828 nt12.74□□□□□ -0.37
YHR078WP38799 INM2YDR287W 879 nt12.71□□□□□ -0.37
YHR078WP38799 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.71□□□□□ -0.37
YHR078WP38799 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.71□□□□□ -0.37
YHR078WP38799 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.71□□□□□ -0.37
YHR078WP38799 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.71□□□□□ -0.37
YHR078WP38799 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.71□□□□□ -0.37
YHR078WP38799 LSM3YLR438C-A 270 nt12.7□□□□□ -0.38
YHR078WP38799 DAL1YIR027C 1383 nt12.63□□□□□ -0.39
YHR078WP38799 YBL100CYBL100C 315 nt12.6□□□□□ -0.39
YHR078WP38799 FPR4YLR449W 1179 nt12.59□□□□□ -0.39
YHR078WP38799 YLR281CYLR281C 468 nt12.55□□□□□ -0.4
YHR078WP38799 FIS1YIL065C 468 nt12.54□□□□□ -0.4
YHR078WP38799 PUS2YGL063W 1113 nt12.53□□□□□ -0.4
YHR078WP38799 TRM9YML014W 840 nt12.52□□□□□ -0.41
YHR078WP38799 Q0182Q0182 405 nt12.51□□□□□ -0.41
YHR078WP38799 PHO4YFR034C 939 nt12.49□□□□□ -0.41
YHR078WP38799 WHI5YOR083W 888 nt12.48□□□□□ -0.41
YHR078WP38799 FUN26YAL022C 1554 nt12.46□□□□□ -0.42
YHR078WP38799 BDF1YLR399C 2061 nt12.4□□□□□ -0.42
YHR078WP38799 CCT6YDR188W 1641 nt12.36□□□□□ -0.43
YHR078WP38799 MOT3YMR070W 1473 nt12.31□□□□□ -0.44
YHR078WP38799 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.27□□□□□ -0.45
YHR078WP38799 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.27□□□□□ -0.45
YHR078WP38799 IMP2'YIL154C 1041 nt12.27□□□□□ -0.45
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