Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

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Length 1,223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.36■■□□□ 1.33
GDE1Q02979 NSR1YGR159C 1245 nt23.19■■□□□ 1.3
GDE1Q02979 NOP1YDL014W 984 nt22.69■■□□□ 1.22
GDE1Q02979 YKL036CYKL036C 393 nt20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q02979 MDJ1YFL016C 1536 nt20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q02979 Q0297Q0297 156 nt19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q02979 SRX1YKL086W 384 nt19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q02979 YJL027CYJL027C 417 nt19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q02979 SCS3YGL126W 1143 nt19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q02979 YCR051WYCR051W 669 nt18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q02979 DBP2YNL112W 1641 nt18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q02979 YOL085CYOL085C 342 nt18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q02979 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q02979 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q02979 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q02979 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q02979 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q02979 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q02979 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q02979 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q02979 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.92■□□□□ 0.46
GDE1Q02979 PKP1YIL042C 1185 nt17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q02979 RPP1BYDL130W 321 nt17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q02979 CCC1YLR220W 969 nt17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q02979 YBR190WYBR190W 312 nt17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q02979 RTC3YHR087W 336 nt17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q02979 RVS167YDR388W 1449 nt17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q02979 SCJ1YMR214W 1134 nt17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q02979 PET122YER153C 765 nt17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q02979 ATS1YAL020C 1002 nt17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q02979 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q02979 SCR1SCR1 522 nt16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q02979 SHR5YOL110W 714 nt16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q02979 RRN5YLR141W 1092 nt16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q02979 YDJ1YNL064C 1230 nt16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q02979 RSB1YOR049C 1065 nt16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q02979 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q02979 DEP1YAL013W 1218 nt16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q02979 URN1YPR152C 1398 nt16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q02979 GAR1YHR089C 618 nt16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q02979 PUT4YOR348C 1884 nt15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q02979 RPN10YHR200W 807 nt15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q02979 OPI9YLR338W 858 nt15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q02979 YNL208WYNL208W 600 nt15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q02979 SAH1YER043C 1350 nt15.76■□□□□ 0.11
GDE1Q02979 PST2YDR032C 597 nt15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q02979 ARE1YCR048W 1833 nt15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q02979 TIR1YER011W 765 nt15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q02979 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q02979 POA1YBR022W 534 nt15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q02979 PUN1YLR414C 792 nt15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q02979 YJR018WYJR018W 363 nt15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q02979 SSA1YAL005C 1929 nt15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q02979 YKL097CYKL097C 411 nt15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q02979 PTC2YER089C 1395 nt15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q02979 BUD23YCR047C 828 nt15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q02979 BSC6YOL137W 1494 nt15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q02979 SHU1YHL006C 453 nt15.11■□□□□ 0.01
GDE1Q02979 YJR120WYJR120W 351 nt15.08■□□□□ 0
GDE1Q02979 RPP2BYDR382W 333 nt15.06■□□□□ 0
GDE1Q02979 SRB2YHR041C 633 nt15.04■□□□□ -0
GDE1Q02979 NAB2YGL122C 1578 nt15.01□□□□□ -0.01
GDE1Q02979 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.9□□□□□ -0.02
GDE1Q02979 WWM1YFL010C 636 nt14.82□□□□□ -0.04
GDE1Q02979 Q0182Q0182 405 nt14.82□□□□□ -0.04
GDE1Q02979 FPR4YLR449W 1179 nt14.82□□□□□ -0.04
GDE1Q02979 DAL1YIR027C 1383 nt14.82□□□□□ -0.04
GDE1Q02979 INM2YDR287W 879 nt14.8□□□□□ -0.04
GDE1Q02979 FIS1YIL065C 468 nt14.8□□□□□ -0.04
GDE1Q02979 SSA3YBL075C 1950 nt14.8□□□□□ -0.04
GDE1Q02979 YGR021WYGR021W 873 nt14.73□□□□□ -0.05
GDE1Q02979 BDH2YAL061W 1254 nt14.73□□□□□ -0.05
GDE1Q02979 PHO4YFR034C 939 nt14.68□□□□□ -0.06
GDE1Q02979 HOM6YJR139C 1080 nt14.67□□□□□ -0.06
GDE1Q02979 YBL100CYBL100C 315 nt14.67□□□□□ -0.06
GDE1Q02979 MNP1YGL068W 585 nt14.62□□□□□ -0.07
GDE1Q02979 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.58□□□□□ -0.08
GDE1Q02979 YOR139CYOR139C 393 nt14.58□□□□□ -0.08
GDE1Q02979 LSM3YLR438C-A 270 nt14.53□□□□□ -0.08
GDE1Q02979 FUN26YAL022C 1554 nt14.49□□□□□ -0.09
GDE1Q02979 TRM9YML014W 840 nt14.47□□□□□ -0.09
GDE1Q02979 RKM5YLR137W 1104 nt14.46□□□□□ -0.09
GDE1Q02979 NPL3YDR432W 1245 nt14.43□□□□□ -0.1
GDE1Q02979 MOT3YMR070W 1473 nt14.43□□□□□ -0.1
GDE1Q02979 YPS1YLR120C 1710 nt14.38□□□□□ -0.11
GDE1Q02979 YOL037CYOL037C 354 nt14.36□□□□□ -0.11
GDE1Q02979 ALF1YNL148C 765 nt14.32□□□□□ -0.12
GDE1Q02979 SPT5YML010W 3192 nt14.31□□□□□ -0.12
GDE1Q02979 YDR095CYDR095C 411 nt14.3□□□□□ -0.12
GDE1Q02979 CCT6YDR188W 1641 nt14.3□□□□□ -0.12
GDE1Q02979 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.26□□□□□ -0.13
GDE1Q02979 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.21□□□□□ -0.13
GDE1Q02979 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.21□□□□□ -0.13
GDE1Q02979 MEP2YNL142W 1500 nt14.19□□□□□ -0.14
GDE1Q02979 SIS1YNL007C 1059 nt14.05□□□□□ -0.16
GDE1Q02979 RPP2AYOL039W 321 nt14.04□□□□□ -0.16
GDE1Q02979 YLR281CYLR281C 468 nt14.01□□□□□ -0.17
GDE1Q02979 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14□□□□□ -0.17
GDE1Q02979 IMT4tM(CAU)E 72 nt14□□□□□ -0.17
GDE1Q02979 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14□□□□□ -0.17
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