RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	ANP1	P32629	500 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	MAL31	P38156	614 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	RRM3	P38766	723 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	YER130C	P39959	443 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	ALG2	P43636	503 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	MSN5	P52918	1224 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	CAF120	P53836	1060 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	TFC6	Q06339	672 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	ATE1	P16639	503 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	GSM1	P42950	618 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	YPT11	P48559	417 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	CTR9	P89105	1077 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	ESC2	Q06340	456 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	YPL260W	Q08977	551 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	FAR11	P53917	953 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	HDA1	P53973	706 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	SSL2	Q00578	843 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	TOS4	Q06266	489 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	GRX6	Q12438	231 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	CYC8	P14922	966 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	MIP1	P15801	1254 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	MAK31	P23059	88 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	RIT1	P23796	513 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	YKL222C	P35995	705 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	MYO3	P36006	1272 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	VID27	P40157	782 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	APL6	P46682	809 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	GDE1	Q02979	1223 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	MCM16	Q12262	181 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	RAD61	Q99359	647 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	SNF3	P10870	884 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	GUT2	P32191	649 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	YHL050C	P38721	697 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	EMP47	P43555	445 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	LSC2	P53312	427 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	DCS2	Q12123	353 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	CDC6	P09119	513 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	GSY2	P27472	705 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	ASF1	P32447	279 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	YKU70	P32807	602 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	MKS1	P34072	584 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	RXT2	P38255	430 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	VPS8	P39702	1274 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	CSM2	P40465	213 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	SCW11	P53189	542 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	TIM50	Q02776	476 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	CEX1	Q12453	761 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	YOR111W	Q99210	232 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	ERT1	P38140	529 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	FYV10	P40492	516 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	PCI8	P40512	444 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	YJR098C	P47139	656 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
MIA40	YKL195W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	RTC4	P53850	401 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	DFG5	Q05031	458 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	FRA1	Q07825	749 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	CIT1	P00890	479 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	CTT1	P06115	562 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	CAB3	P36076	571 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	YIR007W	P40566	764 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	EAF6	P47128	113 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24

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